Dokdonia sp. 4H-3-7-5: Krodi_0113
Help
Entry
Krodi_0113 CDS
T01484
Name
(GenBank) conserved repeat domain protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
kdi
Dokdonia sp. 4H-3-7-5
Pathway
kdi02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kdi00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Krodi_0113
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7507
Big_9
Cadherin_5
SprB
Cadherin_4
CshA_repeat
CHU_C
RibLong
DUF7617
Y_Y_Y
DUF11
DUF4926
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE18103
UniProt:
F4AXI6
LinkDB
All DBs
Position
complement(121527..131624)
Genome browser
AA seq
3365 aa
AA seq
DB search
MKRKLQFASLRSLTMLLLIGSFSVLGTFEMHSQVIGQQEASITQGVTFQWEDDQDVNGDN
DIDNTENNRSATIQSITVGNDVFNTFVAPSGYQLTRLGGNGNIAARHSRNGIVLNRTTPP
FSGEVIGTSASATFDPTDTGSAWDNAALAAFQDKNLNHYFTSNGNGQNICGNFSGVVDTG
NAQKQTLFYNPPIPSNQDGIIAITERGGNNCFYIRFYGTKLGSNTETILGDTFVRTSGDL
RGGDGPNPPAPGSDYWESDREIENSQSIAIALFELNSVAPTGSKITRVEFVAASLDDGDG
KLFILQKYAVDQLEIGCLNEKFEGNIDLSNNVPQGSTYSVVSGPSPAGEAFNLNSNGTFS
YTPPAGYTGSVVFEYQVCLPAPNSSVCDTAFVTLDYVSPPEAAIIDLDCNSNGTTNLIVT
SPLGNNLEYSINNGPFQSDTTFSNLSEGSYVVTVRDKNTGCSQASVSGFVIENLEVAIPI
DVADVSCFGGNDGAINLEPSGGKAPYEFEWSNGATTEDLSGLSAGTYTVVVTDAYGCELE
ATAVVSGPAKAVSIKPNTVITAVSCFEGNDGAINITPDGGTPPYTYVWSNGATTQDISNL
EAGSYTVTVIDANNCEAESTFSVEQPTAALSITDTITNVLCNGDDSGAVQLTVSGGTAPY
TYEWSDGSTTANLEDVTAGSYSVVVRDANDCEIQESFTITEPDSPLSINLTRENATTAQN
CADGTAIAAVTGGTAPYTYLWSNGATVATISNLADGTYSVTVKDANGCEITQSVVVDCIN
TCDAVIAIGTVRDVLCAGEETGSTTVSASSEANPDALFTFTWSNGDVDAGVTSSTLDNIG
AGVYTVSVTIDGTVCQPVEQSVTISEPSSAVGVTIVTEDETGPGLSNGEAKATATGGVAP
YTYSWSTGATTAEINNLSPGDYTVEVTDANGCTVENTVTINPGSCNNLAITTGVEDVTCN
GFSDGSIISTTTGGNGPFTYSWSNGATTENINNVTAGSYTVTVTDSFTNCTAQSTVTVNE
PTVLSAGIAVNNVLCFGESTGSLNLTVSGGTPDYTYEWSGGQTIEDLTALPAGNYSVIVT
DGNGCTTTAQAVISQPASAVTADVSSTNENGATANDGTATVLPEGGTMPYTILWSNGETT
NTIDGLDAGDYAVVVTDANGCTYEETITVASTNQVPAPVNDSATTSEDTAVAINVTDNDS
FGSDGPNDSVIVITEQPENGSVTVDDGGTPNDPTDDTVLYTPEPDFNGTDTFEYEITDSN
GDSETATVTVVVTPVDDVVSDTSNTDEDVPVEIDVLGNDTFDENADVAITDVTDPANGTV
EINDNGTVTYTPNPDFNGEDTFEYTVTVTNPDGTTTTETAIVTVTVSPIVDVADDAETTP
EDTPVNVDVLGNDTFEGTNNEVTDVTDPANGTVVINDDGTVTYTPDPDFNGEDTFDYTVT
VTNPDGTTTTETATVVVTVTPEEDVMDDAATTPEDTPVDIDVLENDGFDPAADVAVTDVT
DPANGTVVINDDGTVTYTPDPDFNGEDTFDYTVTVTNPDGTTTTETATVVVTVTPEEDVM
DDAATTPEDTPVDIDVLENDGFDPAADVAVTDVTDPANGTVVINDDGTVTYTPDPDFNGE
DTFDYTVTVTNPDGTTTTETATVVVTVTPEEDVMDDAATTPEDTPVDIDVLENDGFNPAA
DVAVTDVTDPANGTVVINDDGTVTYTPDPDFNGEDTFDYTVTVTNPDGTTTTETATVVVT
