KEGG   Candidatus Kinetoplastidibacterium blastocrithidiae TCC012E: BCUE_0502
Entry
BCUE_0502         CDS       T02463                                 
Name
(GenBank) TrmA family RNA methyltransferase
  KO
K03215  23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase [EC:2.1.1.190]
Organism
kbt  Candidatus Kinetoplastidibacterium blastocrithidiae TCC012E
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:kbt00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:kbt03009]
    BCUE_0502
Enzymes [BR:kbt01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.190  23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase
     BCUE_0502
Ribosome biogenesis [BR:kbt03009]
 Prokaryotic type
  rRNA modification factors
   23S rRNA modification factors
    BCUE_0502
SSDB
Motif
Pfam: tRNA_U5-meth_tr Methyltransf_31 Methyltransf_15 TRAM Methyltransf_25 TRM5-TYW2_MTfase Cons_hypoth95 BpsA_C Methyltransf_ANTKMT UPF0020 Methyltransf_32 Methyltransf_12 RrnaAD Methyltransf_11 Ubie_methyltran Methyltransf_23 MethyltransfD12 MTS N6_N4_Mtase FtsJ
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGF49700
UniProt: M1MD62
LinkDB
Position
296392..297711
AA seq 439 aa
MEYNLKKTLRIESIDAKGIGVSHDENGKVVFVDGSLPGELVQAKIIKRKSSYDIAVLEDI
IISSPHRVIPRCKYFNICGGCSIQHLDAAAQVAIKQRVLEDSFCHIGKVRPGFLFCPVYA
ETWHYRDRSRLFVKFLQNKDKLLLGFYERKSNRVINILNCPILSRKINILLSPIREVLHK
LTIRNSISQVEIAVGENSVSLLIYNSCTPSRYDIIDLVSFGMDNSVDVWLHSGDIIYKVG
DCSYEDTSYSLPEFEISIPFRPKNFTQINHKLNRILVSKVVGLMDIKSSDNVLDLFCGLG
NFTFPIARMANKVLGIDIDDNLICKANSIAVNYNLQDVVSFIKLDLFSLKDSFFNNLDPF
DIMLIDPPRSGADLIVRLLISLANNKRPRRVVYVSCNPHTLARDSYLLVTNGGYRIVCSG
IINMFPHTSHVESITVFDT
NT seq 1320 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttggaatataatttgaaaaaaacgttacgcattgaatctattgatgctaagggcataggg
gtatcacatgatgaaaatggcaaagtggtttttgtggatggttctttgccaggtgaatta
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DBGET integrated database retrieval system