Kazachstania africana: KAFR_0A01320
Help
Entry
KAFR_0A01320 CDS
T02487
Symbol
KAFR0A01320
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14550
U3 small nucleolar RNA-associated protein 10
Organism
kaf
Kazachstania africana
Pathway
kaf03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kaf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
KAFR_0A01320 (KAFR0A01320)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
kaf03009
]
KAFR_0A01320 (KAFR0A01320)
Ribosome biogenesis [BR:
kaf03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
KAFR_0A01320 (KAFR0A01320)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BP28CT
U3snoRNP10
HEAT_HEATR1
mTOR_dom
HEAT
Stealth_CR4
EFR3_ARM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
13886280
NCBI-ProteinID:
XP_003954705
UniProt:
H2AMH0
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(252704..258001)
Genome browser
AA seq
1765 aa
AA seq
DB search
MSSLSEQLAQISTSNATVAFDRKRRQKLHSASLIYNPKTASTQDYESIFENATKALNELS
EIDPRFEIFKRSLFSESSISIDRNVQSKDEVNSLNNAINAYLYLASSKWHLSPTLHATEW
LVRRFQIHVLNAETFLLSTLNYYQTPVFNRILNIIKLPPLFQPLSNFVRKENLPTNLTII
KLFNDIGFLKLYASYLSKNIKQKTTYTNQLLFVTCCFINLIAFNSNNEDKLNQMVPIFLE
ISAKLLSSNSVDCQIAAHTILVVLSTALPLQKVIINAAMETILSNLKDIKAKKSAFIAIC
KMFQTLKGQGNIDQLSDKLYKLFDSCFDSHYLTTFLSDNEEGTLICDKFITSYIRAIARY
DHSKLSNIVNILEKVKLEKFEVRMLIIDLIHLSEILDDKSQLIQLFEYFIKINEKLVINC
LKSLNLTPELFEIRLTTSLFTLNEINDENVKNLDSQKIAGQNTQVPPFKEFLEKNSSYIN
TKNTSMVAESDETFNKSLSLFIEAVGRSYQPGLFLSSFFTTLEGRMTFLLRTVISPAAPI
TLRIIALTNISKYLHNIDKESNLFTLVPILLVALNDVSKNVRLQVKKVLIQISKRPSTKH
YFLVNKIYGSDVALQMLSPKDGENWLNKFIDEYIVENTEMSHIFIPKKNEKVFLLFWANQ
ALNIPLPYAKAILLDNLSKHSSANAYSTLFQNFFENYLNNRSEWEIKCKNNKTDFSNFET
KLIDLISEKEKNQFLIDFSIQCLKSDHEQLSELVAARILKIFSTLKSAFQLQIVENIINS
AAESDPVYDAIGLLQALPVSADIFNSILSANKINTDASATDLTKRRRRRSSSNKSAFQNE
EVSQLAEVHLRKLTIILEALDKAKVEGTSSLLSTLFSLLSDLESLDQDGGLPVLYVQETL
TSCMLNVLHSLKENGTTELDNVRADILVSAIRNSPSPQLQNKFLLVVGALASLSSETVLH
SVMPIFTFMGAHSIRQDDSFTTQVVEKTILTVVPALLENANQTKQDELEFLLMSFTTAFQ
HVPKHRRVRLYSTLVKTLGASTAIGPFFFLVAQQFSAHMATFKLGEARNFIEFAKLFLVN
FTVSEQLTGLRSFLQILSDLLKSIKDKETKDHLSSKALFTNGVLNSSVSELFVLVQNSFD
FINKVIQEDDADYYNVNGSFKLRVYAALLDSNNDKKYLATVKEEFGSVLEYVLLFINNSG
DNFSLPDESSAEALSPDFQSEIKNLLFNLLTNTLNMLPIEDFVSSVTPLITKSANKDIRY
HLALVVGTKFELESLESAPVAGSVIELLLERVPIEKSSISVASVFMNTLATLIGKFGKKL
EVSLLTKSIILATNELLSDETEMVISSLTVITNCIQNLGVKAISFYPKIVPPSIKIFEKL
RENKENELKEQLQLSIILLFAAMIKSIPTFLMSNLANVIYIILFSDEVETSTRLSVIDLL
VTNIDLKELLKVLQKLWVSTVCKTEDSIAISLFLSILESTVEAIDKKSATSQSPTFFKLL
LSLFEYRSISEFDNNTISRIEASVHKIANAYVLKMNDKVFRPLFVLTVRWAFDGEGAVNV
GISEVERLTAFFKFFNKLQENLRGIITSYYTYLLEPTTKLLKRYLDKEINDINLQRLVLN
SLTSSFKFDKDEYWKSTSRFEIICEVLVGQLKVVENTIGKYLVKAIGFLAANNSSVDEHN
QTLNKILASHMKATCPSFEKLWAIRSMKLIYSKVGESWLVLLPQLVPVIAELLEDDDEEV
EHEVRTGLVKVVENVLGEPFDRYLD
NT seq