VTPEEDVMDDAATTPEDTPVDIDVLENDGFDPAADVAVTDVTDPANGTVVINDDGTVTYT
PDPDFNGEDTFDYTVTVTNPDGTTTTETATVVVTVTPEQDVMDDAATTPEDTPVDIDVLE
NDGFDPAADVAVTDVTDPANGTVVINDDGTVTYTPDPDFNGEDTFDYTVTVTNPDGTTTT
ETATVVVTVTPEEDVMDDAATTPEDTPVDIDVLENDGFDPAADVAVTDVTDPANGTVVIN
DDGTVTYTPDPDFNGEDTFDYTVTVTNPDGTTTTETATVVVTVTPEEDVMDDAATTPEDT
PVDIDVLENDGFDPAADVAVTDVTDPANGTVVINDDGTVTYTPDPNFNGEDTFDYTVTVT
NPDGTTTTETATVVVTVTPDNPSLDLFKEGNYEDTNEDGVVNLGDSIIYNFIVFNNGDVP
LSNITLTDELVEVMGGPIDLEVGESDSMTFTAIYAITQDDINAGAVYNQAIATGEDPAGE
LATDASEDPTGIDPNNPLNDPDCMECTITVLNQDPEIAIVKTGLFNDQNGDGFAQAGETI
TYNFSVTNTGNVTVTNIVVTDPLVTVTGGPIDLVPGTSDDTTFLAEYVLTQEDVDAGLVE
NQALATGQDPNGDDVVDTSDDNSTIEGEEDVTITDLPEDPGMIAIVKTGTFNDEDGDGFA
QAGETITYNFTVTNTGNVTVTNIVVTDPLVTVTGGPIDLAPDAIDATTFVAQYVLTQEDV
DAGMVENQALATGQNPNGDDVVDTSDDDSSVEGEEDVTVTDLPEDPGMIAIVKTGTFNDE
DGDGFAQAGETITYNFTITNTGNVTVTNIVVTDPLVTVTGGPIDLAPDAIDATTFVAQYV
LTQEDVDAGMVENQALATGQNPNGEDVVDTSDDDSSVEGEEDVTVTDLPEDPGMIAIVKT
GTFNDEDGDGFAQAGETITYNFTVTNTGNVTVTNIVVTDPLVTVTGGPIDLAPDAIDATT
FVAQYVLTQEDVDAGMVENQALATGQNPNGDDVVDTSDDDSSVEGEEDVTVTDLPEDPGM
IAIVKTGTFNDEDGDGFAQAGETITYNFTITNTGNVTVTNIVVTDPLVTVTGGPIDLNAG
ASDATTFSAIYTITQADIDNGGVTNQALATGQNPDGDDVTDTSDDDSNLEDDETITTFPT
DEGAIALIKTGFFNDESGDGFAQVGETVTYNFTVTNTGNITITNIVINDPLVTVTGGPID
LSAGEVDTDTFSAVYTLTQADVDAGGVTNQAVVTGQNPDGNDVLDTSDDDSNLEDDITVT
DLPQGASISLIKTAVFNDVDGDGFAQVGETITYNFIVTNTGNVTVTNIIIEDPLVNVTGG
PIDLDPGETDSTTFVAIYTIVQSDIALGYVTNQAIATGQDPDGIDVVDISDDNNSVEDDE
TVTNLPIKSSIALEKVGTTVDIDGDGLIQDGEVIQYTFTVTNTGSLPLNNISITDPLVTV
DGGPISLLPGESDSTTFTATYVVTPLDIANGFVLNQAVVNSIDSNGLDVTDLSDDPNNDE
NVDPNMDGNPDDPTLTTFEGVLNIFDLEVFNGISPDGDGINDFFIIEGIDAFPENNVQIF
NRWGVQVFEQDGYTNSPTTGFKGISEGRATISADNLLPAGTYFYLISYQTPDGLRRKSGY
LYINR
NT seq
10098 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaaattacaatttgcttcactccgaagtttaactatgttactcctaataggg
agctttagtgttttaggaacatttgagatgcactcccaagttatagggcaacaagaagcc
tcaattactcagggtgtcacctttcaatgggaggatgatcaagatgtcaatggggataat
gatattgataatacagaaaataatagatctgcaaccatacagtctataacggtaggtaat
gatgtgtttaacaccttcgtggctccttctggttatcaactcacgagattgggtggaaat
gggaatattgctgccagacatagtaggaatgggatagtacttaatcgtactacaccacct
tttagtggagaagttattggtacaagtgcaagtgcaacttttgatcctacagacactggt
agtgcttgggataatgctgctctcgctgcttttcaagataaaaatttaaatcactatttt
acttcaaatggtaatgggcaaaacatctgtggtaattttagtggtgttgtggatacgggt
aatgctcaaaaacagacattattttataatccacctattccttctaaccaagatggtatc
atcgctattacagagcgtggtggtaataactgtttttatatacgtttttatggtactaaa
