Candidatus Kinetoplastidibacterium galati: ST1E_0402
Help
Entry
ST1E_0402 CDS
T02466
Name
(GenBank) ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit
Organism
kga
Candidatus Kinetoplastidibacterium galati
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF48857
UniProt:
M1LTJ5
LinkDB
All DBs
Position
149289..152627
Genome browser
AA seq
1112 aa
AA seq
DB search
MHNYCFLGDDGIRDRALDPLESFIIQAPAGSGKTELLTNRILSLLVVVSKPEEILAITFT
RKAALEMRERVIEKLKLGLRSIPYNSADIISWKLSKLALERDTLLGWDLLKHPERINIKT
FDSLCFSLISSFPWLSEIGSTTNIVKDARKYYKEAAFSTVNLADDYPCIRSLISYLDVNI
KLVVDYIADMLSKRDQWLPVLRYISSKELLQKELQSILERDIKKLLSLMPVNWMKDLQYP
IRMASSIICEDNNSSILVSLLDWDCYLEPNINSLKKIKALSLIFLTSQNTLRSPKGLNRK
NGFPAGTSHRKIFSDWLMNIRDNDCWIFYLTMLRHAPYSITENQWTILSNQSNVLLLSVA
NLLLKFSQQEELDFIEISQRTVAILGKENNPSDLLLKIDSKISHVLVDEFQDTNRTHFEL
LETITSGWQKNYGKSIFIVGDPMQSIYRFRGADVGLFLNVVENGIGEIKPIFLKLVSNFR
SQLNLVNWFNTVFGNLFPINNDQNIGAISYSPSIPVNKKLDDQAVTFHPLFTNNDITCNE
LEEFSIRIISKILENSQTNDRESTAILVHSRSSLGNLVNILSKNKIPFRAIEITLLSEKP
IVSDLIQLVRAMIHPGDRLAWLSILRSPFCGLKLDTLHRIFGSDHKTPVPIILRKILDTQ
GSIINDSVDYVRFFMGEEEQKILPVSEYNRLLRIAHVLLHREYSGSFPFSAWIRYLWDLL
EGSNVYNDLDTENDVENVLCLIDRISAYGNIDVDILEEEISKLLITSDHVKVDKPFVEIM
TIHKAKGLQFDNVILYGTHNSSSKHHESIMRFDHCFGNALFSPVKSMINDAPDPIAQYLW
YKDKLRDNYELDRLIYVAVTRAKNRIHIISPVFLKGEKVIAPPSDSLLIRLWGNLDYKPP
LSTDITDSFRHKDSNTRLINRIVCDDINNIVNYTDNPSWNYFWEYDYNNKYIIDKLILDW
LAQIGKASINNYSKFYRYLPIVKNQLLRNNFFSDGIEEAAIFIVDVIENFLENDIGTWIL
SYKKSYRNVSFIDRKGSIFSADVVLDLGNKWLAVDYDLSIIGKEERMEDFLDRIKTNYSY
KLSSFCNNVGLIDDRPLNTAMCSPIYKILLDI
NT seq
3339 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataactattgttttttaggtgatgatggtattagagatagggcgttggatccattg
gaatcatttataattcaagcccctgctggctctggaaaaaccgagcttttgactaataga
attttgtctttacttgttgtcgtatcaaagcctgaagaaatattagcaataacgtttaca
agaaaagctgcgttagaaatgcgtgaacgggttatagaaaaattaaaacttggactgcgc
agtataccatacaattctgctgatataatctcatggaaattatcaaaattagcactagaa
agagatactttgttaggctgggaccttttaaaacatccagaaagaataaatatcaaaacc
tttgattcgttatgttttagtctgatatcaagttttccttggttgtcagaaatcggcagt
acaacaaatatagtcaaagatgctagaaaatattataaagaggcagcattttctacggta
aatttggcagatgattatccatgtattcgttctttaatttcttatttggatgttaacata
aaattagtagtagattacatagctgatatgctatctaaacgtgatcaatggttacctgtg
ttaagatatatttccagcaaagaattattgcaaaaagaattacaatctattctagaaaga
gatataaaaaagctactctcattaatgcctgttaattggatgaaagatttacagtatcct
ataaggatggcttctagcattatttgtgaagataataatagtagtattttagtcagtctt
ttagactgggattgttatttagagccaaatataaatagtttaaagaaaataaaagcatta
tccttaatttttcttacctcacaaaatacattgcgaagtccaaaaggattaaatagaaaa