5298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatccttaagtgagcagttagctcaaatatccactagtaatgctacagtggctttc
gacagaaagagaagacaaaaattacattctgcctctttgatctacaatccaaaaactgct
tctactcaagactacgagtctattttcgaaaatgccactaaagctctaaatgaactgtcg
gaaatagacccaagattcgaaatctttaaaagatctctcttttctgaatcctcaatctct
atcgatagaaatgttcaatcgaaagatgaagttaacagcttgaataatgcaatcaacgca
tatctctatttggcttcctccaaatggcatctatctccaactttacacgctactgaatgg
ttggttcgtcgttttcaaattcatgtcttaaatgcagaaactttcctattatctacttta
aactactatcaaactccagtatttaataggattttaaatatcatcaaattaccacctctt
ttccagcctctgtcaaattttgtaagaaaagaaaatttaccaacaaatttaaccattatt
aaattattcaatgacattggtttcttaaaattatatgcaagttacctatccaaaaatata
aagcaaaaaaccacttacacaaatcaactactctttgttacatgttgtttcataaatcta
attgcattcaattcaaataatgaagataaattaaatcaaatggtaccaatcttcttagaa
atttcagctaaattgttgagttcaaattctgtggattgtcaaatcgccgctcatactatt
ttagttgtcctatccaccgcattaccactacaaaaagttattatcaatgccgctatggaa
actatattatcaaatttgaaagatattaaagctaaaaagtcggcttttattgcaatttgt
aaaatgtttcaaactttgaagggtcaaggcaatatcgatcaattatctgataaactttat
aaattattcgattcatgtttcgactcacattatttaacaactttcttaagtgataatgag
gaggggactttaatatgcgataaatttattactagttacattagagccattgccagatac
gatcattcaaagctatcaaacatcgttaacattttagaaaaagttaaattggaaaaattc
gaagtcagaatgcttatcattgatttaattcatctttcagaaatcttagatgataaatct
caattaatccaattattcgaatatttcattaagattaacgagaaactagttattaattgc
ttgaaatctttgaatttaacaccagaacttttcgaaattagattaactacatcccttttc
acattaaatgaaattaatgacgaaaatgttaaaaacttggattctcaaaagattgctgga
cagaacactcaagttccaccattcaaagaattcttagagaaaaattcatcttatatcaat
acaaagaatacttcaatggtagctgaatcggacgaaactttcaataaatcattatcctta
tttattgaggccgttggtagaagttaccagcctggtttatttttatcatcattcttcact
actttagaaggtagaatgactttccttttaagaactgttatctctccagcagctcctatc
actctaagaataattgctttaactaatatctccaaatatttgcataatattgacaaagaa
tcaaaccttttcactttggttccaatactactcgtagcattaaatgacgtctctaaaaat
gtcagattacaggtgaagaaagttttgatccaaatttcaaaaagaccatccaccaaacat
tacttcttagtgaacaaaatttatggttctgatgtcgctttacaaatgttaagtccaaaa
gatggtgaaaactggctgaataagtttattgatgaatatatagtggaaaacacagaaatg
tctcatattttcattccaaaaaagaatgaaaaagtcttcttactattttgggctaatcaa
gctttaaacattccactcccatacgctaaagctatcttattagataacttaagcaaacat
tcttcagcaaacgcttactcaacccttttccaaaatttctttgaaaactatttgaataat
agatcagaatgggaaataaaatgtaaaaacaataagacagatttcagtaatttcgaaact
aaattgattgatttaatttcagaaaaggaaaaaaatcaatttttgattgatttctccatt
caatgcttaaaatccgaccatgaacaattatctgagttggtagcagcaagaatactgaaa
atcttcagtactctcaaaagtgctttccaattgcagattgtagaaaacattattaattca
gcagccgaatctgacccagtttatgatgccattggtcttttacaagcattacctgtctct
gctgacatcttcaacagcatcttatctgccaataaaataaatactgatgcaagtgctact
gatttaaccaaaaggagaagaagacgttcttcttcaaataagtctgccttccaaaatgaa
gaagtctctcaattggctgaggttcatctaagaaagttgactattattctggaagcttta
gataaggcaaaggtcgaaggtacttcttcattattatccactctgttttcgctactttct