ttagggtcaaatacagaaacgatacttggagatactttcgttagaacatccggagacctt
agaggtggtgatggtcctaatccaccggcaccgggatctgattattgggagtctgatagg
gagattgaaaatagccaatccattgctatagcgctgtttgaattaaatagtgtggcacct
acaggttcgaaaattacaagagttgaatttgtggctgcatctttagatgatggtgatggt
aaattatttattcttcagaaatatgccgtagatcaattagagataggatgccttaatgag
aagtttgaaggaaatattgatctttcaaataatgttcctcagggttcaacatactctgtg
gtgagtggtccttctcctgccggtgaagcatttaatttaaatagcaatggtacttttagt
tatacaccacctgctggttataccggtagtgtagtatttgagtatcaagtgtgcttgcct
gctcctaactccagtgtgtgtgatactgcatttgtaacgcttgattatgtaagccctcct
gaggctgcaattatagatttagattgtaattcaaacggaactactaatttaattgtcacg
agtccactaggtaataatcttgaatactctataaacaatggaccattccagtccgacaca
actttttcaaatttatctgaaggtagttatgttgtaactgtaagagataaaaatactgga
tgttcccaagcatctgtatctggatttgttatagagaatcttgaagtcgctatacctatt
gatgtagctgatgtaagttgttttggaggtaatgatggagctataaatcttgagccatct
ggaggcaaggcaccttatgagtttgaatggagtaacggagcaactacagaagatcttagt
ggtttgagtgcgggaacatacacagtcgttgtgacagatgcttatggttgtgagcttgag
gcaactgcagttgtaagtggacctgctaaggcagtttcaatcaaacctaatacagtaatt
acagctgtatcttgttttgagggtaacgatggtgctataaatattacgccggatggtgga
actcctccttatacatatgtatggagtaacggtgcgactacacaagatatttctaatctt
gaagcgggatcatatacggttactgttatagatgctaataactgtgaagctgaaagtaca
tttagtgtagaacagcctaccgcagcattgtcaataactgatacaataactaatgtgttg
tgtaatggtgatgatagtggtgctgtacaattaacagttagtggtggtacagctccttat
acttatgaatggagtgatggatcaactacagcaaacttagaagatgttactgctggaagt
tattcggtagtggttagagatgctaatgattgtgaaattcaggagtcttttacaattaca
gagccagactctccactaagtataaatcttactagagaaaatgctacaactgcacagaat
tgtgcagatggcactgctattgctgcagtaacgggaggaacagctccttatacttacttg
tggagtaacggagcaacggttgcaacaatttcaaaccttgcggatggtacgtattctgta
acagtgaaagatgcaaatggttgtgaaataacacagagcgttgttgtagactgtattaat
acgtgtgatgcagttatagcaatagggactgtgagagatgtactttgtgctggtgaggaa
actggttctactacggtaagcgctagctcggaagctaatcctgatgcgctttttactttt
acttggagtaatggagatgtagatgctggtgttacttctagtaccttagataatattggt
gccggggtttatacagtaagtgttactatagatgggacagtgtgccagccggtagaacag
agtgtaacaatatcagagcctagttctgcagtaggagtaacaattgttactgaagatgaa
actggacctggtttgtcaaatggtgaggctaaagcaactgcaactggtggtgtggcacct
tatacgtattcttggagtactggcgcaactactgcagaaataaataacttaagtcctggt
gattataccgtagaggtgacagatgctaatggatgtacagtagagaatactgtgactatt
aatccaggtagttgtaataatttagcaattacgacaggggtagaggatgtgacttgtaat
ggtttttcagatggttctattatatcaacaacaactggaggaaatggaccatttacctac
tcttggagtaatggagctacaacagaaaatatcaataatgtaactgcaggttcatatacg
gttactgttacagattcttttacaaattgtacagctcagtcgactgttacagtaaatgag
