Candidatus Kinetoplastidibacterium crithidiae (ex Angomonas deanei ATCC 30255): CKCE_0698
Help
Entry
CKCE_0698 CDS
T02413
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
kci
Candidatus Kinetoplastidibacterium crithidiae (ex Angomonas deanei ATCC 30255)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kci00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kci02000
]
CKCE_0698
Transporters [BR:
kci02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CKCE_0698
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ83112
LinkDB
All DBs
Position
725779..729189
Genome browser
AA seq
1136 aa
AA seq
DB search
MLPIFSIFVAVICGMVFWVVFSSSGSKMLVGVVANHFGGRVSIVNGTVINGLNLKNLHLT
VLNSEIEIENLHINIKLESLFRGLFKITDLSISSLCIEVLEDRGNANKYKNNTVTSDNKS
FFAIEVDNINIENILLKYSNKFLGDVQLRKLFANFKIDQKKSVCSINNLEIKTNRFDSNL
TGYLAFESQKSIVFNSELRLENKINSFMSTQDDAYGFLNPALFDSSVQVKATGSFNQIIM
AINAENSEMVANSAIVLQRRSGFEIKKVSIDLYQFRNSGSISFMANNIRNEINVNLSLSS
LDSSLFFVENIPRVIIGLNSDVKIDFNNNKTTDVSVDFIIDDESKWGDSPMNGYFGIGFK
IFNNVNYLNFLDILERCLVNRLKGSISIGSNNVEINSCTEISENILSISVLMPDIKKIWY
KFSGSIDMKINFSGDLSSYYGEVKAFFDKVRFSDFYKWKDLKIQTDFKGTRNKDKNIAWD
LDISRLNVKLDNLRVTLIDLLTFKLLIENYSEWYWSINQFNMIFESIDNGKVLFNSESCR
GTQNGWETHGQFKNSVFDSSIFVDLAKILGINLNLPKIERDMPDNSKKIFMYGSWNVQYG
KNLSGDFSLRIYENDDKEQLDQLFLLDINLEHIKNVTNKLDMLLKIQDPKIGIIDGFCSM
FFSIDSRGLIILDKEKIFAKLNADIKDLSVFNYFLKDNVEIGGAAKSLIEINGFVDKELV
ASGFVNGEKLKLIRVDDGIRLLDGSLDAYLLNSQLIINRLFFPANYRVIPQDIRVRDHLT
LINKNITEGHISASGNIDFSRNYSRVEFDVRQFPILQRSDCYAVISGRLFTDLFYKKIYV
GGKLLIDTGSVCLDSFRTCSSLDDDVKLDSFILESHKENSRDIEVKSDLALDLGDRFYLT
GLGFDTGLLGSLRLSLKNDGRFSCLGTVTASENGVIEFYGQRLSFNRGNLTFQGRVDNPL
IDVEAVRLGKQVEPGVKISGTLQHPIIDLISYPNVSDVEKISWLLLGRGPDEQTMDISFL
LSVGAAFLSGGQPFYRQFGLSNFDIRSGSIGKSGSILPDHIVAGGINKDSYNDFSTQFVV
LSKQFANGINLSLEQSLVASETVARISYRLSRRWSFDMKGGSVNGVAFIYRTFFDD
NT seq
3411 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaccaatcttttccatttttgtagctgttatatgtggtatggttttttgggttgtt
ttttccagcagtggtagcaaaatgctagttggtgtcgttgctaatcattttggaggtaga
gtatctattgttaacggtacagttattaatggtttgaatttaaaaaacttgcatttaact
gttttaaactcagaaatagaaatagaaaatttgcatattaacataaaactagagtcttta
tttagaggtctttttaagattactgacttgtcaatttcttcgttatgcatagaggtattg
gaagatagaggaaatgcaaataaatataaaaataatacagttacatcagataacaaatct
ttttttgctatagaagtagataatattaatatagaaaatattcttctaaagtatagtaat
aaatttcttggtgatgtgcagttaagaaaactatttgctaattttaagattgatcaaaag
aaatcagtatgttctataaataatttagaaattaagactaatagatttgatagcaattta
actggatatttagcatttgaaagtcaaaagtctattgtatttaattcagagcttaggctt
gaaaataaaattaatagttttatgagtacgcaggatgatgcatatggttttttgaatcct
gctttatttgattcttcagtacaagtcaaagccactggttcttttaatcaaattattatg
gctataaatgctgagaatagtgagatggtagctaatagtgcaattgtcttacagagaaga
tcaggttttgaaattaagaaagtaagcattgatttatatcaatttaggaattctggttct
