Juglans regia (English walnut): 108981229
Help
Entry
108981229 CDS
T05245
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
jre
Juglans regia (English walnut)
Pathway
jre03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
jre00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
108981229
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
jre03019
]
108981229
Messenger RNA biogenesis [BR:
jre03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
108981229
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108981229
NCBI-ProteinID:
XP_018807889
UniProt:
A0A2I4DL60
A0A833TR48
LinkDB
All DBs
Position
12:23511768..23515310
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKDYFENYGDVMQTVVMRDKTTGRPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDNHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSAKAGNPSLARSSGGGGTFRTKKIFVGGLPAT
LSEEGFRQHFETYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDTEEAVDRVLHKNFHDLDGKQV
EVKRALPKDANPGGGSRTMGGGAGGGGSLGSGYQNYGASGGNPNAYDGRMESNRYMQPQS
TGGGFGPYGSSAYSTPGYGYGPANNGISYGGYAGANTGYGGPAGAAYGNPNVPSAGFGSG
PPGAPRSSWNTQSPTGYGALGYGNTAAWGAPTGSTGAPSGGPGSAPTGQSPSGATGYGNQ
SYGYGGYGGSDGSYGNPGGYGAVGGRSGSVPNNNAGGPGGGDMQGSGYMGSGYGDANGNP
GYGNAAWRSEQSQTSGNYGAPQGNGPHGGQVAYGSGYASAQARTQQQ
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctattcataggtgggatctcgtgggagactacggaggag
aagctgaaggattactttgagaactacggagacgtgatgcagactgtggttatgagggac
aagactactggcaggcccaggggtttcggcttcgtggtctttgcagatccttccgttctc
gatagggttctccaggacaaccacaccattgatggcagaacggttgaggctaagagggca
ttatcgagagaggagcagcaaacttctgccaaagctgggaatcctagtctagctagaagt
tctgggggtggtggaactttcagaaccaagaagatatttgttggaggattgcctgccact
ctaagtgaagaaggatttcgtcagcattttgagacttatggccatgtaaccgatgtagta
gtcatgtatgaccagaatactggacgacctcgcgggtttgggtttattacctttgacact
gaagaagctgttgatagagttttacacaaaaacttccatgatttagatggtaagcaagta
gaagtaaagcgggctcttcctaaagatgcgaatcctggtgggggtagccgtacaatgggt
ggtggtgctggtggtgggggttcacttggtagtggttatcagaactatggggcatctggt
ggtaacccgaatgcatatgatggtcgaatggaatccaataggtacatgcagccacagagt
actggaggtggttttggtccatatggctcctctgcatatagcacacctggctatggatat
ggtcctgccaataatggtattagttatggtggttatgctggtgccaatactgggtatggt
ggacctgccggtgcagcatatggaaacccaaatgttcctagtgctggctttggaagtggt
ccaccaggcgctcccagaagttcatggaacactcaatctcctactggatatggtgctctg
ggttatggtaatactgctgcttggggtgctccaactggaagcactggtgctcctagtggt
ggcccaggctcagcacctacaggccagtcacctagtggggccactgggtatgggaatcaa
agttatggctatggtggttatggtgggagtgatgggtcttatgggaatcctggtggatat
ggtgctgttggagggcgttctgggagtgtgccaaataacaatgctggtggtccaggtgga
ggggatatgcaagggagtggatacatgggaagtggctatggtgatgctaatggtaatcca
gggtatggaaatgcagcatggagatctgaacaatcacaaacttctggaaattatggtgct
cctcaggggaatggtcctcatggtgggcaggttgcctatggtagtggatatgccagtgct
caagcccgaacccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
