Dokdonia sp. 4H-3-7-5: Krodi_2434
Help
Entry
Krodi_2434 CDS
T01484
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase
Organism
kdi
Dokdonia sp. 4H-3-7-5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS
PAS_4
PAS_9
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_8
PAS_7
OKR_DC_1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE20411
UniProt:
F4B0F8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2745823..2749473)
Genome browser
AA seq
1216 aa
AA seq
DB search
MAEAITNMEINKKSKFQELERQIEDLESAREHDYKTLFDNSTISIWNEDFTLVFEELERL
RTLNVSNIKKYLKKNPETLSTLLGKLKVNNVNGATLKLFKAENKEDFFNNIQNTFGKGAS
KVFTKLIIAIWKKKKAFISEVNYKTLKGVEFKALLSVRIPQTLLEQKSVPVTIQDISELK
AVQSAKKQSILKLQQAQKLGRMGSWEWKWKTDEAYWSDEMYKIYGVKKGEFDPTSDNVRE
LIFEEDRSKVKNVIKKLFTERSMEPFEFRIVRTNNEIRHLSILGIEFIKDKVYGVTQDIT
DRKIIEDDLNEAQKLAKVGSWIFNTDVRKMEWSKVMFHIWGFDPSQGTPPYKVLLNHVHP
DDMELWDSCIKRASSQGIPYDIEHRICLPDGTQKVIRCICEPVLGPNGTVIGLKGTGQDI
TEQKLIDEALIEAKEKAEESKNHLNSIIKNIGDPVFVKDDQSRLVIVNEAFCTLFGFERQ
EIIGKTLAEEVSPAEREAFLSIDKQLIIDGIENITEESLTIREGETQRISTRKTRFIDSN
GNIFIVGVIHDITERFKTENLIKEAKERAEENEERFRILMLNLEAGVVVHAPDTSIVQCN
YRASQILGFDEKYVQGKTGESMELKLVNLNASPLAIADYPVNKIAKTKESIKNQVIGLKR
EDKEDITWVTLNGFPVLSSTGEIKEIVMIFIDITAQRQNEKDKLKAKLLLDKTEKELSDA
QALAKIGSWLVKPLTMKMEWSKEMYNIWGYKYGKDNPEYLSVIDRVHPDDREILKNAVDE
ATNSGAPYKIEYRICIPDHPQKTVRAICQPIMDDAGNVISLAGTNQDITQQKLLSRELIS
AKEKAEESDRLKSAFLANLSHEMRTPMNGILGFSELLRRKNISEEKRDIYLELIEKEGHR
LLSFISNIVDISKIESNIIHIDNSRVNLNIIIKDIYSKYLLKLENSGVKLIIEMGLDDAD
SFIETDENKLVQIISNLLENAIKFTKQGTIEFGYSLYEKNLKFFVKDSGIGIEEEEQKNI
FDRFTQGRREQTHNLGVGLGLSIVEGLIKLLNGEVWIDSQIGEGSTFFFTIPYKKIVSKT
NLANTFNETTLESGDFTILIAEDDNLSFLYIQACLSDYDCTILRAINGKEAVELVHKNSN
IDLVLMDINMPIMDGNEALEEIRKTNKELTIIAQTGLAMSGDKEKMLNAGFDDYISKPIS
TTILTNTINKHLKITT
NT seq
3651 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgaagctataacaaatatggaaataaataaaaagtctaagtttcaagaattagaa
agacaaatagaggatttagaatctgcaagggagcacgattataaaacgctgtttgataac
tctacaatttctatatggaacgaagacttcactctcgtatttgaagaacttgaaagactt
agaactctcaatgtctccaatatcaaaaaatatcttaagaaaaaccctgagaccttatct
acattattaggaaagttaaaagtaaataatgtaaatggggctactttaaaattgtttaaa
gcagaaaataaagaggatttttttaataatattcaaaacacatttggaaaaggagcatca
aaggtttttacaaaacttataattgcgatttggaaaaagaagaaagcattcatctctgaa
gtaaactataaaaccttaaagggagttgaatttaaggctttgttatctgtacgtatacct
caaactttattagaacaaaaatcagtgccagtcactatccaagacattagtgaattaaaa
gccgtacaatctgccaagaaacaatctatattaaaattacaacaggctcaaaaattaggg
agaatgggtagttgggaatggaagtggaaaacagatgaagcttactggtctgatgaaatg
tataaaatttatggtgttaagaaaggagaatttgatcctactagtgacaatgtaagggag
ttaatttttgaagaagatagatctaaggtaaagaacgttatcaaaaaactttttaccgaa
agatcaatggagccgttcgaatttagaattgtaaggacaaacaatgaaataagacatcta
agtatcctaggtatagagtttataaaggataaagtttatggtgtaactcaagatataaca
gataggaaaataatagaagacgatctaaatgaagcacaaaaacttgccaaggtaggaagc