gatttggagtctttagatcaagatggtggcttgccagtcctatatgttcaagaaacgttg
acttcatgtatgttaaatgttctacattcattaaaagagaatggcactacggaattagat
aatgtcagggcagatattttggtgtcagctattagaaactcgccatctcctcaacttcaa
aacaagttccttttagttgttggtgccttagcttctttaagttccgaaaccgttttacat
tccgtcatgccaatatttactttcatgggggctcatagtattcgtcaggacgatagtttc
actactcaagttgttgaaaagacaattttaactgtcgttccagccttgttagaaaatgca
aatcaaacaaaacaagatgaacttgaatttttgttgatgagctttacaactgcttttcaa
catgttccaaaacatagacgtgttagactttactctaccttggttaagactttaggtgct
tcgactgcaattggtccattcttcttcttagtggctcaacaattttcagcccacatggcc
actttcaaacttggggaagccagaaacttcattgaatttgccaagctgttcctagtaaac
ttcaccgtttcggaacaattaacaggtttacgttccttcttacaaatcttgtctgattta
ctaaagtctatcaaagataaggaaactaaggaccacttatcctccaaagctctattcact
aatggtgtattaaactcaagtgtaagcgaactatttgttttggttcaaaactcctttgac
ttcattaacaaggttattcaagaagatgacgctgactattacaatgttaatggaagcttc
aaactaagagtttatgccgctttgttagattctaacaacgacaagaaatatctagctaca
gtaaaggaagaatttggaagcgttttagaatacgttttattattcattaataattcaggt
gataacttttctttaccagacgaaagttccgctgaagcactttctcctgatttccaaagt
gaaataaaaaaccttcttttcaacttattaacaaatactttgaatatgctgccaatagaa
gattttgtatcttcagtcacaccattgattaccaagagtgccaacaaagacatcagatat
catttggcattggttgttggtacgaagtttgagttagaatctttagaaagtgcaccagtc
gctggaagtgtaattgagcttcttttggaaagagttccaattgaaaaatcttctatttca
gtagcgagtgtattcatgaatacactcgccacgttgattggtaaatttggtaagaaattg
gaagtttcacttcttacaaaatctataattcttgccaccaatgaacttctttcagatgag
acagaaatggttatctcttctttaacagttatcacaaattgtattcaaaatctcggtgtc
aaggccatctctttctatcctaagattgtaccaccttctattaagatttttgaaaaattg
agagagaacaaagaaaacgaattgaaggaacaattacaactctccattatattattattt
gcagcaatgatcaaatctatccctactttcttaatgtctaatctagctaatgtgatttat
attatcctcttcagtgatgaagttgagacttctactagactatctgtcattgatttactt
gttacaaacattgacttaaaggagcttttgaaagtgttacaaaagttatgggtatctact
gtttgcaaaaccgaggattccattgctatttcattatttttgagtattttagaatctaca
gtggaggcaattgataaaaaatctgcaacctctcaatctccaactttcttcaagctttta
ctttctctatttgaatatagatcaatcagtgaatttgataataacactattagcagaatt
gaagcatctgtgcataagattgctaacgcttatgttttgaagatgaatgacaaggtattc
agacctttatttgtattaaccgttagatgggcctttgatggagaaggtgctgtgaatgtg
ggaatttcagaagtcgaaagattgactgctttcttcaaatttttcaacaaacttcaagaa
aatttaagaggtattattacatcctattatacttacttattagagccaactactaaattg
ttgaaaagatacctagataaggagataaatgacattaacttacaacgtcttgtcttaaac
tcgttgacttcttcattcaaatttgacaaggacgaatactggaaatctacatcaagattc
gagattatttgtgaagtccttgttggtcaattgaaagttgtcgaaaacactattggtaaa
tatttagtcaaggcaattggctttttagccgctaataatagcagtgtcgatgaacacaac
caaacattgaataagatattagcaagtcatatgaaggctacctgtccatcatttgaaaaa
ctttgggctattagatctatgaaattgatctactccaaggtcggtgaaagctggttggtg
ttattaccgcaattagtaccagtcattgcagaattgttagaagatgatgacgaagaggtc
gaacatgaagtaagaacgggtttagttaaggtggtcgaaaacgtccttggcgaaccattt
gacagatatctagactga
DBGET
integrated database retrieval system