atttcctttatggcaaataatataagaaatgaaataaatgttaatctttctttatctagt
ctagatagtagtcttttttttgtggaaaatatccctagggtcataattggtctgaactct
gacgtcaaaatagattttaataataataaaacaacggatgttagtgtcgattttataatt
gatgatgaaagcaagtggggcgatagcccaatgaatggttattttggcattgggtttaaa
atttttaataatgttaattatcttaattttttagatattttggagagatgccttgttaac
aggctcaaaggttcaataagtattgggtctaataacgttgagattaatagttgtactgaa
attagtgaaaatattttgagtattagtgttttaatgcctgatattaagaaaatttggtac
aagtttagtggttctattgatatgaaaattaacttttctggagatttgtccagctattat
ggagaagttaaagctttttttgataaggtaagatttagtgatttttataaatggaaagat
ctaaagatacaaacagattttaaaggcactcgtaataaagataagaatatagcttgggat
ttagatatttcaagattaaatgttaagttagataatcttagggtaactcttatagattta
ttaacctttaaattgcttattgaaaattattcagaatggtattggtccataaatcaattt
aatatgatttttgagtctattgataatggcaaggttctttttaatagcgaaagttgtaga
ggcacacaaaatggttgggaaacgcatggacaatttaaaaattcagtgtttgatagttct
atatttgtggatcttgcaaaaatacttggcatcaatcttaatttgcctaaaattgaaaga
gatatgcctgataattccaaaaaaatatttatgtatggtagttggaatgttcaatatgga
aaaaatttatctggtgatttttctttaagaatttatgaaaatgatgataaagaacaatta
gatcaattgtttttattggatataaatctagaacatataaaaaatgtaactaataaatta
gatatgttattaaaaatacaagatccaaaaattggaataattgatggtttttgctctatg
ttttttagtattgattcgagaggattaataattttagataaagaaaaaatttttgcaaaa
ttaaatgctgacataaaagatttatctgtatttaattattttttaaaagacaatgtagaa
attggtggcgcagcaaaaagccttatagaaataaatggttttgttgataaggaattagtt
gctagtggttttgttaatggcgagaagttaaaattaattagagtggatgatggaatcagg
ttattagatggtagtttagatgcttatttattaaatagccaactcattataaatcgtctc
ttttttcctgctaattatagagtgatacctcaagatatacgtgtgcgcgatcatttaact
ttgataaataaaaatattacagaaggtcatatatcagctagtggtaatatagacttttct
cgtaattatagtagagtagaatttgatgtgcgacaatttcctattttacagcgttcagat
tgttatgctgttatttcaggaagattattcacagatttattttataaaaaaatatatgtt
ggtggaaagttactaattgatacaggatcagtatgtttagattcatttagaacctgctct
tctttagatgatgatgtgaaattagattcatttattctcgagtcccataaagagaactct
agagatatagaagtaaaatctgatctagcacttgatttaggagatagattctatttaact
ggattggggtttgatacaggtttgttaggctcacttagattatctcttaaaaacgatggt
cgtttttcttgtctaggtacagttacagcttctgagaatggagtaatagaattttatgga
cagaggttaagttttaatagaggaaatcttactttccaaggacgtgtagataatccatta
attgatgttgaagctgttaggttaggtaagcaggtagagcctggtgtgaaaatatcaggc
acgttacaacatccaattatagatttaatatcttaccctaatgttagcgatgttgagaaa
atatcatggttgttgcttggaagaggtccagatgaacaaactatggatattagtttcttg
ctttcagtaggggctgcttttttaagtggaggacaacctttttacaggcagtttggttta
agtaattttgatattcgtagtggttcaatcgggaaatctggtagcattttaccagaccac
atagtagctggtggtattaataaagatagttacaatgatttttcaacgcagtttgttgtt
ttaagcaaacaatttgccaatggtataaatttaagtttagaacaatcgttagttgctagt
gaaacagttgctaggattagttataggctttctcgtcgttggtcttttgatatgaaaggt
ggttctgtaaatggagttgcttttatttaccgaactttttttgatgattag
DBGET
integrated database retrieval system