tggatatttaatactgatgtaagaaaaatggaatggtctaaggtgatgttccacatttgg
ggatttgatccaagtcaaggcacacctccctacaaagtattgcttaatcatgtccatcca
gatgatatggaattgtgggatagttgtattaaaagggctagctctcaaggaattccatat
gatatagaacataggatatgtctgcctgatggaacacaaaaagtaataaggtgtatatgt
gaacctgtactaggtcctaacggaactgttattggtttaaaaggaaccggtcaagatatt
acagagcaaaaacttatagatgaagcattaatagaggcaaaagaaaaagctgaagaaagc
aaaaatcatttaaatagtataataaagaatataggagatccagtctttgtaaaagatgac
caaagcaggttggtaatagttaatgaagccttctgcacactttttggatttgagagacaa
gaaattattggtaagacactcgctgaggaggtctcacctgctgaaagagaagccttttta
agtatagataaacaattaataattgatggaatagaaaacataacagaagagtcactgact
ataagagagggtgaaactcaaagaatttctacaagaaagacacgctttattgattctaac
ggaaatatttttatcgttggagttatacatgacattacagaacgctttaaaacagaaaac
ttaataaaagaagcaaaagaacgtgcagaagaaaatgaagaacgctttcgtatactaatg
cttaatctagaagctggtgtagttgttcatgcaccagatacatcaattgtgcagtgcaac
tatagagcatctcagattctaggttttgatgagaagtatgtacaaggaaaaacaggtgaa
agtatggaactgaaacttgtaaatcttaatgcatccccactagcaattgcagattatcct
gtaaataaaattgcaaagacaaaagagtcaataaaaaaccaagttataggcttgaagcga
gaagataaagaagatattacttgggtaactctcaatggcttcccagtattaagtagtact
ggggagatcaaggaaattgtgatgattttcattgatataactgcgcagagacagaatgaa
aaagacaaactaaaagctaagttattattagataaaacagagaaagaattaagtgatgct
caagccctagctaaaataggtagctggcttgttaagccattaactatgaaaatggaatgg
tctaaggaaatgtataacatttggggttataaatatggaaaggacaaccctgagtatcta
agcgtcattgatagagttcatccagatgatagagaaatacttaaaaatgcagtagatgaa
gccactaattctggtgcgccatataagattgaatatagaatttgtattcctgaccatcct
caaaaaactgtacgggcaatatgccaacctataatggatgatgccggaaatgtcataagt
cttgcaggaacaaatcaagatatcacacaacaaaaattattatctagagaattaataagt
gccaaggaaaaagcggaagaaagtgatagattaaaatctgcttttcttgcaaatttaagt
cacgagatgcgtactcctatgaacggtattttgggattttcagaattattgaggagaaaa
aatatatcagaagaaaaaagagatatctacttagaacttatagaaaaagagggacatcgc
ttattaagttttatttctaacattgttgatatttccaagattgaatcaaacattattcat
attgataattcacgagttaatctaaatattatcataaaagatatttattcaaaatatctt
ttaaaattagagaattcaggagtgaaactcattatagaaatggggcttgatgacgcagat
agcttcattgaaacagatgaaaataaattagtacagattatatcaaacttattagagaat
gctataaaatttactaaacaaggaacaattgaatttggatactccctttatgaaaagaac
cttaaattctttgtaaaagattcaggtattggaatagaagaagaagaacaaaaaaacatt
tttgacaggtttacacaaggaagacgcgagcaaactcataacctcggtgtaggtcttggc
ctttctattgtagaaggtctcataaaacttctaaatggagaagtgtggatcgattctcaa
ataggagaaggatcaacatttttctttacaataccttataaaaaaatagtcagcaaaact
aacttagcaaatacatttaatgaaactactttagaaagtggtgattttacaatcttaata
gcagaagatgacaacttaagttttctttatatacaagcttgcctttcggattatgactgt
accattttacgagctattaatggaaaagaggctgttgagctagttcacaaaaattctaac
atagacttagtgttgatggatatcaatatgcctattatggatggtaatgaagcattagag
gaaataaggaagactaataaagaacttacaatcattgctcaaaccgggctagcaatgtca
ggagataaggaaaaaatgcttaatgctggctttgatgattacatatcaaaaccaatttct
acaaccatactaaccaacacaataaataaacatttgaaaataactacatag
DBGET
integrated database retrieval system
