Ktedonobacteria bacterium brp13: ccbrp13_46770
Help
Entry
ccbrp13_46770 CDS
T09592
Name
(GenBank) ricin-type beta-trefoil lectin domain protein
Organism
kbb
Ktedonobacteria bacterium brp13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ricin_B_lectin
He_PIG
RicinB_lectin_2
Peptidase_S8
Ig_SIBA-E_2nd
HYR
Inhibitor_I9
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCL82212
UniProt:
A0A7I8EVI5
LinkDB
All DBs
Position
5769706..5774097
Genome browser
AA seq
1463 aa
AA seq
DB search
MLAKSEKPTVIPNSYIVVLKNKPYAKAAEIKSMAHKLASTYGGTLTNVYTAALQGFSLHI
SDAQAKKLAKDAQVSYIEQDATMPLMSTSMQSSTTPTTQANAPWSLDRIDQQNLPLSGTY
SYNTDGSNVSVYILDTGVRFTHVDFGGRAVSAPDGGDNNDCAGHGTAIAGIIGGTTWGVA
KNAKLYSLRNLSCTNVPATSLGMSAIDWVTANAQRPAVVNISWGTNIDPALDASINNSMA
SGITYVIAAGNNNGDACQTSPQDDTNAIVVGSTGRSDARSPFSNYGPCVTMFAPGEFIPT
DSYVSDTATTTATGTSFSAPLVAGAAALYLSAHPTATPSQVKAALLACATSGVITNVGSG
SPNKLLSIQCAQSIQVTNPGLLMSTQGQSIHLQLQATDPTPGQSITYSATGLPSGLSLDA
STGVISGTYAGTGANPVQVTVSDSSGASGSASFMWNTIKGYGSITDAVKNCIDDAHSLAS
DGNTIQLYSCNQSQAQNWMLNDNGTITVFGMCMTASNNGTTDGTPIVLYDCSTAPSQIWQ
PQSNGELLNPASGLCLNEPSTSGGTQLTLATCTGASTQQWTLPGANSPNILAATNPGDQI
SDKGTAVSLQFRAFDSGVGQTVTYSATGLPAGLSINTSTGLISGTLTNVGSSSVTLTAKD
GTGVSTTASFNWSVGNGAITGLSGQCLDDQHTSTTNGNPIDVWGCNQGASQEWTLGAGNT
LQVVGKCMTASNNGITVGTPIVLYDCSSAPSQIWQPQSNGELLNPVSGLCLNAPATSSTL
TLATCTDSANQQWTLPVADNVTITNPGQQSVVAGTATSLQINAANFNTQQTLSYSATGLP
AGLSINASTGLISGTPTTAGSSSVTVTVKDSSGVSATMTFNWDIAKAQGAITGVNGNCID
DSASQSWNGNVIQLYGCNQSPAQTWTLNGNSTISVFGKCMTASNNGTTSGTPIVLYDCSA
ASSQIWQYQQTNGNLLNPASGLCLNAPSTSGGTQLTLAACAVTVSEAWTVPGEVAPHFIT
VTNPGSQTTFAAQTASLQITATDSLNGQTLSYSATGLPAGLSINASTGLISGTPTTVGSS
SVTITVKDSSGLSATTTFKWNIAGQGVITDATGLCIDDSSSGNWNGNAIQIWGCNQTAAQ
TWTLNADGTISVFGMCMTASNNGTTSGTPIVLYDCSAASSQIWQYQKTNGNLLNPASGLC
LNAPLLTQGTHLTLAACASTAGQEWAAPGEPAPHYITVTNPGSQTTVVAQTASLQIAATD
SLNGQTLSYSATGLPAGLSINASTGLISGTPTTVGSSSVTVTVKDSSGVSATTTFNWRIA
KGQGVITDTNGLCIDDSSSGNWNGNAIQIWGCNQTQAQNWTLYANGTISTFGMCMTASNN
GTTSGTPIVLYDCSAAPSQIWQPQSNGELLNPASGLCLNEQGTGQGTQLTLATCTGTAAQ
QWKLPITGSIAATPAAVRQSLIA
NT seq
4392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcgcaaagagcgagaaaccgactgttattcccaatagttatatcgtggtgctcaaa
aataagccatacgccaaggcagctgaaatcaagtccatggcccacaaactggccagcacc
tatggcggtacattgacaaatgtctatacagcggcattgcaaggattttccttgcatatc
tccgatgcgcaggccaaaaagttggcgaaagatgctcaagtctcttatattgagcaggac
gcgaccatgccgcttatgtctaccagtatgcagagtagtaccactcccacgacgcaggcc
aatgcgccctggtctctggatcgtattgatcagcagaatttaccgttaagtggtacatac
tcgtataatacggatggatccaatgtatctgtctatatccttgatacaggtgttcgtttc
acgcatgttgactttggtggtcgtgcagtctcggctccagatggaggagataacaatgac
tgtgcgggacatggtacagccatagcgggcataattggtggaacaacctggggcgtggca
aagaatgccaagctctactcgctgaggaacctgtcctgcaccaatgttcctgccacctcc
cttggtatgtcggctattgactgggtgacagccaatgcgcagcgtccggctgttgtgaat
atcagttgggggacaaacatcgatccggcattggatgcatcgatcaataattccatggcg
tcaggcattacctatgttatcgcggctggcaataataatggcgatgcatgccagacctct
ccacaggatgacacaaacgcgatcgtagttggttcgaccggtcgtagcgacgcacgttcc
cccttttccaactatggcccgtgcgtgacaatgtttgcgcctggtgaatttattccaacc
gattcctatgttagtgacacagcgacaacgacagcaaccggtacttcattttcagcgcca
ctcgttgcaggtgccgcggctctctatttatccgctcacccaactgccacccccagccag
gtaaaagccgcgctgcttgcgtgtgcaaccagcggcgttatcaccaatgtgggatcaggc
tcaccaaacaagcttttgtcaatccagtgtgctcaatctatccaggtcaccaatcctggt
ctgttgatgtcaacgcagggtcagtccatacatctccagctacaggcaactgatcccacc
