Juglans regia (English walnut): 108983014
Help
Entry
108983014 CDS
T05245
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
jre
Juglans regia (English walnut)
Pathway
jre03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
jre00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
108983014
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
jre03019
]
108983014
Messenger RNA biogenesis [BR:
jre03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
108983014
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108983014
NCBI-ProteinID:
XP_018810068
UniProt:
A0A2I4DSD9
LinkDB
All DBs
Position
7:38683074..38688267
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEYFENYGDVLQTVVMRDKTTGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDSHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSAKAVNPNLARSSGGGGTFRTKKIFVGGLPST
LSEEEFRQHFASYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDDEEAVDRVLHKSFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGNRTMGGGGSGSLGSGYQNYGASGGNPNTYDGRMDSNRYMQTQSTG
GGFAPYGSSGYSAPGYGYGPANNGISYGAYGSYGGANTGYGGPAGAAYGSPNLPNAGFGS
GPPGASRSSWSAQAPTGYGAMGYGNTAAWGAPGGSTGAPSGGPGSAPTGQSPSGATGYGN
QSYGYGGYGGSDGSYGNPVGYGAVGGRSGSVPSNNAGGPAGGDMQGSGGGYVGSGYGDAN
GNTGYGNGAWRSEQSQTSGNYGAAQVNGPHGGQVAYGGGYANAQARTQQQ
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagctgttcatcggtggtatttcttgggagaccacggaggaa
aaactgaaggagtactttgagaactacggggacgtgttgcagactgtggtgatgagggac
aagaccactgggaggcccagagggttcggcttcgtggtcttcgcagatccttccattctc
gatagggttctccaggacagccacaccattgatggcagaacggttgaggctaagagggcc
ttatcgagagaggaacagcagacttctgccaaagccgtgaatcctaatcttgctagaagc
tctgggggtggtggaactttcagaaccaagaaaatattcgttggagggctgccttccact
ttaagtgaagaagaatttcgtcaacattttgcatcttatggccatgtaactgatgtagta
gtcatgtatgaccagaatactgggcgacctcgtgggtttgggtttattacctttgacgat
gaagaagctgttgatagggttttacacaaaagcttccatgacttaaatggtaaacaagtg
gaagtaaagcgagctcttcctaaagatgcaaatcctggtgggggaaaccgtaccatggga
ggcggtggtagtggttcacttggcagtggttatcaaaactatggggcatctggtggcaac
ccaaatacatatgatggtcgaatggattccaataggtacatgcagacacaaagtaccgga
ggtggttttgctccttatggttcctctggatatagtgcacctggctatgggtatggtcct
gccaataatggtattagttatggtgcttatggcagttatggtggtgccaatactgggtat
ggtggacctgctggcgcggcatatggaagcccgaatcttcctaatgctggttttggaagt
ggcccaccgggtgcttctagaagttcatggagcgctcaagctcccactggatatggtgcc
atgggttatgggaacactgctgcttggggtgctccaggtggcagcactggtgctcctagt
ggtggccccggctcagcacctacaggtcagtcgcccagtggggccacagggtatgggaat
caaagttatggctatggtggttatggtggaagtgatgggtcttatggaaatcctgttggg
tatggtgctgttggaggtcgttctgggagtgtcccaagtaacaatgctggtggtcctgct
gggggggatatgcaaggaagtggtggtggttacgtgggaagtggctatggtgatgcgaat
ggaaatacagggtatggaaatggagcgtggagatctgagcaatcacagacttctggaaat
tatggtgctgctcaggtgaatggtcctcatggtgggcaggttgcctatggtggtggatat
gccaatgcccaggcccgaacccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
