Kaistella flava (ex Peng et al. 2021): Q73A0000_00050
Help
Entry
Q73A0000_00050 CDS
T08317
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
kfa
Kaistella flava (ex Peng et al. 2021)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kfa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kfa02000
]
Q73A0000_00050
Transporters [BR:
kfa02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Q73A0000_00050
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
EF-hand_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOW08847
UniProt:
A0A7M2Y3Q3
LinkDB
All DBs
Position
7890..10634
Genome browser
AA seq
914 aa
AA seq
DB search
MRNYTKVLKIAPAFLLAGTMLHAQTKDSVKTADIEQVVLIGYGKQKKEDLTGSIASITSK
DFNPGSTSADQLIQGKAPGVTVTGNGGNPGSGSTIRIRGGASLTASNDPLIVIDGIPMDF
GGIAGASNALALINPNDIESFTVLKDASSAAIYGNRASNGVILITTKKGSSGKVRINFST
MGSVSTKMGNQSVLTADEFRDFVKANASQHYIDKLGTANTNWQDLIYQTAWGTDNNVAIS
GGIKNLPYRLSLGYTEQNGIVKTNEFKRTSVGLNLTPKFFDDHLSVTANVKGSMTENRFP
AGVIGAAQFFDPTQDVYDYSAQGDQVNNYWEWFLNPDNINVNATRNPLASLYGRRDVSTV
FRGIGNLQLDYKFHFLPDLHLNVIGGYDYQKGNGAITQYPGYAGMLASGDVSTRRDYSQE
KTNKLLETYLNYVKTITAIDTKIDLMAGYSYQQFHDTTPSATTYYGNPTRVATPTNRYEG
KLTLLGFYGRGIFSIANKYILTGSVRRDATSRFYNGTDLKNNWGTFYAASGAWKIKNESF
LKDSSIFSDLKLRAGWGETGQQEVGGYYNSFASYNVSDPTAQYGFGDQFYLMYRPTQYNP
NLTWETTATTNVGLDFGFWRNRITGSFDWFKKNTRDLQARVQVPAGEFSNTNIKNVGKMT
TDGLEFLINVNPVKTQDFTWDFSFNVAHYNPKVTHFDDVADGYVIQQGGISGGVGNTVQA
HAVGYTPFSFYVYQQVYDSNGKPLDGVYVDRNGDGKISADGDKYFYKSTTPDATFGFSTK
FKLKNWDLSTSLRAVVGNYVYNNFASQSNVQSIATNEYLQNISSTTANYGFATPQYWSDA
FVENASFLRMDNLTLGYDFGDVFNKGSNLRVYGMAQNVFVVTDYSGVDPEIFGNIDNGFY
QRPKVYSLGLNFQF
NT seq
2745 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagaaactatactaaagtattaaaaattgctccagcttttttattggccgggacaatg
ttacacgcacaaaccaaagattcagttaagactgccgatattgagcaggttgttctgatt
ggttatggaaaacagaagaaagaagatcttacgggatcgattgcttctattacttccaaa
gactttaaccctggctctacttctgcagatcaattgattcaagggaaagcgcctggtgtt
accgtaaccggaaacggtgggaatcctggttctggatcaaccattcgtattagaggtgga
gcttctttaacagcaagtaatgatcctttaattgtgattgatggaataccaatggatttt
ggcggtattgcaggagcatcaaatgctttggcgttgattaacccaaatgatattgaaagt
tttactgttttaaaagatgcttcttctgcggccatatatggtaacagagcttcgaatggg
gtgattttaattactactaaaaaaggttcttccggaaaagtgaggattaatttctctaca
atgggttctgtatccacaaaaatgggaaatcagagcgtactaactgctgatgaatttaga
gattttgttaaagcaaacgcttcacaacattatattgataaattaggaacagcgaatacg
aactggcaagatttaatttatcaaaccgcttggggaaccgacaataatgttgcgattagt
ggtggaattaaaaatttaccgtaccgtttgtctttaggttataccgagcaaaatggtatt
gtaaaaaccaatgaatttaaaagaacttcagtaggattaaatttaacacctaagtttttt
gatgatcatttgagtgttactgctaacgtaaaaggttccatgactgaaaaccgttttcca
gctggagtaatcggagctgcacagttttttgatccaacacaagatgtctatgattattct
gcacagggagatcaggtaaataattactgggagtggtttttgaatcctgataatattaac
gtgaatgctactcgaaatccacttgcttctttatatggaagaagagatgtttctaccgta
ttccgtggaataggaaacttacaattagattataaatttcactttcttccagacttgcat
ttgaatgtaattggtggatatgattatcaaaaaggaaatggtgcaatcactcaatacccg
ggatatgcaggtatgttggcttctggagacgtaagtacaagaagagattacagccaagaa
aaaaccaataaattattagaaacttatttaaactacgtaaaaacaattactgcaattgat
acgaaaatagatttaatggctggatattcttaccagcagtttcatgatacaacaccttct
gcgactacgtattatggtaatccaacaagagttgctacaccaaccaaccgttatgaagga
aagctaactttattaggcttttacggtagaggtattttctctattgcgaataaatatatc
ttaactggatcagtaagaagagacgcaacatctcgtttctataacggaactgatttgaaa
aataactggggaacattctacgcagcttcaggagcctggaaaattaaaaatgaaagtttc
cttaaagattcaagcatattctctgatttaaaattaagagcaggttggggagaaacagga
cagcaagaagtaggaggttactataactcttttgcatcttataatgtttcagatcctacg
gcgcaatatggtttcggagatcagttttatttaatgtaccgtccgactcagtataaccct
aacttaacttgggaaactactgcaacgactaacgttggattagatttcggattctggaga
aacagaattacaggatcatttgattggtttaagaaaaacacaagagatttacaggcaaga
gttcaggttcctgcaggggaatttagcaacacaaacattaaaaatgttggaaaaatgacc
accgacgggcttgagtttttgattaatgtgaatccggtaaaaacacaagatttcacttgg
gacttcagttttaatgtagctcattacaatcctaaagtaactcattttgatgatgtagcc
gatggttacgtaattcaacagggagggatttctggtggagttgggaatacagtacaagct
cacgcggttggatatacaccgtttagtttctacgtttaccagcaagtctatgattctaat
ggaaaaccattagatggagtttatgtcgacagaaatggcgatggtaaaattagtgcagat
ggcgataaatatttctataaatctaccacaccagatgcaacctttggtttctcaacgaaa
tttaagttgaaaaattgggacttgtcaacttcattgagagcggttgtagggaattatgtg
tataataacttcgcttctcaatcaaatgttcaaagtattgcaaccaatgaatatttgcag
aatatttcaagtacgactgctaattacggatttgcgactcctcaatattggagcgacgcg
ttcgtagaaaatgcttcatttttgagaatggataatttaactttaggatatgacttcgga
gatgtctttaataaaggaagtaatcttagagtttatggaatggcgcagaatgtatttgta
gttactgattattcaggcgtagatccagaaatttttggaaatattgataacggattttat
caaagaccaaaagtatattcactaggattaaactttcaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
