Jatropha curcas (Barbados nut): 105639549
Help
Entry
105639549 CDS
T03922
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
jcu
Jatropha curcas (Barbados nut)
Pathway
jcu03015
mRNA surveillance pathway
jcu03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
jcu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
105639549
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
105639549
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
jcu03041
]
105639549
Spliceosome [BR:
jcu03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
105639549
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105639549
NCBI-ProteinID:
XP_012079018
UniProt:
A0A067LEZ9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
477 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQEGDSAPPSYGGGGPGGYGGGYGGSGGGGGYGGGASAGGYGGDGGYGGGGGGRG
GYSGRGGGGGGRGYGGNSQNRGGGGGYQGGDRGGRGGGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNS
SCGNLNFARRSECNKCGTPSPAGSNNDRSGGGYNKGGSGGGYGGNRGGRGGNYDGNRSSN
YNEGGRGGSYDNRSGGGNRGGSYGGNSGRDNGGYNQMPPAVPSYGSAGGGANYPPPPNSY
GGNTNYGMDAVPPPTSYTGGPTAYPPSYGGPAGGYSGGDVTTDVRSGGRGGQHGGYGAGG
GPRYEGGGGQSGAHASDAAAKIKQCDGNCDETCDNSRIYISNLPPDVTTDELRDLFSGIG
QVGRIKQKRGFKDQWPWNIKLYTDENGNNKGDGVLSYEDPSAAHAAGGFFNNHDIRGYKI
SVAMAEKSAPRQPPSYDHSRGGGRGGYGGGDRRRDTYRDGGSGPDRHYHGGNRSRPY
NT seq
1434 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggaatgtacggtcaagaaggcgattctgctcctccatcttacggtggaggtggc
cctggcggatatggaggtggctatggtggcagcggtggaggaggaggatatggaggagga
gcaagtgctggaggctatggaggtgatggtggatatggcggtggtggaggcggccgtgga
ggttatagtggtcgaggtggtggcggaggtggtagaggatatggtggtaattcgcaaaat
cgtggaggtggtggaggatatcaaggaggagatcgtggaggaagaggcggcggcggtggt
ggccgaggaggtggccgaggtggaagtggaagagacggtgattggctatgccctaactcg
agctgtggaaatttgaacttcgctagaagatctgaatgtaacaaatgtggcactccttct
cctgctggttctaacaatgatcgcagtggcggaggttataacaaaggaggaagtggtgga
ggatacggtggtaacagaggaggtagaggtggtaactatgatggaaatagaagtagcaat
tacaatgaagggggccgaggaggtagttatgataataggagtggaggtggcaatagaggg
ggctcctatggtggtaattctggaagagacaatggtggctataaccagatgcctcctgca
gtaccgtcgtatggtagtgctggaggtggagctaattatccaccacctcctaactcatat
ggggggaacactaattatggaatggatgcagttcctcctcctacaagttatacaggtgga
cctacagcttatcctccatcttatggtggtcctgctggtggttacagtggtggtgatgtt
acaactgatgttagaagtggtgggcgaggtggccaacacgggggatatggtgctggcggt
ggtcctcgttatgaaggaggtggtggacaaagtggtgctcatgcttctgatgccgcagct
aaaattaagcagtgtgatggaaattgtgatgagacatgtgacaactcgagaatatacata
tcaaatttgccacctgacgtgactactgatgaactgagagacctttttagtggcattgga
caagttggaaggattaagcagaagcgtggttttaaagaccaatggccttggaatataaaa
ttgtacacagatgagaatggaaacaacaaaggcgatggagtattgtcttatgaagatcca
agtgctgcacatgctgctggcggtttctttaacaatcatgatataaggggttataaaatc
agtgttgccatggcagagaaatcagcaccaaggcagccaccttcctatgaccacagcaga
gggggcggtagaggtggctatggtggaggtgatcggcgcagagatacttatagagatgga
ggctctggtccagataggcactaccatggtggaaaccgatcacgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
