Kordia antarctica: IMCC3317_38150
Help
Entry
IMCC3317_38150 CDS
T06371
Symbol
susC_22
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor SusC
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
kan
Kordia antarctica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kan00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kan02000
]
IMCC3317_38150 (susC_22)
Transporters [BR:
kan02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
IMCC3317_38150 (susC_22)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
Inovirus_G7P_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHI38422
UniProt:
A0A7L4ZP42
LinkDB
All DBs
Position
4426869..4430039
Genome browser
AA seq
1056 aa
AA seq
DB search
MNLKSKLTCIAMLLFCVTMYAQESFTLKGKVVATSDSQPVPGVNVLNVKTSKGTATDFDG
LYQIVVTQGDVLQFSSIGFVTKTVTITDQKTLNVSLEDDASALDEVVIVGYGTRKKSHLT
GSVAQIKGKDVAAVQATRVDEALAGKLSGVLIQNTSGEPGADLKIQVRAASSISGDSSPL
IVVDGFPISGNLATVNPNDIESLEVLKDAASSAIYGSRGANGVILVTTKKGKTGKTTFSY
NTYFSTSSKYQRDNLNMNANKWANTIESNIANGSFDVSEVDPALLNYRINAYRNSPGAIS
PEEWLFQNGNSTSHDLSMSGGNENVKYFASIGYQDTEGIAITQEFERINARLNIDAKLGD
KLKAGLSFNGFKSDRAILAHDQRDLLRAYGVHPIYHTAESIAFVQQLDVEAQNLGLSPFD
DGYRGGSLGVDLGVNSSIYTLQPGDTAQDWHYGRSGNGIGGSGDAGPATKLDNAERTQRT
YFANVNTYLQYTIIEGLNIKTVLGADVNDTQDYYYQGLEADSRLRTNQTDLDQTDVKRSS
ILSVTTLDYSKQIGKHDIAALVGVEFQNFYIDGTALRGTNVPYGDIVNYNLLDPADITVT
ERDEEINRQSIFGRINYAYDNRYLASVSVRRDGDSRFGANEKHATFPALSLGWNVHNESF
YESELLSLLKLRFSIGSLGTTAFLGAYDALSLLNSGPSVFGNAFGIPNNIANPDLTWQTN
TETNFGTDLGFVNNRFRLSVDYYTSNIEDILLSRSVSEVLGTTSVLINSGDVESTGLEFE
LSATIINNDDFSWNVSGNLSTVNTEIKDLDGLDELPPTVYGQSGRGPEFRNYVGGEIGEM
WGLETTGEIEMIHVADPTRTVGATSGEYYVKDQNGDGVINRDDYVKIGQNTPDFYWGFNS
QMKYKDFDMSLQFQGSHGAEVFNIDPLYWQSQFGGRLRDSFDANDDGIADANGRHFTRAR
DQTDAVIQDASYVALRNLTIGYTLDSDLTNKFGISSLRVYAAATNLLYFWSSDYTSFNPE
GIETTNGGYLGPTTSGVQVGASPVARSFTFGLNVNF
NT seq
3171 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttaaaaagtaagctgacctgcattgcaatgttgctcttttgcgtcacaatgtat
gcgcaggaatcttttaccctaaaggggaaagtcgttgccacatcggacagtcaacctgta
cctggtgtaaatgtgcttaatgtaaaaacatcgaaaggtactgcaacagacttcgatgga
ctttatcaaattgttgtgactcaaggtgatgttctacaattctcgtctatcggatttgta
acaaaaacggtgaccattacagatcaaaaaacacttaatgtttccttagaagatgatgct
tcagcacttgatgaagttgtgattgttgggtatggtacacgtaaaaaatcacatcttaca
ggatcagtagcacaaataaagggtaaggatgttgcagctgtacaagctacacgtgttgat
gaagcactagccggtaaattatcgggtgttttgattcaaaatacaagtggagagcctggt
gcagatttaaagattcaagtaagggcagcttcatctatttcaggtgattcaagtccgtta
attgttgttgatgggtttccaatttctggaaatttagcaactgttaacccaaacgatatt
gaaagtttggaagttttaaaagatgctgcttcttcagctatttatggttctagaggtgca
aatggtgttatcttggttacaaccaaaaaaggtaagacaggtaaaactacctttagttat