cctacagtattaagtgcaggtattgctgtaaataatgtattgtgttttggagaatcaaca
ggttctttaaatcttacagtatctggtggtactccagattatacatacgagtggagtggt
ggtcagactattgaagatttaactgctttaccagctggaaattattcggttattgttact
gatggaaatggttgtacaactacagctcaagctgtaatcagtcaaccagctagtgcggta
acagctgatgtttctagtacaaacgaaaatggtgctacggcaaatgatggtactgcgact
gttttaccagaaggtggaactatgccttacacgattttgtggagtaatggagagactact
aatactattgatggtcttgatgctggggattatgcagttgtcgttacagatgcaaatgga
tgtacatatgaagagactattactgtagcttcgacaaatcaagtacccgctccagttaat
gattcagcaacaacaagcgaagatactgctgtggcgattaatgttacagataatgatagt
tttgggtcagatggtccaaatgattcagtgatagttattacagaacaaccagagaatgga
tctgtaactgttgatgatggtggaactccaaatgacccaactgatgatactgtactttat
actccagaacctgattttaatggaactgatacctttgagtacgaaattacagacagtaat
ggagattctgagacggctactgtaacggtagtggttactccagtggatgatgtagtttca
gatacttcaaatacagatgaagatgtacctgttgaaatagatgtattagggaatgatact
ttcgatgaaaatgctgatgtggcaataacagatgttacggatcctgcaaacggaacagta
gagatcaacgataatggcactgtaacctatactccaaatcctgatttcaacggagaagat
acttttgaatacacggtaacagtaacgaatccagatggaacaactaccactgagacagct
atcgttaccgtaacggtaagtcctattgtagatgtcgctgatgatgcggagactacgccg
gaagatactcctgtgaatgtagatgtgttaggtaatgatacttttgagggtaccaataac
gaggtaacagatgttacggatcctgcaaacggaactgtagttatcaacgatgatggcact
gtaacctatactccagatcctgatttcaacggagaagatacttttgattacacagtaact
gtaacaaaccctgatggaacaacaacaactgaaactgctactgtagtagtaacagtaact
ccagaggaggatgtaatggatgatgctgcgacaacaccagaagatacaccagtagatatt
gatgtattagagaatgatggttttgatcctgctgccgatgtagcagtaacagatgttacg
gatcctgcaaatggaactgtagttatcaacgatgatggaactgtaacttacactccagat
cctgatttcaacggagaagatacttttgattacacagtaaccgtaacaaaccctgatgga
acaacaacaactgagactgctactgtagtagtaacagtaactccagaggaggatgtaatg
gatgacgctgcgacaacaccagaagatacaccagtagatattgatgtattagagaatgat
ggtttcgatcctgctgctgatgtagcagtaacagatgttacggatcctgcaaacggaact
gtagttatcaacgatgatggaactgtaacctatactccagatcctgatttcaacggagaa
gatacttttgattacacagtaactgtaacaaaccctgatggaacaacaacaactgagact
gctactgtagtagtaacagtaactccagaggaggatgtaatggatgacgctgcgacaaca
ccagaagatacaccagtagacattgatgtattagagaatgatggtttcaatcctgctgct
gatgtagcagtaacagatgttacggatcctgcaaacggaactgtagttatcaacgatgat
ggaactgtaacctatactccagatcctgatttcaacggagaagatacttttgattacaca
gtaactgtaacaaatcctgatggaacaacaacaactgagactgctactgtagtagtaaca
gtaactccagaggaggatgtaatggatgatgctgcgacaacaccagaagatacaccagta
gatattgatgtattagagaatgatggtttcgatcctgctgctgatgtagcagtaacagat
gttacggatcctgcaaacggaactgtagttatcaacgatgatggcactgtaacctatact
