Jeotgalibaca arthritidis: G7057_01890
Help
Entry
G7057_01890 CDS
T06477
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
jar
Jeotgalibaca arthritidis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
KH_6
SWIM
CID
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QII81347
UniProt:
A0A6G7K7X9
LinkDB
All DBs
Position
complement(389198..392464)
Genome browser
AA seq
1088 aa
AA seq
DB search
MKWKLVSEEVIREAALSDSAIRFGRRIYREQAFRNIVLTEMHDVIELSAYVDQECQVKIR
LNTTEKLQLKCACQKHSDHLACKHSIALLYLYNDIIKDAQKRQGFSKKVGSLTYSVNSRK
YVAAKYIMEQMSDFLDAQTGFRGRKKIVFDYQFAFRSLENDDESSVRIKVGEDKLYQMRD
IEAVALSFLKEQPMMFGKSFTYDPAEHYIDSKDRDMLYFLLEIKNYQFQNQLYRQYTATN
KSEIDIQPALIKRTLEKITLMSHYTIKINHRDSEQERLNDPVLFEEGELLLPVPFQMAEL
EDEPDHFHFSLIDPEANMFYLFPTQKVLIQRNDIFFLTDEEIRMLTILANALSENEDHHV
IIPKSMMKDFLTTSLPSLSKRFPITLSETVKQSFKKERLLPKLYLDWTTDHLIVDLEFHY
GDYVYHPTTVFNEEEGLPDSVVLDLEGEGRVLNLLYSFDFDFEFEDQHMLLSDFDEVYRF
LYEALPEFSQLMDVYTSSSFDHLLYNSPSHAQLVVDMDRESNLLQVTFDMEGIDDSELKK
IMQDLIANKKYRRLSNGKLVNLQDRAFQEYQSILQKMDIRTSKIKKEMALPLHKLFSIDD
DVLERSELKENIMTFLNQMTTVDSQDYQLPHSLVADLRPYQVEGYQWLRTLDEFGFGGIL
ADDMGLGKTVQSLAFIASLIESQDKPILVVCPSSVLYNWKKESQQFIPDVPTILITGNKE
ERQQQIKYAKEQAIPLWITSYPVLIRDVADYSDTLFRTVILDEAQIVKNNTAKTTKAVKD
LQSVNKFALSGTPLENQLGELYSIFSIAVPGLLGTKKAFKEMPIADINRRISPFLLRRLK
KNVLKELPEKFETIEYIDFSEEQKALYLSQLALVRDEANAFMAEGQLAENKIRILAGLTR
LRQICCDPRLVMPNYEGESAKLLRLLEYLETAKENGNRVVLFSQFTQMLALIQDELVKLG
YDYFYLDGKTPNEERLALTTRFNEGEKDLFLISLKAGGTGLNLTGGDTVILYDSWWNPAV
ESQATDRVHRFGQKNVVQVIRMICGGTIEERISELQDKKRQLIDQVISDEQQSLTSLSKE
ELMAILSE
NT seq
3267 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatggaagttagtgagtgaagaagttataagggaagcagctttgtctgattctgct
attcgttttggtagacgcatttaccgagaacaagcctttcgtaacattgtcttaacggaa
atgcatgatgtgattgaactatcagcttatgttgaccaagaatgccaagtcaaaatacgc
ttgaatacgactgaaaagttacagttgaagtgtgcgtgtcaaaaacactcagatcatttg
gcttgtaagcatagcatagccttgctatacctttacaatgatattatcaaagatgcccaa
aaacggcagggattttcgaaaaaagtaggttcattgacttatagcgtcaatagccggaaa
tatgtggcagcaaagtatattatggaacaaatgtctgatttcttagatgcccaaacaggc
ttcagaggacgtaaaaaaattgtttttgattatcagtttgcctttcgatcgctagaaaat
gatgatgagagctcagtaagaataaaagttggtgaagacaaactttatcaaatgagggat
attgaagcagtagccttatcttttttaaaagaacagcctatgatgtttggtaaatcattt
acttatgatcccgccgaacattatattgatagtaaagacagggatatgctgtatttctta
ttggagattaaaaactatcaatttcaaaatcaactctaccgccaatatacggcgactaat
aaaagtgaaattgatattcagccagctctaattaaacgaaccttagaaaaaataaccctt
atgagccactacaccattaaaataaaccatcgtgactctgaacaagaacggttaaacgat
cctgttttatttgaagaaggcgaattgttattacctgttccttttcagatggcagagctt
