Candidatus Kinetoplastidibacterium blastocrithidiae TCC012E: BCUE_0427
Help
Entry
BCUE_0427 CDS
T02463
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
kbt
Candidatus Kinetoplastidibacterium blastocrithidiae TCC012E
Pathway
kbt03030
DNA replication
kbt03430
Mismatch repair
kbt03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kbt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BCUE_0427
03430 Mismatch repair
BCUE_0427
03440 Homologous recombination
BCUE_0427
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
kbt03032
]
BCUE_0427
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
kbt03400
]
BCUE_0427
Enzymes [BR:
kbt01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BCUE_0427
DNA replication proteins [BR:
kbt03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BCUE_0427
DNA repair and recombination proteins [BR:
kbt03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BCUE_0427
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DNA_pol_IIIA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF49633
UniProt:
M1LAY9
LinkDB
All DBs
Position
216628..220107
Genome browser
AA seq
1159 aa
AA seq
DB search
MSYDFKSFVHLRVHSEFSIVDGIVRIEELINLVKDSDQPAVALTDLSNVFGIIKFYKAAR
ASGIKPIIGCDVWLTNDKNRDRPFRVLLLVCNHEGYLNLCSLLTKSFLCNQYNGRVELRK
EWLSGQNGLIVLSGGILGDIAYALEINNQVLALDLAKQWKLMFPNSFYIELQRAGFPGED
NYNHMVLELASKLNLPVVATHPIQFLRPSEFQSHEVRVCIAEGSHLSDPKRVSRFREEQY
FLNSEKMFNMFSDIPSAILNTVEIAKRCSLTLRLGIPNLPKFEIDAKYSLDDYLILMAEM
GLKRRFDFLGNNKINKKIYHERLREECGTINQMGFAGYFLIVQDFINWGKNNGVPVGPGR
GSGAGSLVAYALGITDINPMDYDLLFERFLNPERVSMPDFDIDFCQDNRDRVIDYVKSKY
GHDAVSQIATFGTFGAKAVIRDVGRVLGIPYSLCDGLSKLIPFSVSEQWTLDKVLSSDAI
FKNRYEKEEEVKTLIDIAKPLEGLARNVGMHAGGVLIAPGKLTDFCPLYCQPGQENSLVS
QFDKDDVESSGLVKFDFLGLRNLTVLDWSASYVRQCNKGMDDFSVISLPLDDKETYDLLS
SGNTVAVFQLESKGMRELLKRLKPSNFEDIIAVLALYRPGPLESGMVNDFVSRKHGVSSI
NYFHSDLENVLKSTYGVIVYQEQVMLISQIIGGYSLGSADLLRRAMGKKDPEEMAKHRII
FEKGAVNNGYRSDLAVKLFDLMEKFAGYGFNKSHSAAYALIAYQTAWLKTHHPAEFFSAT
LSSDMDDTDKIQVIFRDAKKNNIKILPPDINLSSFRFEPVVNFTDENKEIAIRYGLGAIK
GAGKSAIDDVVRSRKNNGPFSDIFDFCYRMFKILNRRAIESLIKSGAFDFSNSNRAEVLA
SLNIALEIAEHRNTNVNQSSLFEDDYEQEIPRLRKSIDNIAEWDLLNKLTEEKTAMGYHF
SGHLFEYWRDEIRQIIPTTLSKIRSSKQSQLVCGILVSIKTITTRRGKMVLALIDDDTNQ
VEIVTHQDFYEKNKNDLREDNLIAAKVIVSDDSYSNSFRIVVEQIYSIDDIRSYMAKAVK
ISIDSDINLESLQSLLKSICSKKEQDKCRVPVYVAYTNLDGKFSCTVKLGDNWRVIVNNE
FLLKLRSFLGGKGSVEILY
NT seq
3480 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttatgattttaaatcttttgtgcatctgcgtgtacattcagaattctctattgta
gatggtatagttcgaatagaagaattgattaacttagtaaaagattctgatcagccagct
gtagccttaacagacttatctaatgtttttggtatcataaagttttataaagcagctcgt
gcttcgggtataaaacctataattggttgtgatgtttggttaactaatgataaaaatagg
gataggcctttccgtgtcttattgcttgtttgtaatcatgaggggtacctcaacctgtgt
tctttacttacaaagtcttttttatgcaatcagtataatggtagagttgaattgcgtaag
gagtggttatcaggacagaatggcttaatagttctttcaggtggtattcttggtgatatt
gcatatgctctagagattaataatcaagttttagctttagatttagcaaaacaatggaaa
ctaatgtttcctaattctttttacatagaattacagagggctggttttcctggagaagac
aattataaccatatggtattagaattggcctcaaaattaaatttgcctgttgttgctact
