Candidatus Kinetoplastidibacterium crithidiae TCC036E: CDEE_0558
Help
Entry
CDEE_0558 CDS
T02464
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel
KO
K16053
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
kct
Candidatus Kinetoplastidibacterium crithidiae TCC036E
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kct00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kct02000
]
CDEE_0558
Transporters [BR:
kct02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CDEE_0558
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
IL3
SurA_N_3
TgpA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF47591
UniProt:
M1LU06
LinkDB
All DBs
Position
335506..336678
Genome browser
AA seq
390 aa
AA seq
DB search
MKLDEIIRMIEFYIPTLGLIKIISCLFCLIIISFVVQWGISRLLVWLTNKVINIDGYGKW
HHELYRYNVYKNILRSVSFFVISEGIKFVYHIGNIAEYISRFASAIIWIYIFAALIGLLS
VIQSIYSARARSIKVYIQVGKLLLIVIGIVLVLSVLINRSPLWMISGLGALSAVLLLVFK
DTLLSLVAGTQLTTNDMLRIGDWIEMPQSNADGYVRDIALHTVKIQNWDNTVTTVPTYKL
FAESYRNYRQMFESGGRRIKRVIYIDISSIKIMNKVEITELMKISLLSNYLELNHKDQDH
FMNISLFRYYITAFLKSHDELRQDMPMLVRMMEQKSEGIPIEIYCFTALTAWVEHERIQG
EIFDHINSMIYKFQLRLYQKPSMHNFMQCD
NT seq
1173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcttgatgagataattagaatgattgagttttatattcctacattaggattaatt
aaaataatttcatgtttattttgtttaattattatttcatttgtagtgcaatggggtata
tctcgtttattagtttggttaacaaataaagttattaatattgatggttatggaaagtgg
catcatgaattatatagatacaacgtgtataagaacatcttgcgttctgtgtcctttttt
gttatttctgaaggaattaaatttgtctatcatattggaaatatagctgaatatatttct
agatttgctagtgctattatatggatttatatatttgctgctcttatcgggttattaagt
gttattcaaagcatatattctgctagagctagatctattaaagtgtatatacaggtaggt
aagctactattaatagttataggtatagttttggtattatctgttcttataaatcgttct
ccattgtggatgatttctgggttaggtgctttatctgctgttcttttacttgtgtttaaa
gatactctcttgtctttagtagcaggcactcaattaacaacaaatgatatgcttaggata
ggagattggattgaaatgcctcaatctaatgctgatggttatgttagagatatagcttta
cacactgtaaagatccaaaattgggataatacggttactactgtgcctacttataaatta
tttgcagaaagttatcgtaattatagacaaatgtttgaatctggtgggaggagaataaaa
agggttatatatatagatatatccagtattaaaattatgaataaggttgaaattactgaa
ttaatgaaaatatctttattatctaattatttagaattaaaccataaagatcaagatcat
tttatgaatatatctttgtttagatattatataactgcttttttaaaaagtcatgatgag
ttgcgacaagatatgcctatgttggttagaatgatggaacaaaaatctgaaggtattcct
atagaaatatattgttttactgcattaacagcatgggtcgaacatgagcgtatacaagga
gaaatctttgatcatattaattctatgatatataaatttcaattgcgtctttatcaaaaa
ccatcaatgcataattttatgcaatgtgattag
DBGET
integrated database retrieval system