ccagatcctgatttcaacggagaagatacttttgattacacagtaactgtaacaaaccct
gatggaacaacaacaactgagactgctactgtagtagtaacagtaactccagagcaggat
gtaatggatgatgctgcgacaacaccagaagatacaccagtagatattgatgtattagag
aatgatggtttcgatcctgctgctgatgtagcagtaacagatgttacggatcctgcaaac
ggaactgtagttatcaacgatgatggcactgtaacctatactccagatcctgatttcaac
ggagaagatacttttgattacacagtaactgtaacaaaccctgatggaacaacaacaact
gagactgctactgtagtagtaacagtaactccagaggaggatgtaatggatgatgctgcg
acaacaccagaagatacaccagtagatattgatgtattagagaatgatggtttcgatcct
gctgctgatgtagcagtaacagatgttacggatcctgcaaatggaactgtagttatcaac
gatgatggcactgtaacctatactccagatcctgatttcaacggagaagatacttttgat
tacacagtaactgtaacaaatcctgatggaacaacaacaactgagactgctactgtagta
gtaacagtaactccagaggaggatgtaatggatgacgctgcgacaacaccagaagataca
ccagtagatattgatgtattagagaatgatggtttcgatcctgctgccgatgtagcagta
acagatgttacggatcctgcaaacggaactgtagttatcaacgatgatggaactgtaact
tacactccagatcctaacttcaacggagaagatacttttgattacacagtaactgtaaca
aaccctgatggaacaacaacaactgaaactgctactgtagtagtaacagtaactccagat
aatccatcactagatctatttaaagaaggtaattatgaagatacaaatgaagatggggta
gtaaatcttggagattctattatatacaactttatagtattcaataatggtgatgttcca
cttagtaatattactctaactgatgaattagttgaagtaatgggtggacctatagatctt
gaagttggagaaagtgattcgatgacatttacagcgatatacgctattactcaagatgat
attaatgcaggagctgtatataaccaagcaattgctactggtgaagatccagctggagaa
ttagcaacagatgcatctgaagatccaaccggtatagatcctaataatcctcttaacgat
ccagattgtatggaatgtactattacagttcttaatcaagatccggaaattgcaattgtt
aagactggactgttcaatgatcaaaatggagacggtttcgctcaagctggtgagacaatc
acttataacttctctgtgacaaacactggaaatgttacagtaactaatattgttgtaaca
gatccattagtaacagtaactggaggtcctattgatttagtgcctggaactagtgatgat
actacgtttttagctgaatatgtcttaacacaagaagatgtggatgcaggactagtagaa
aaccaagcacttgcaactggtcaagatccaaatggagatgatgtagtagatacttctgat
gataatagtacaatagaaggggaagaggatgtaacaatcacagatttaccagaagatcca
ggaatgatagcaatagttaagactggaacgttcaatgatgaagatggagatggttttgct
caagctggtgaaacaatcacttataacttcacagtgacaaacactggaaatgtaaccgta
acaaacattgtggtaacagatccattggtaactgtaactggaggtcctatagatttagca
cctgatgctattgacgctactacatttgtagctcagtatgtattaacacaagaagatgta
gacgcaggaatggtagaaaaccaagcccttgcaactggtcagaaccctaatggagatgac
gttgtagatacatcagatgatgatagtagtgtagaaggtgaagaagatgtgacagtcaca
gatttaccagaagatccaggaatgatagcaatagttaagactggaacgttcaatgatgaa
gatggagatggttttgcacaagctggtgagacaatcacttataacttcacaattacaaac
actggaaatgtaacagtgactaatattgttgtaacagacccattagtaacagtaactgga
ggtcctatagatttagcacctgatgctattgacgctactacatttgtagctcagtatgta
ttaacacaagaagatgtagacgcaggaatggtagaaaaccaagcccttgcaactggtcag