catcctattcaatttctaaggcctagcgaatttcagtctcatgaagttagggtttgtatc
gctgaaggctctcatctttcagaccccaaaagagtaagtcgtttcagagaggagcaatat
ttccttaattcagagaagatgtttaatatgttttctgatataccttcggcgatacttaat
acagttgaaatagctaaacgttgcagtttaacactgcgcttagggattcctaacttacca
aaatttgaaatagatgccaaatattccctggatgattatttgatactaatggctgaaatg
ggtttaaagagaagatttgattttttaggaaacaataaaatcaataagaagatatatcat
gaaagattgcgcgaagaatgcggcactataaatcagatgggatttgctggctacttccta
atagtacaggattttattaattggggtaaaaataacggggttccagtaggtccaggtcgt
ggatcaggcgcaggatctttagtagcttatgctttgggtattactgacatcaatcctatg
gattatgatttgctttttgagcgttttctaaatcctgagcgagtatcaatgcctgatttt
gatattgatttttgccaagacaatcgtgatcgtgtgatagattatgtaaaatcaaaatat
ggccacgatgctgttagtcaaatagccacgtttggtacttttggggctaaggcagttatt
agagatgttggaagagttttaggaattccttactcgttatgtgatggcttgtcaaaattg
attcctttcagtgtatcagagcaatggacattagataaagtcttatcgtctgatgctata
tttaaaaacagatatgaaaaagaagaggaagttaagacattgatagatattgctaagcct
ttagagggattagctcgcaacgttggtatgcatgcgggaggtgttttaattgctccaggc
aagttaactgatttttgtccgttatattgtcagccagggcaagagaatagtcttgtttct
cagtttgataaagatgatgttgaatcttctggtctagttaaatttgactttttagggctg
agaaatttaactgttcttgattggtcagcaagttatgttaggcagtgtaataaaggaatg
gatgatttctctgttatttcactaccattagatgataaggaaacttatgatctattatct
agtggtaatacggttgctgtatttcagttagaatcaaaaggaatgagggagttgctaaaa
agattaaagcctagtaattttgaagatattatagccgtgctcgccttatatcggcctggt
ccactggagtcaggaatggtaaatgatttcgttagtcgtaagcatggggtctcaagcata
aattattttcatagtgatttggagaatgttcttaaaagcacttatggagttatcgtttat
caagagcaagttatgcttatttcgcagataataggtggttattctctcggtagtgctgac
ttgttgcgtagggcaatgggtaaaaaagatccagaagaaatggctaagcatcgtattatt
tttgaaaaaggagctgttaataatggttaccgctcagatcttgccgtaaaattatttgac
ttaatggagaaatttgcagggtatggatttaacaaatctcattcagctgcctatgctttg
atcgcatatcaaacagcttggctgaaaactcatcatccagcggaattcttttctgctacc
ctttcatctgatatggatgacacggataaaatacaagtaatatttcgcgatgcaaaaaag
aacaatataaaaattcttccgccagatataaatttatctagttttaggtttgagccagtt
gttaattttacagatgaaaataaagaaattgctatacgatatggtttaggagcgataaaa
ggagcaggtaaatctgctattgatgatgttgtaagatctagaaaaaacaatgggccattt
agtgacatatttgatttctgttacagaatgtttaaaattctaaatcgtcgtgcaatagaa
tctttgattaagtcaggagcttttgatttttctaattctaacagggctgaagtcttggct
tcattaaatatagcattagaaatagcagagcataggaatactaatgttaatcaatcatct
ttattcgaagatgattatgaacaagaaatacctagattgcgaaagagtatagataatata
gctgagtgggatttactaaataagcttactgaagagaaaactgcgatgggatatcatttc
agtgggcatttatttgaatattggcgtgatgaaataagacagattataccgaccacttta
tcaaaaatacgatccagcaagcaatcacagttagtatgtggcatacttgtgtcaataaaa
accataacaactcgtcgcgggaaaatggttttagccttgattgatgatgatacaaatcaa
gttgaaatagttacacaccaagacttttatgaaaaaaacaagaatgatttgcgcgaggat
aacttaatagctgctaaagtcattgttagtgacgattcgtattctaatagttttcgaatt
gttgtggagcaaatatatagcattgatgatattaggtcttacatggctaaagccgtaaaa
atatctatagatagtgatattaatttggaatctttgcagagcttattaaagagcatatgc
tcaaaaaaagaacaagataaatgtcgtgtaccagtttacgtggcttatacaaacctagat
ggcaaattttcatgtactgtaaaattaggtgataattggagagttattgttaataatgag
tttttgttaaaattacgatcttttttaggtggtaaaggatctgttgagatcttatactga
DBGET
integrated database retrieval system