Candidatus Kinetoplastidibacterium desouzai: CDSE_0302
Help
Entry
CDSE_0302 CDS
T02465
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein of the DUF490 family
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
kde
Candidatus Kinetoplastidibacterium desouzai
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kde00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kde02000
]
CDSE_0302
Transporters [BR:
kde02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CDSE_0302
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF46646
UniProt:
M1LR56
LinkDB
All DBs
Position
92948..96412
Genome browser
AA seq
1154 aa
AA seq
DB search
MTEYHKRSQILFSWFLPLCSISIAIFCGMLFWVVCSNNGSRLFVDVAANNLGYKVSNIEG
NFLRGLKLGRLELNNTESKTHIEDIKFKFEFSSLFSGVLNISEFSIGLIDISFLKNNRKS
TNNYLISKFRFPFSINIEQLELKEIVVSDVSSFVSDTAHFKDISAAISYSGQTISAFIRN
LDVVADKATIRLNGFLNIRDLSKDVLFDANFTLINKYNYSVAKNNNISDFINHNIFNSTI
NINASGSYDLISIYVDAHNKDLSIDGNVIFIPKSAFKIYSAEINLKQSDDCGSAYLKISS
DKEENNEDRQTIKSVFLLDKLTSSTFFNQNFPSFIISLKSDYQVDLKKDEIINSVFNLNI
IDDSKWNNNPLYGSINLALKPYPKKEIYCDIERILGCIKNLDVVLSLGSNKVSILGSSEN
KLNSLIIKALMPNINNFYDNFKGDINLEIDLNGSLLDHHGDISASLNRVKVNNLYKWENI
NLQTSFHGTYNKNKFKKNLWNADIKSLNIILDNISFSALSSLNFNFLINDSCWFFSPFSL
AIKSNKKGEILLNSETLSGNHRTLETSGNFNSFMSDGLIFTELLKTIGWDCSIPGIDRDS
FGKTEFLPVCGFWDVEYKDILQGNLEVKVYENDKQKDVFPVIDLCLNAKKISSNMMDING
YLKIEDQQVGSFDGVFSLGLFIDKNGVFVEREKVFINIMGDIKDISILNYFFKDNIEVGG
MINCKLEINGIVDTDIKAKGYINATQLKLIRVDDGIRLVNGSLESRILNGDFIVDNLFFP
ANHRIMAYDAHVSEKIISLKKHIKDGYIKTVGSLNIFDRSGKFNVDVKQFPIFQRSDRYA
VVSGKIKSDIASGFGKFYIDGNLVVDAGWINLESLNMGSSLDDDVLLCSFGKSSNKKDSS
KTLQTKVNLLCDLGNKFYLTGLGIETSLLGSLKLSINDDARPFCLGTLRAKDGIMEIYGQ
RLCFNRGNITFQGSLDNPLIDIEAMRLGKQVESGIRVSGTLQQPMIDLVSYPDVSEVEKL
SWLLLGRAPDDAMDLTFLLSIGGAFLSGGQPFYRLFGLSDFSIRRGVIGRSGSILPDHTV
AGGIGKDAYNDLSTQFLVASKEFSNGVNLSLEQSLVGSETVARISYGLSRCWSFDIKCGS
VNGIAFIYREFFEN
NT seq
3465 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactgaatatcataagagatctcaaattttatttagttggtttttgccattatgctct
atttctatagctatattctgtggtatgttattctgggtagtctgttctaataatggtagt
agattatttgtagatgttgctgctaataacttaggttataaggtttcgaatatagaggga
aattttcttcgtggtttgaagttaggtagattggagttaaataatacagaatcaaagaca
catattgaagatataaaatttaaatttgaattttcttctttgtttagtggagttttgaat
atttctgagttttcaattggattaatagatatatcttttttaaaaaataataggaaatca
actaataattatcttatttcaaaatttagattcccattttctataaatatagaacaatta
gaactaaaagaaatagttgttagtgatgttagttcttttgtgtctgatactgcacacttc
aaagacatatctgctgctatatcctatagtgggcaaacaataagtgcttttattagaaat
ttagacgttgttgcagataaagctactataaggttgaatggttttttaaatataagagat
ttatcaaaagatgttttgtttgatgcaaatttcactttaattaataaatataattattct
gttgccaaaaataataacatatccgattttataaatcataatatatttaattctacaatt
aatatcaacgcttctggatcatatgatttaatctctatttatgtagatgctcataataaa
gacttatctattgatggaaatgttatttttatacctaagtctgctttcaaaatttatagt
