Candidatus Kaistella beijingensis: J4771_06415
Help
Entry
J4771_06415 CDS
T07870
Name
(GenBank) putative Ig domain-containing protein
Organism
kbe
Candidatus Kaistella beijingensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YDG
Por_Secre_tail
HL_N-beta
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UBB90969
LinkDB
All DBs
Position
complement(1380597..1386617)
Genome browser
AA seq
2006 aa
AA seq
DB search
MKTKLFSLYKLFFLVLLIVAVKGWGQTTVFSEDFGNPSANTSVNIYTGFQNYGVLNFTAG
TSGTDVRTSTPSTTYAGASGNGNVLLNVITKYIEISGINTTGYTGLQLSVGLRKATNAAT
QPIKVELSSDGINYSQLTYTNLSTGTGTAGWYLRSMTGLPSTSNLRIRFTGNEGINTAGI
DDVILKGTLSCTNPTITMNPSDTAVLVPATANFTVAASGLSLTYQWQVSTNSGTTWSDIS
GETSSSYTTPATTTAMSGYQYRVKVSSGTCSVTSNPATLTVTTSSPPVVTGASYTGTVDT
SFSQTISATNNPTSYTLTGTLPPGISFDSGTRIFSGIPTTAGNYSVDVTATNANGTSSPA
TFTFNIGKANQTITFGSLVNAEYGSAYITLSANATSGLTITYTSSNPTVASVSGNMLTIL
KAGTTNITASQSGNSNWNAATAVSQSFTVDKRPLTITGVSANNKTYDANTTAILNGSPTL
NNKVTGDDVALSPSVNANFNNKNAGNGKPVTTNFMLTGASADNYLLTQPTLTANITKKDL
NITNATAQNKEYDGTNAATISGGTITAGVLSGDTVNLSAGTGTFAQTNVGNNIVVTANYT
ISGTDAGNYNLIQPTGLFANITLGTPQFTTSTITLSVGGTYDLPGANITSTSNGTLSYSI
SNNGFATLSASAPWQIIGANAGTETLTVNQAATSNYKAGSTTVNVVVSAITYVNGDYRTN
PAFLGNIFFNSTNAQSSIYPWQRWNGSTWVDVTGPSASFSPQNLTTKPETIYLNSGSVNV
AGGATYNNIIVEGGYVYSADTTTGLRIADGKSLDIKAGTVEVIGYFSIGAGTNLYVRKNA
TLTIGSAYYNFVRNATSKFTVEDEGYVFINNYLQNLWTGDENFAGLSVFSFTKWDQTQKL
FNNEVNITNNSLGTKFGYLDIDIGTSGIAGNWTVFPNETFKLTNKDFSIKSDDTSNNMNL
NAGTIDIGGDFIIKGAGTIQIQTTTGSSKNINVNGNLSKSGSGKTVLQLAGGSLKMTLNV
LKNVQLDGGSIILSQVAGGIGELNVLGDLNINSGDLDMNKASGTGTINLSGNLNLSGNLF
ATSNSTNTKFNFVRNGGTASNAQNINAINQLTASNIAFNVSKGYTKLINNNLTLGDKSTF
RVSTGATFDFGFNNPVAPNIPDPLLIKFNGTSQTFTNEDSSTLVITSPDGITNTANTGNV
QTPAAGRTYATNATYHYKGKKNQFTGNGLSSNSSSKYVIVELDTKNPPLNDDLEFKSNNG
IIKFSSAGKLEIRTGKVIDDSGYGFADATAEDGELIMSGGRYKIYRSGVQPSLGGNYTLT
GGIIEFAGDKPIQARASNPPKQYLNVEVSGSDVSAGTTSTSGLTFQSGGKFTVKGIDPNN
SAITGTFKVANPDGFSGGSTTAIKATNNPTIELLPNSIIEYNGVTTSPVEQIVTNKAVSK
PADAHYANLKISGSGTKTATGETIVNEMTTVSAADATLKVPATADFNGTTAPQPNVFWAK
GGIDNTNGTTGNFFLDNNAILMQNDNADNSKAKIEQHRFSLMKRQEYTYWGSPVQGQIFK
GFSPNTISTRFYTYNEIDGSFASVPNYATTSFVPAKGYAIRAPNNWNTNTREFWQGKFIG
KPNNENDNITFPLEYHAAIPSPNGRERAGLNMVSNPFPSNIDLSKLVAENTSVVDGVFYF
WTNTNAVTGTVISTGNGSYSNYTANNYATLNFLGGVPAAGSASGSSAYPTKIVKPGQGFL
ILAKPAVENMNADEKKLKFNNSIRTKENIDGSKYSVFFNSRSANSNSTDRFWLYQTSPVG
NKNILLIGYAEGSSNDFDLGYDAPAMSSNDSFYSLVDDQKLAIQGRIYPLLIDDVVHLGS
NNFSVGTYTIGIEYKEGIFATNQKIYLRDKLQGIVTDLSEGSYSYTANEGELLNRFEIIY
KPQTTLATGENSNQNVMVYRNGKDFVVKSLNKQINSVEVFDTVGRLIIHKRGNSKEVIIS
GKDIAAGVYILKINQGSSTSIRKIRN
NT seq
6021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagacaaagctattttctttatataaattatttttcctggtactgctgattgtggcg
gtgaaagggtgggggcagacgacggttttttcggaggattttggtaatccttctgcaaat
acgtcagtaaatatatacacgggatttcagaattatggtgttcttaactttacggcaggt
acttcgggaacagacgttaggactagtactccaagtactacttatgctggcgcatcagga
aatggcaatgttttactaaacgttatcacaaagtatattgaaatttcgggaatcaacact
acaggttatactggtcttcaattatcagtaggattacgaaaagcaactaatgcagcgacc
