Jatropha curcas (Barbados nut): 105644480
Help
Entry
105644480 CDS
T03922
Name
(RefSeq) pre-mRNA-processing factor 39 isoform X1
KO
K13217
pre-mRNA-processing factor 39
Organism
jcu
Jatropha curcas (Barbados nut)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
jcu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
jcu03041
]
105644480
Spliceosome [BR:
jcu03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
Other SAPs
105644480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_PRP39_N
HAT_PRP39_C
Suf
TPR_14
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_Syf1_CNRKL1_C
TPR_19
NRDE-2
TPR_12
TPR_MalT
TPR_16
UTP6_C
DNAX_ATPase_lid
TPR_10
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105644480
NCBI-ProteinID:
XP_012085230
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
839 aa
AA seq
DB search
MGDSEMVVTETSTVTDYASAGYVSTGYGDTGSNLVPDSAVYTAEGTGAFAASADAAYSAA
AAANFADANAYGAESNSTVQGAHVDATYEAKTDDGMGVASDNVGATENTSVMPSQAAAYD
SSINGNIGGEAGSVTLAENGTAVDVAGEADSSVDGSVTPMSSEEERLWSIVRANSLDFDA
WTALIDETEKVAGDKISKIRKVYDAFMAEFPLCYGYWKKYADHEARVGSMDKVLEVYERA
VMGVTYSVDIWLHYCVFAINTYEDPETIRRLFERGLAYVGTDYLSYPLWDKYIEYEEMHS
QWSHVAMIYTRILEIPNKRLDDYFNRFKAFCSSHPLSELRTVEEAAASVPATSEVGGQAN
GGEVLPDAAEQSSKPVSAGLTEAEELEKYIAIREEIYKKAKEFDSKICDFENAIRRPYFH
VRPLNVAELENWHNYLDFIEREDDLNKVVKLYERCLIACANYPEYWVRYVLCMETCGSMD
LANNALARATQVFVKRQPEIHLFAARFREQSGDIPGARAAYQLVHSEIAPGLLEAVVKHA
NMEHRLGNLKDAFSLYEQAIAIEKGKEHSQVLPMLYAQYSRFVYLVSGNAEKAREILVEA
LENAPLSKPLLEAFIYHESIQSLPKRIDYIDSLVDKFIAPNSDSLNSASVADKEEISCIF
LEFLGMFGDVQSIKKADDRHAKLFLPHRSKSELKKRHAEDYLASDKTKLAKSYADASSPA
QSLMGAYPTAQNQWTASYGVQPQAWQNVTQAPVQQFNPGYGQQAAYNTATYGYGSSYTSP
QVPTSVAQTATYGAYPPTYPVQQAAFPQQSYAQPAAAAATLAPTQQPTSVPQPYYGSYY
NT seq
2520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagacagtgagatggtcgttactgaaacatctacagtcactgattatgcatcagct
ggatatgtttctactggttatggtgatacaggttcaaaccttgttcctgattctgctgtt
tataccgctgagggcacaggagcttttgctgcttctgctgatgcagcttatagtgcggca
gctgctgctaattttgccgatgcaaatgcatatggtgcagaatctaattctactgtacaa
ggggcccatgttgatgcaacgtatgaggccaagacagatgatggaatgggtgttgccagt
gataatgttggtgcaacggagaatacatctgtgatgccatcccaagctgctgcttatgat
tcttctataaatggcaatattggtggtgaagcaggaagtgtaacattggctgagaatggt
actgctgtagatgttgcaggggaagctgattcttccgtggatggttctgtgacaccaatg
tccagtgaagaggagcgattgtggagcattgtgagggctaattccttggattttgatgca
tggactgccttgattgatgagacagagaaggtggcaggggataagatatcgaaaattcga
aaagtatatgatgcattcatggctgaattcccattgtgctatggttattggaagaagtat
gcagatcatgaggcacgtgttggttctatggacaaagttctggaggtatatgagcgagct
gtcatgggggtgacatactctgtggacatttggttgcactattgtgtatttgccataaat
acatatgaagatccagagaccattagaaggctattcgagcgtggcttagcttatgttgga
acagattatctgtcttaccctctttgggataagtacattgaatatgaagaaatgcattca
cagtggagccatgttgccatgatttacacaaggatattagagattccaaataaacgtttg
gatgattatttcaatagatttaaagctttttgttcaagtcacccgctgtcggaattaaga
actgttgaggaagctgctgcttctgttcctgctacttcagaggttggtggacaagcaaat
gggggagaagttcttcctgatgctgctgaacaatcttctaaacctgtaagtgcgggctta
acagaagctgaggagttggagaagtatatcgccattagagaagagatatataagaaagct
aaagagttcgattctaagatatgtgattttgaaaatgctattaggaggccttactttcac
gtgcggcccctcaatgttgcagagcttgaaaattggcacaactatctggattttatagaa
agagaagatgatttgaacaaggtggtcaagttatatgaaagatgcctaattgcttgcgcc
aattatcctgagtattgggtacgttatgttttgtgcatggaaacatgtggaagtatggat
cttgctaataatgcacttgctcgtgcaactcaagtatttgtaaagagacaaccagagatt
cacctttttgctgcccggtttagagagcagagtggagatatacctggtgcccgggctgca
taccaacttgtacactctgaaattgctcctggtcttcttgaagctgttgttaagcatgca
aacatggaacatcggctggggaatctcaaagatgccttctctttgtatgaacaggccata
gccattgaaaaaggaaaagagcattcacaggtgttgccaatgttatatgcacaatactct
cggtttgtatatttggtttctggaaatgcagaaaaggctagagagattctagttgaagca
cttgagaatgccccattgtcaaaaccacttcttgaggcttttatatatcacgagtcaatt
cagtcactgccaaagcgaattgattatatagattcattagttgacaagtttatagcaccc
aactcagatagcctcaattctgcaagtgttgctgataaagaagagatatcttgcattttc
ttggagtttttgggtatgtttggagatgttcaatctattaagaaggctgatgatcgacat
gccaagctcttcttaccccacaggagcaagtctgaattaaaaaagcgtcatgcagaggat
tatctagcttcagataaaacaaaattagcaaaatcttacgctgatgcttcttcacccgca
cagtcacttatgggtgcatatccaactgcacaaaatcagtggacggcaagttatggtgta
caacctcaagcttggcagaatgttacgcaagcaccggtacaacaatttaaccctggctat
ggccaacaggctgcatacaatacagctacttatggttatggaagcagctatactagcccg
caagtacctacttctgttgcacaaacagctacttatggtgcttatcctccgacatatcct
gtccagcaggctgctttccctcaacagagttatgcacaacctgctgctgcagcagcaaca
ttggccccaactcagcagccaacttcagtgccacagccatattatgggagctactactga
DBGET
integrated database retrieval system