gctgaaatcaatttaaaacagtcagatgattgcgggtcagcttatttaaaaataagttct
gataaggaggaaaataatgaagatcgccaaacaataaagagtgtttttttattagataaa
ttaactagtagtactttctttaaccagaatttcccaagttttataattagtttgaagtct
gattatcaagtggatctaaaaaaagatgaaataattaatagtgtttttaatcttaatatt
attgatgatagtaagtggaataataatcctttgtatgggtcaattaatcttgcattgaag
ccttaccctaagaaagaaatttattgtgatattgaacgtatattaggttgtataaaaaat
cttgatgttgtcctaagtcttggttctaataaagtatctattctaggcagctctgaaaat
aaacttaatagcttaattattaaagccttaatgccaaatataaataatttctatgataat
tttaagggtgatattaatttagaaattgatttaaatggtagtttgttagatcatcatgga
gatatatcagcttctttaaatagggttaaagttaataacttatataaatgggaaaatata
aatttacaaacatcatttcatggaacatataataaaaataaatttaaaaaaaatttatgg
aatgctgatataaaatctttaaatattattttggataatattagtttttctgctttatct
tctttgaattttaatttcttgataaatgattcttgttggtttttctccccatttagtttg
gctattaaatcaaataaaaaaggtgaaattcttctaaatagtgagactttgtctggaaat
catagaacacttgaaacgtcaggtaattttaacagttttatgtcagatggtttgatattt
acagaactgttaaaaactattggttgggattgtagtattcctggaatagatcgagattct
tttggaaagactgaattcttacctgtttgtgggttttgggatgttgaatataaagatatt
cttcagggtaatttagaggtcaaggtttatgaaaacgataaacagaaagatgtttttcct
gtgattgacttatgcttaaatgcaaagaaaatatctagtaatatgatggatattaatgga
tatttaaagattgaagaccagcaagttggttcttttgatggcgttttttcattgggtctg
tttattgataaaaatggagttttcgtagaaagagaaaaagtttttataaatatcatgggt
gatataaaagacatatcaattttaaattattttttcaaagataatatagaagttggaggt
atgattaattgcaaattagaaataaatggtattgtcgatacagatattaaggctaaaggc
tatattaatgccacacaattaaaattaattagagttgatgatggaattagattggttaat
ggtagtttggaatcacgtattttaaatggtgattttatagttgataatttattttttcct
gccaaccatagaattatggcatatgatgctcatgttagtgagaagattatttcgttgaaa
aaacatatcaaagatggttatattaagactgttggtagtttgaatatttttgatagatct
ggaaaatttaatgtagatgtaaaacaatttccaatttttcagagatcagatcgttatgct
gtcgtttctggtaaaataaaatcagatattgcttctgggttcggtaagttttatattgat
gggaatttggtagttgacgctgggtggataaatttagaatctcttaatatgggttctagt
ttagatgatgatgttttattgtgttcttttggcaaaagttcaaataaaaaggacagttct
aaaaccttgcaaactaaggttaatttattgtgtgatcttggtaataagttttatttaact
ggcttaggtatagaaactagtttgttagggtcattaaaattgtctattaatgatgacgca
agacctttttgcttaggtactcttagagccaaagatggcatcatggaaatttatggccag
agattatgttttaatagaggtaatataactttccagggaagtttagataatccattaatt
gatattgaagcaatgaggttagggaaacaagtagaatcaggtattagagtttcaggaaca
ttgcaacagccaatgatagatttagtatcttatcctgatgttagtgaggtggagaaatta
tcgtggttgttattaggaagagcacctgatgatgctatggatttaacatttttattatca
ataggaggagcctttcttagtggggggcaacctttttatcgtttatttggattaagtgat
tttagcattcgaagaggggttataggaagatctggtagtattctgccagatcatactgta
gcaggtgggattggtaaagatgcatataatgatttatcaactcagtttttagttgcaagc
aaagaattttctaatggggttaatcttagtttagagcagtctttagtgggtagtgagact
gtggctagaattagctatgggttgtcacgttgttggtcatttgatattaaatgtggatct
gtaaatgggatagcttttatttatagagagttttttgaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system