Candidatus Jettenia sp.: L3J17_11650
Help
Entry
L3J17_11650 CDS
T07848
Name
(GenBank) SemiSWEET family transporter
Organism
jet
Candidatus Jettenia sp.
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_9
PAS
dCache_1
PAS_4
PAS_8
HAMP
PAS_3
PQ-loop
MtN3_slv
MEKHLA
Clathrin
Cache_3-Cache_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJS16561
LinkDB
All DBs
Position
2697363..2699549
Genome browser
AA seq
728 aa
AA seq
DB search
MIWFLIGVIAAICSSIGFIPQIIQGIKTKSLSDVSPAMMTIVVVASSLWLAYGIHIKNST
IIFSNVSTLSFAVITLLLRFLFKPEFAQLKRKLLSISIKNRLILLLITFTLLPFVLLRIL
AYPRIQADVQDVLIRNLEGIVHKQAELVTNWIYERVKNARVIADNPLIAKGTEITKEDKD
YPDIVQYLEEIKNEYGYKGIMMSNNKGLVTVATSGESVGRDILQTDYFHGAMQGDSFVSS
IVPSEIPLINEYAEEELGIPTMFVSTPLKDKGGNITGVVALRIDVSRLNDVMLSLNLGKT
GKTYLVNKDGYMVTESRFAGYLRDMGLIKKRCALELKVIDRETGKVTQGVQQCISGNNGF
DAQGYKDYSDVTVLSAWRWLPKFHWGIIAEIDKDEGYGVAYNLNYIVWGVLLTLAFPFVM
VAYLVGRKLSIPILTLTEVIKKMASGDLAQRVDIQREDELGELASSFNVMAKSLDEKTKE
IIISEKRYREIFNSIKEGVYQSEPGAEGVFTFINKAGAEILGYSTPEEVIGMKVKNIYVD
TADRNRLCGKLEKDGVWREFVSLCKRKSGESFYAERTSSMLRDEKGNPAAIYGVFRDISE
RKKVEMEVIESEKRYRLLFDSLKEGVYQSEPEVDGVFTWINQAGAEMLGYKSPEEVIGLK
VKDVYVNPDDRKELIDTLEKDGIWRSFISYCRRKNGERFISESTCNLVRDEDGKPARIDG
ILRDITER
NT seq
2187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatggtttttaataggagtgattgctgcaatctgctcatcaataggatttatacca
caaatcattcagggtataaaaactaaatcattgtctgatgtttcgccagccatgatgacc
attgtagtagtagcaagcagtttgtggttagcctatggaatccacataaaaaattctacc
attatattttcaaatgtatctacgctctcatttgctgtaataacccttttattgcgtttt
ttatttaaacctgagtttgctcaattaaagagaaaattactatcaatttcaattaaaaac
cggcttattctattgctcatcacttttacgctgttgccattcgttttactgaggatttta
gcgtatccaagaatacaggctgatgttcaggatgtgttgatacggaatctcgagggtatt
gtccataaacaggctgaattggtaacgaactggatatatgagagggtaaagaatgcgcgt
gtaattgcagacaatcccctcatagcaaagggtacggagattactaaagaggataaggat
tatcctgatattgttcaatatcttgaagaaattaagaatgaatatgggtataaagggata
atgatgagtaataataagggattagtaactgttgctacctcaggagagagtgttggaagg
gatatcctgcaaactgattattttcatggagcaatgcaaggagattcatttgtatcaagt
attgttccatcagagatcccccttatcaatgaatacgcagaagaagaactgggtatccct
acgatgtttgtttcaacaccattgaaagataaaggggggaatatcactggcgttgttgca
ttgaggatcgatgtatccaggctgaacgatgtaatgttaagccttaatctagggaagaca
gggaaaacgtatcttgtcaacaaagatggatacatggttactgaatcaaggtttgcagga
tatctcagagatatgggattaataaaaaagagatgtgcgctagaattgaaggtgattgat
cgggaaacgggtaaagtaactcaaggtgttcaacagtgcatttcaggcaataacggcttt
gatgcacagggctataaggattatagcgatgtaaccgtgttaagtgcatggcgctggttg
cctaagtttcattggggtattatagcagaaatcgacaaagatgaaggatacggagtcgct
tataacctgaattatattgtatggggtgtgctcttaactcttgcatttccctttgttatg
gtagcataccttgtggggaggaagctttcaatacctattcttactttaaccgaagtaatc
aagaagatggcatcaggagatttagcacaacgggtagacatccagagagaagatgaactg
ggtgaattggcaagttcatttaatgttatggcaaaatcccttgatgagaagacaaaagag
atcatcatttctgagaagagataccgggagatctttaactcgattaaagaaggggtgtat
cagtcagagccaggagcggaaggagtctttacgtttatcaacaaggcaggggcagagatc
ttgggatacagcacgccggaagaggtaatcggaatgaaggtaaaaaatatctatgtagat
acggcagaccggaatcggttgtgtgggaaactggagaaggatggggtctggagagagttt
gtatcgctgtgtaagaggaaaagcggtgagagtttctatgcagagcgtacgagcagtatg
ctgagggatgagaaaggcaatccggcagctatttatggagtattccgggatatttccgag
aggaagaaggtagagatggaggtcatagagtcagagaagagataccggttattatttgat
tcactgaaggaaggggtatatcaatccgagccggaggtggatggggtatttacctggatt
aatcaggcaggggcagagatgcttggctataaatctccagaagaagtgattggacttaag
gtaaaggatgtttatgtaaatccggatgaccggaaagaattaattgataccctggaaaag
gatggtatatggagaagttttatctcatattgcaggaggaaaaatggtgaacggtttatt
tccgaaagcacttgtaatctggtacgtgatgaggatggtaagccggcaagaattgatggt
atacttagagatataacggaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system