gaagatgagccagaccattttcatttttcattaattgatccggaagctaatatgttttat
cttttcccgacccaaaaagtattgattcagcgcaatgatattttcttcttaacagatgaa
gaaattcggatgctgacgattttagcgaatgctttgtcagaaaacgaagatcaccatgtg
attattcctaagtctatgatgaaagactttttgacaacctcattgccgtctttatcaaaa
cgatttccaattacattatcagagaccgttaaacagagctttaaaaaggaacggctacta
ccgaaactctacttggattggacgactgatcatttaattgttgatcttgaatttcactat
ggtgattatgtttaccatccaacaactgtttttaacgaggaagaagggttacctgattca
gttgtattggatttagaaggagaaggccgtgttttaaatttgctatatagttttgatttt
gattttgaatttgaagaccagcatatgttactttctgatttcgatgaagtctaccgcttc
ctttacgaagcattacccgaatttagtcaactgatggatgtatatacatcgtcaagtttt
gatcatttactttataactcaccaagtcacgctcaacttgtcgttgatatggatagggaa
tccaatctcttgcaagtcacttttgacatggaaggaattgacgatagtgaattaaagaaa
atcatgcaagatttgatcgctaataaaaaataccgacgcctatcgaatgggaagttagtc
aatttacaggaccgtgcgttccaagaatatcagtctattttacagaaaatggatattcga
accagtaaaataaaaaaagaaatggcacttcctttgcataagctcttttctattgacgat
gatgttttagagcggtctgaattaaaagagaatattatgaccttcttaaatcaaatgacc
actgttgatagtcaagattaccaactaccgcactcacttgtagcggatttaagaccctac
caagtggaaggttatcaatggttacgaactttggatgagtttggttttggtggtatttta
gctgatgatatgggattagggaaaaccgttcaatcactggcatttattgcctctttaatt
gaatcacaggacaagcctattctcgttgtttgtccatcgagtgttctttacaattggaaa
aaagaaagtcagcaatttatcccagatgtgccgacgatactcataacaggaaataaagaa
gaacgtcagcaacaaattaaatacgcgaaagagcaagcaatcccattgtggattacctcc
tatcctgttttaattcgtgatgtagctgattatagcgataccctgtttcgaactgttatt
ttagatgaggctcaaatcgttaaaaataataccgccaaaacaactaaagcggtgaaagac
ttacagtcggttaataagtttgctttaagtggaacgcctttagaaaatcaactaggagag
ctatattcgatcttctcaattgcagtaccgggtttattaggaacaaaaaaagcctttaag
gaaatgccgatagccgatattaaccgtcgcattagtccgtttctactgagacgactgaag
aaaaatgtgctaaaagaactgccagaaaaatttgaaacgattgaatacattgactttagt
gaagaacaaaaagctctgtatttatcgcaattagccttagtccgagatgaagctaatgct
tttatggctgaagggcagttggcagaaaataaaatcagaattttggcaggcttaacaaga
ctcagacaaatttgctgtgacccaagattagttatgccaaactacgagggagaatcagcc
aaattactgagactacttgagtatttagaaaccgctaaagaaaatggtaaccgagtcgtc
ttgttctcgcagtttactcaaatgttagctttaatccaagatgagctagttaaattagga
tatgattatttctatttagatggcaaaacaccaaatgaagagcgtttagctttgacgacc
cgtttcaatgaaggggaaaaagacctattccttatttcattaaaagctggtggaacgggc
ctcaatttgacgggtggcgatacagttattctatatgatagctggtggaatcctgctgta
gaaagccaagcgaccgaccgtgtccatcgctttggacaaaagaatgtcgttcaggtgatt
cgaatgatttgtggcggcacgattgaagaacgtattagtgaacttcaagataagaaacgc
caattaatcgatcaagttatttccgatgagcaacaatcactgacttcgttaagtaaagag
gaattaatggctatactaagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