ccagggcagagcatcacgtatagtgcaacgggcctgccatctggactatcgcttgatgca
tctaccggtgtcatctctggtacctatgcgggaacaggagccaaccccgtgcaggtgaca
gtgagtgatagtagcggggcaagcggttctgcttcatttatgtggaatacaatcaaaggc
tatggttctattactgatgccgtcaagaactgtatcgatgatgctcacagcctggccagc
gatggcaacacgatccagctctactcctgtaatcagtcgcaggctcagaactggatgctg
aatgacaatggtacaatcacggtattcgggatgtgtatgaccgcatccaataatggtact
acggacggaacaccgatcgtgctctatgattgtagtacggcaccctcacagatctggcag
ccacagagcaacggagaactgctcaatcctgcttctggcctctgtttgaatgagccgagc
acaagtgggggaacacagttgaccctggcgacctgtacaggggcctcaacccaacaatgg
actcttcctggcgcaaactctcctaatatattggcagcgaccaatcctggtgatcagata
agcgacaaaggtactgctgtgagcttgcagttcagggcctttgattctggtgtaggccag
accgtcacctatagtgcaacaggtctaccagcgggactctcaatcaacacatcgaccgga
ttaatctctggtacgctgacaaatgttgggagcagttctgtgactctgactgcaaaagac
gggaccggagtaagcaccacggcttcgttcaattggagcgttggcaatggggcaattacc
ggcctcagtgggcaatgtttggatgatcagcatacatctacaacaaacggcaacccgatc
gatgtctggggttgtaatcagggagcgtcacaggaatggacgctaggagcagggaacacc
ctgcaagtcgttggtaaatgtatgacggcttcaaataatggcatcacggtcggaacaccg
atcgtgctttatgattgtagttctgcaccctcgcagatctggcagccacagagtaacgga
gaactgctcaatcctgtctcaggcctctgcttgaatgctcctgccacaagctctacattg
actctggcaacctgcacagactctgccaatcagcaatggactctgccagtcgctgataac
gtcaccatcaccaaccctggtcagcagtctgttgttgcgggaactgcaaccagcttgcaa
atcaatgcggcaaactttaatacgcagcagacattgagctatagtgcgaccggtctacca
gcgggactctcaatcaacgcatcgaccggattaatctctggcactccgacaactgctggg
agcagttctgtaaccgtcaccgtgaaggatagctctggagtgagcgcaacgatgacgttc
aattgggacatcgccaaggcacaaggtgcgatcaccggtgtgaatggtaactgtatcgat
gatagcgccagccaaagctggaacggtaacgtgatccagctctacggctgtaatcagtcg
ccggctcagacttggacgctgaatgggaatagtacaatctcggtattcgggaaatgtatg
accgcatccaataatggtactacaagcggaacaccgatcgtgctctatgattgtagtgcg
gcatcctcacagatctggcagtatcagcagacgaatggcaacctgctcaacccggcctca
ggactctgcctgaacgcgccgagcacaagtgggggaacacagttgacgctggcagcctgt
gccgtcacagtgagtgaggcatggacggttcctggtgaagttgctcctcatttcataacg
gtaacaaatccaggcagtcaaacaaccttcgcagcacaaacggctagcctgcaaatcaca
gcaacggactccctaaacggtcagacgttgagctatagtgcgaccggtctaccagcggga
ctctcaatcaacgcatcgaccggattaatctctggtactccgacaactgttgggagcagt
tctgtaaccatcaccgtgaaggatagctctggattgagcgcaacgacgacgttcaagtgg
aacatcgccggacaaggtgtgatcaccgatgcgactggcctctgtatcgatgatagttcc
agcggaaactggaacggtaatgcgatccagatctggggttgtaatcagacagcagctcag
acctggacgctgaatgcagatggtacaatctcggtattcgggatgtgtatgactgcatcc
aataatggtactacaagcggaacaccgatcgtgctctatgattgtagtgcggcatcctca
cagatctggcagtatcagaagacgaatggcaacctgctcaacccggcctcaggactctgc
ctgaacgcgccgctcctaactcagggaacccatttgacgctggcagcctgtgcctccaca
gcgggtcaggaatgggcggctcctggtgaaccggctcctcattacataacggtaacaaat
ccaggtagtcaaacaaccgtcgtagcacaaacggccagcctgcaaatcgcagcaacggac
tccctaaacggtcagacgttgagctatagtgcgaccggtctaccagcgggactctcaatc
aacgcatcgaccggattaatctctggcactccgacaactgttgggagcagttctgtaacc
gtcaccgtgaaggatagctctggagtgagcgcaacgacgacgttcaattggaggattgcc
aagggacaaggtgtgatcaccgatacgaatggcctctgtatcgatgatagctccagcgga
aactggaacggtaatgcgatccagatctggggttgtaatcagacgcaagctcagaactgg
acgctgtatgcgaatggtacaatctcgacatttgggatgtgtatgactgcttcaaataat
ggtactacgagcggaacaccgatcgtgctctatgattgtagtgcggcaccctcacagatc
tggcaaccacagagcaatggggaactgctcaatcctgcttctggcctctgtttgaatgag
cagggcacaggtcagggaacgcagcttacgctggcaacctgtacagggaccgcggcacag
caatggaagctgccaatcaccggttcgattgcggcaacgcctgcagctgtcagacagtct
ctgatagcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