cagccgattaaagttgagttaagttctgatggcattaattacagtcaattaacatataca
aatcttagtaccggaactggtacggccggttggtatttacgtagtatgacaggtttgcct
tcaacctcaaatctgagaatccgttttactggaaatgagggtattaatactgcgggtatt
gatgatgttattttaaaaggtactttatcctgcactaacccaacaattaccatgaaccca
agtgatacagcagttctcgttccggccacagccaactttactgtcgcggcttctggttta
tcacttacctatcaatggcaagtttccacaaatagtggaacgacatggagtgatattagc
ggtgaaacatcaagtagttataccacaccagcaactaccaccgcaatgagtgggtatcaa
taccgcgtaaaagtttcttcgggaacttgtagtgtaacttccaatccggcaactttaact
gtgaccacatcatcaccgccagtagttactggagcttcatacacaggtactgttgatact
tcattttcgcagacaatttcagcaacgaataacccaacaagctatacgcttactggaaca
ttgcctccaggaatttcttttgattcgggaacaagaattttttcgggtataccaactacc
gcaggtaattattctgtagatgttactgcaacaaatgccaatggaacgagttccccggcg
acttttacttttaatattggaaaagccaatcaaaccataacttttggcagtttagtaaac
gcggagtatgggtcggcttatataacattgtcagccaatgcaacatcaggtttgacaata
acttatacaagttcaaatcctaccgtagcatccgtttctgggaatatgttaaccattctt
aaagctggtacaactaacattactgcctcgcaaagcggtaattcaaattggaatgcggcg
actgctgtatcgcaaagtttcactgtagataaaagacctctcactataaccggtgtttct
gcaaacaataaaacttacgatgcaaatactaccgccattctaaacggctcgcctacactc
aataataaagttactggtgacgatgttgcattatcgccttcagtaaatgcaaactttaat
aataaaaatgcagggaacggtaaaccggttaccacaaactttatgttaactggggcaagt
gcagacaattacttgctcactcaacccacacttacggcaaacatcaccaaaaaagattta
aatattaccaatgctacagcacagaacaaagaatatgacggaacaaatgccgcaacaata
agcgggggaacaataacggcgggtgttttaagtggcgatactgtaaacctttctgccggc
acgggaactttcgcacaaaccaatgtgggtaataatatcgttgtaactgcaaattacacc
atttcaggaaccgatgcgggaaactataacttaattcagccaacaggacttttcgcaaat
attactttaggaactcctcaatttacaacctctacaattacactatcagtaggcggtact
tacgacttgccgggtgcaaatattacttctacatctaatggaactttaagttattcgatt
tcaaacaacggttttgctacgctatctgcttctgcaccttggcaaataattggcgcaaat
gccggtacagaaactttaaccgtaaaccaagcagctacaagcaattataaagccggaagc
accacagtaaacgtagtcgtaagcgcaattacgtatgtaaatggtgattatagaaccaac
ccagcttttttgggcaatattttctttaattcaactaatgctcaatctagtatatatcct
tggcaaagatggaatggcagtacttgggtagatgttacaggcccaagtgcatcattttcc
ccacagaatttaacaacaaaaccggaaacaatttatttaaatagtggttctgttaatgtt
gcaggtggagcaacatataataatattattgttgaaggaggatatgtttattcagccgat
actactacagggttaagaattgcagatggaaagtccttggatattaaagcaggtaccgtt
gaggtaattggatatttttcaattggtgcaggaacaaatttatatgtacgcaaaaatgca
actttaacaatcggaagcgcatactataattttgttcgaaatgcgacctccaaattcact
gttgaagatgaaggttatgttttcattaacaattatttacaaaatctttggacaggtgat
gagaattttgcaggtctatcggttttctcctttaccaaatgggatcagacgcaaaaatta
tttaataatgaagttaatattaccaataatagtttaggaacaaaattcggttatttagat
attgacataggaacttctgggattgctgggaattggacggtcttcccaaatgaaaccttt
aaattgacaaataaagatttttcaattaagagtgatgatacttctaataatatgaatcta
aacgccggtacaattgacataggtggtgattttattataaaaggtgcaggtactatacag
atccagactacaaccggttcttcaaaaaatattaatgttaatggaaacttatcaaaaagt
ggctctggtaaaacagttttacaactagctggtggtagtttaaaaatgacactgaacgta
ttgaaaaatgtacaattagatggaggatcaattattttaagtcaagtagctggaggtata
ggagaactgaatgttttgggtgatctaaacattaattctggtgatttagatatgaacaaa
gccagtggaacaggtacgataaacttgagtggaaatttaaatttgagtggaaatttattt