aaccctaatggagaagacgttgtagatacatcagatgatgatagtagtgtagaaggtgaa
gaagatgtgacagtcacagatttaccagaagatccaggaatgatagcaatagttaagact
ggaacgttcaatgatgaagatggagatggttttgctcaagctggtgaaacaatcacttat
aacttcacagtgacaaacactggaaatgtaaccgtaacaaacattgtggtaacagatcca
ttggtaactgtaactggaggtcctatagatttagcacctgatgctattgacgctactaca
tttgtagctcagtatgtattaacacaagaagatgtagacgcaggaatggtagaaaaccaa
gcccttgcaactggtcagaaccctaatggagatgacgttgtagatacatcagatgatgat
agtagtgtagaaggtgaagaagatgtgacagtcacagatttaccagaagatccaggaatg
atagcaatagttaagactggaacgttcaatgatgaagatggagatggttttgcacaagct
ggtgagacaatcacttataacttcacaattacaaacactggaaatgtaacagtgactaat
attgttgtaacagacccattagtaacagtaactggtggaccgattgatttaaatgctggc
gcttcagatgctacaacttttagtgctatttatactattacgcaagcagatattgacaat
ggcggagtaacaaatcaagcacttgcaacaggacagaatcctgatggcgatgatgtaaca
gatacttcagatgacgatagtaatcttgaggatgatgaaacaatcactacgttcccaaca
gacgaaggagcgattgcattaatcaagactggattctttaatgatgaaagcggagatggt
tttgcgcaagtaggagagacggtgacgtataacttcaccgtaacgaacacaggaaatata
acgattacaaatattgtgatcaatgacccattagtgactgtaactggtggaccgattgat
ttatcagcaggggaagtagatactgatacttttagtgcagtatatacattaactcaagcc
gacgtagatgctggaggagtaacaaatcaagcggtagttacagggcaaaaccctgatggc
aatgacgtattagatacttcagatgacgatagtaacctagaggatgacataactgtaaca
gacttgcctcaaggagctagcataagtttaattaaaactgctgtatttaatgatgttgac
ggtgacggatttgctcaagtaggcgaaaccattacttacaactttatagttacaaataca
ggaaatgtaaccgtcacaaatattatcattgaagacccattagtaaatgtaactggcgga
cctatcgacttggacccaggtgagacagatagtacaacatttgtagctatttatactata
gttcaaagtgatattgctcttggttatgttacgaaccaggctattgcaacagggcaagat
cctgatggtattgatgttgttgatatttcagacgataataatagtgtcgaagatgatgaa
acagttactaatcttccaattaaaagttcaatagctttagagaaagtaggaacaactgtc
gatattgatggtgatggtttaattcaggatggagaagtaattcagtacacatttactgtc
actaacacaggatcacttccattaaataatatttcaataactgacccattggtaacagtt
gatggaggacctatatcattattacctggagaatcagacagtactacatttacagcaacc
tatgtagtaacccctcttgatatagcaaacggatttgtactaaatcaagctgtagtaaac
tccatcgattcaaatggtcttgacgtaactgatttatctgatgaccctaacaatgatgag
aacgttgatccaaatatggatggtaatccagatgatccaacacttactacatttgaagga
gttcttaatatttttgatttggaagtatttaatggaatatcaccagatggagatgggata
aatgatttctttattatagaaggaattgatgctttcccagaaaataatgtacagatattt
aacagatggggtgtacaagtttttgaacaagatggttatacaaatagtccaactactggt
tttaaaggtatttcagaaggtagagcaactataagtgccgataatttattaccagcgggc
acttatttctacctcatttcttaccagacaccagacggtttgagaaggaagagtggatat
ttatacattaatcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system