aatacgtattttagtacatcaagtaagtaccaaagggacaatctaaatatgaatgctaac
aaatgggctaatactatagagagtaatatagccaacgggagttttgatgtttctgaggta
gatccggctttattaaattatagaataaatgcttatagaaattcacctggtgctataagt
ccagaagaatggctttttcaaaacggtaatagtacaagtcatgaccttagtatgagtggt
ggtaatgaaaatgtaaaatattttgcatctattggttatcaagatactgaaggtattgca
attactcaagagtttgaaagaattaatgcgcgtttgaatatcgatgctaaattgggcgac
aagttaaaagcaggattaagttttaatggatttaaatctgatagagcaatacttgctcat
gatcaaagagatcttttaagagcttatggagtacatcctatttatcataccgcagaatct
attgcattcgttcaacaattggatgttgaagctcaaaatttggggttatctccatttgac
gatggttacagaggaggtagtttaggtgttgatttaggtgttaatagtagcatctataca
ttacaacctggtgatactgcacaagactggcattatggaagatctggtaatggtattgga
ggatcaggagatgcaggtcctgcaacaaagcttgacaatgcagaacgaacacaacgaacg
tatttcgctaatgttaatacgtatttacaatacactattatagaagggttaaatataaaa
actgttttaggagcagatgttaacgatactcaagactattattaccaaggacttgaggca
gattctagattacgtactaatcaaactgacttagatcagacagacgtaaaaagatcttca
atattaagtgtaactacgttagattattcaaaacaaataggaaagcatgatatagctgct
ttagttggtgtagaatttcaaaatttctacatcgatggaactgcattaagaggtacaaat
gtcccatatggcgatattgttaactataatttgttagatcctgcagatattactgtaacg
gaaagagatgaggaaattaacagacagagtatttttggaagaattaactatgcgtatgac
aatcgttatttagcatctgtttcagtaagaagagatggtgattctcgttttggagccaat
gaaaaacatgcaacattcccagcactttctttaggatggaatgtgcataacgaatctttt
tatgagtcagaacttctatcgctattaaaactaagatttagtattggttctctaggaact
actgcttttttaggagcttatgatgcgttaagtcttttaaattctggaccatcagtattt
gggaatgcatttggaatccctaataatattgcaaacccagatttaacttggcaaaccaat
acagagaccaactttggtactgatttagggtttgtaaataatcgttttagattaagtgta
gattattacacatctaatattgaagacatcttgcttagtagaagtgtttctgaagtctta
ggtacaacaagtgtactaattaattcaggtgatgttgaaagtactggtttggaatttgaa
ctaagtgcaactatcataaataatgatgacttctcttggaatgttagcggtaacttatct
acagttaatacagaaattaaagacctagatggtttagacgaattaccaccaactgtttac
ggtcaaagtggtagaggtccagaatttagaaactatgttggtggagaaataggtgaaatg
tggggattagaaactactggagaaattgaaatgattcatgtagcagatccaacaagaacc
gttggtgccactagtggagaatattatgtaaaagatcaaaatggtgatggtgtaataaat
agagacgattatgttaaaatagggcaaaatacaccagatttttattggggtttcaatagt
caaatgaaatataaagattttgatatgtcacttcaatttcaaggatcacatggagcagaa
gttttcaatattgacccattatattggcaatcacaatttggtggaagattacgtgatagt
tttgatgctaatgacgatggtattgctgatgctaatggacgccattttacacgagcaaga
gatcaaacagatgctgtgatacaagatgcatcatatgtagcattaagaaacctaactatt
ggttatacacttgatagtgatttaactaataaatttggtatcagttctcttagagtttat
gctgcagcaactaatttattatatttctggtcaagtgattatacatcatttaatccagaa
ggtatagaaactaccaatggaggttatttaggacctacaacttctggtgttcaagtagga
gcaagtccagttgcacgaagttttactttcggtttaaatgttaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