gcaacttctaatagtactaatacaaaatttaattttgtgcgtaatggtggtaccgcaagt
aacgcacaaaatatcaatgcaataaatcaattaactgcatcgaacattgcgtttaatgtc
agtaaaggttacacaaaattaattaataataatctcactttgggcgacaagtctactttt
agagtaagtacaggcgcaacattcgattttggattcaataaccctgttgcaccaaatatt
cccgatccacttcttatcaaattcaacggaacttcgcaaacctttactaatgaggacagt
agtacgcttgtcatcacttccccagatggtatcacgaatactgcaaatactggaaatgtg
caaaccccagctgcaggtagaacgtatgcaacaaatgcgacctatcattataaaggaaaa
aagaaccagtttaccgggaatggtttgtcttctaattcatctagcaaatacgtcattgta
gaattagatactaaaaatccaccattaaacgacgatcttgaattcaaatcaaacaacgga
attattaaattttcaagtgccggaaaacttgaaatcagaacaggaaaagttattgatgat
tctggttatggatttgctgatgctactgcggaagatggtgaattaataatgtcgggaggg
cgatataagatttatcgaagtggtgttcagccaagtctcggtggaaattatactttgaca
ggtgggattattgaatttgctggcgacaagccaattcaagcaagagcaagcaaccctcca
aaacagtacctcaatgtggaagtttctggctccgatgtttccgcaggaaccacctcaaca
tcaggacttacatttcagtcgggcggtaagtttacggtaaaaggaatagatcctaataat
tcggcaattacaggaactttcaaagttgccaatcccgatgggttttctggtggttctact
acagcgataaaagcaaccaacaacccaacgatagaacttttaccaaattcaataattgaa
tataacggtgttacaacttcacctgtagaacaaattgtgacaaacaaagcagtttccaaa
ccagcagatgctcattacgccaatttgaaaatttcaggtagtggtaccaaaaccgccacc
ggcgaaaccatcgtcaacgaaatgaccaccgtctctgcagccgatgcaacgttgaaagtt
cctgcaactgccgattttaatggtacaaccgctccacaacccaatgtcttttgggcaaaa
ggaggtatcgacaataccaatggaaccaccggaaatttctttttagataacaacgcgata
ctcatgcagaatgataatgccgataattccaaagccaaaatcgagcaacaccgcttctct
ttaatgaagcggcaggaatatacgtattggggttcgcctgtacagggacagattttcaaa
ggtttctcgccaaatacaatttctacgagattctatacctacaatgagatagacggatcg
tttgcttctgtgccgaattatgccaccacctcgttcgttccagccaaaggatatgcgatt
cgggcaccaaacaactggaacaccaatactcgagaattttggcagggaaaattcatcgga
aaaccaaataatgagaatgataatattacttttccactggaatatcatgcagcaatccca
tcacctaacggtagagaaagggctggacttaatatggtttccaatccgtttccttcaaat
atagatttaagcaaactagttgccgaaaacacatccgtggttgatggagttttctatttc
tggacaaataccaatgcggtaaccggtaccgttatatctacaggaaatggctcttatagc
aattatactgctaataattacgcaactttaaactttctagggggagttcctgcggccggt
agtgcaagcggctcatcggcatatcctactaaaattgtgaaaccaggacaaggattcctt
attctggcaaaacctgcagttgaaaatatgaatgcagatgagaaaaagctcaagttcaat
aacagcataagaaccaaggaaaatatagatggttcaaagtattctgtgtttttcaactcc
agatctgcgaacagcaattcgaccgatcgtttttggctctaccaaacttcacccgttgga
aacaagaatatattgctaatcggttatgcagagggaagctcaaacgattttgatcttgga
tatgacgcacctgcaatgagctcaaacgatagcttttacagtttggtggatgatcaaaaa
ttggcgattcagggtagaatttatccactcttaattgacgatgtagtacacctgggatcc
aacaatttcagcgtaggaacttataccattggaattgaatataaagaaggtatttttgcg
accaaccagaaaatatatcttagggataaattgcaaggaattgtaacagacttaagtgaa
ggttcatacagctacaccgcaaatgaaggcgagttgctgaaccggtttgagataatctac
aaaccccaaactactttagcaactggtgaaaattcaaatcaaaatgtaatggtgtaccgc
aatgggaaagattttgtagtgaaatctttgaataagcagatcaacagtgttgaggttttc
gacacggttggtcgcctaatcattcataaacgaggtaatagcaaagaagtcatcattagc
ggtaaagatatcgccgccggagtttatattttaaaaattaatcagggttcatcaacatca
attaggaaaattagaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