aatggttttcctgctggaacatctcatagaaagattttttctgattggttgatgaatatt
agggataatgattgttggatattttatttaacaatgttgcgtcatgctccttactctatt
acagaaaatcagtggactattttatctaaccaatcaaatgtactattattatcagttgct
aatcttttattaaagtttagtcagcaagaagagttggactttatagaaatttcccaaaga
acggttgctattttaggtaaagaaaataatccgagcgatcttcttttaaaaattgattct
aaaatatctcatgttttagtagatgaatttcaggatactaatcgcacacattttgaatta
ctagagactataacatctggctggcagaaaaattacggtaaatctatttttatagttggt
gatccaatgcaatccatatatagattcagaggcgctgatgtaggattattcttaaatgtt
gtagagaatggtattggtgaaataaagccaatatttttaaaattggttagtaattttcgt
tcacagttaaatctagttaattggttcaatactgtttttggcaacttatttcccatcaat
aatgatcaaaatatcggggctatatcttatagtccttctattcctgttaataagaaatta
gatgatcaagcagttacttttcatcctttgtttactaataatgatattacatgtaatgag
ttagaagaattttctatacgaattattagtaaaattttagaaaattctcaaaccaacgac
cgagaatcaaccgcgatattggtgcattcacgtagtagtttaggtaatctcgtaaatatt
ttatctaaaaataaaataccattccgtgccattgaaataacattattatcagaaaaacct
atcgtctctgacttgatccaattagtgagagctatgatccatccaggagatagattagct
tggttatcaatattgagatcgcctttttgtgggttaaagttagatactcttcatagaata
tttggatctgatcataaaacaccggttccaattattttaaggaaaatactcgacactcag
ggttcgattataaatgattctgttgattatgtaagattttttatgggagaagaagagcaa
aaaatattacctgtatcagaatataatcgcttgctacgcatagctcatgttttactgcac
agagaatattctggttcatttccattttcagcttggattaggtacttgtgggatctcctt
gaaggatctaatgtttataacgatctagatactgaaaatgatgtagagaatgttctttgt
ttgatagatagaatatctgcttatggaaacattgatgtcgatattcttgaagaagaaata
tctaaactattaattacatcagatcatgttaaagtagacaaacctttcgtagaaattatg
actatacataaggccaaggggttgcagtttgataatgtaattttatatggcactcataat
tcatctagtaaacatcatgagtcaataatgagatttgatcattgctttggaaatgctttg
ttctctccagtaaagtctatgataaatgatgcacctgatcctatagcacaatatctttgg
tataaagacaaattaagagacaattacgaattagatagattaatatacgttgctgtcact
agggctaaaaataggatacatataatttcacctgtatttttaaaaggagaaaaagttatc
gccccaccatcagacagtttattaattaggttatggggaaatttagattataaacctccg
ttgtcaacagatattactgatagttttagacataaagatagcaatactagattaattaat
aggattgtttgtgatgatattaacaacatagttaattatacagacaatccttcatggaat
tatttttgggaatatgattacaataacaagtatatcatagataaattaatacttgactgg
ctcgctcaaataggtaaggcgagtattaataattactcaaaattttacagataccttcct
atagtaaagaatcaattacttagaaataatttttttagtgacggcattgaagaagcagct
atttttatagtagatgttatagaaaattttttagaaaacgatattggaacatggatacta
tcttataaaaaatcttataggaacgtgtcttttattgatagaaaaggctctatttttagt
gcggatgttgttttagatttaggcaataagtggttagcagtggactacgatttgtccata
attggcaaagaagagagaatggaagattttttagatagaattaaaactaattatagctat
aaattaagtagtttttgtaataatgtcggtttaatagatgatagacctctaaatacagct
atgtgctctcctatctataaaatactattagatatttga
DBGET
integrated database retrieval system