Kryptolebias marmoratus (mangrove rivulus): 108243718
Help
Entry
108243718 CDS
T05608
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3 isoform X2
KO
K20995
Notch 3
Organism
kmr
Kryptolebias marmoratus (mangrove rivulus)
Pathway
kmr04330
Notch signaling pathway
kmr04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kmr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
108243718 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
108243718 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
EGF_3
NODP
NOD
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108243718
NCBI-ProteinID:
XP_017284835
UniProt:
A0A3Q3AY23
LinkDB
All DBs
Position
LG12:7827099..7854322
Genome browser
AA seq
2463 aa
AA seq
DB search
MEGNIQWIIFSFLFCLHVGEGFRCVDKYRPCENGGTCIDTPSRCICRPGFIGPLCQHLDP
CHRSPCLNGAACRSQVVNDIPQYTCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNSHY
NCSCPPGYQGKNCRNDIDECRKPGACLNGGLCSNTHGSFQCQCQQGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLAGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGICVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTFCEVDVDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGKLCESNINNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCNCYPGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDMVNKYICQCQHGTSGTNCEVNFD
DCASNPCDYGICKDGINRFDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGTCVDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCIHGSCRDDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFICKCRQGFRGNLCQVNINECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCSPNPCANHAVCTHTPDYLGYQCNCKPGWQGQLCNIDVNECLSNPCKNRGT
CTNTHGGFMCSCRAGFTGLTCETDINDCMPNPCLSGGSCTDGVNSFHCSCLPGFTGPRCA
QEINECQSSPCKNGGTCTDYVNSYTCTCPPGFTGIYCEINIPDCTESSCFNGGSCTDKIN
GYSCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPKGYTGNRCQTPVDWC
RRSSPCQNGGRCHQKDSSFICECPLGWSGRYCGIPRVSCEIAARQQGIQTDKLCHHGGHC
VNTGNTHFCKCPADYTGSYCENQVDQCEDKPCRNGATCRSYVGGYQCDCMPGYTGQNCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPTLRLRGAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFTGERCEGDINECHSNPCSPSNSLDCIQLPNDYLCVCKPGFTGR
RCQNRFSVCESQPCQNGGACSVTTSSLGYICTCQLGYTGPNCERSMSCRELSCYNGGSCA
VTIRGARCTCLSGYGGPQCQHRSKEGCSSQPCRNGGLCTEETSFPYFHCQCPSGWTGKRC
EQSTMPELSVPSCPLAECNGKANDGVCDKECNTLPCRWDGGDCSLAMNPWAHCTNPRCWR
VFNNSQCDESCNNADCLYDNFDCRTKDKVCNPIYETYCIDHFADGMCDPGCNTEECGWDG
LDCEQKVPEELADGVLVLIVLLPPDELLRTRTAFLQKLSAILRTSVRFRRDQNGDAMIEP
YTRREARLKRELEPQQEVVGSKVYLEIDNRLCSQGSEDCFRTADSAAEYLGALSARDMLD
FPYPLREVRGETMPQYPVIPLWSKLMLAGIVFLFILVIVVMGMLMVRRKREHSTLWFPEG
FFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGMKHMPKTVEESLLGDHSDQWTDSDCPEAKRLKVEEPS
MLSDGEDAVDCRQWTQHHLAAADIRVPPTMALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLMLA
SFCGGGLEPEVAEEEENEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAAK
RLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAARL
AVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATVALLKNGANKDMQDLKEETPL
FLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQGH
GGAGHQLTGGHTLSPLMCPPTAFLPSLKNTPQGKKNRRPGAKGSSLGGQHATSLKESVKA
RNKKLTLDMQSALLDSSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPIFHSSMSVP
STPMVHSNMLEGGGPFAVSLAQINDLGAGGMSLPGRVSMASDVNHGYVLSSGQLGVNMGM
VSPVSVPFDWHNRLPPSSQCGQQVVNMVHSSQASMHPQSPAMQQQSMLMHQQLYCSPMLQ
PTPVTSTPAISPVKLPSIAEQQQLINHSITNQQSIARMSTSTPPTPQTSQPPPSFFQQQL
PQQPSQLKPPAQSTQAATPAGQPTQALPSQPSSSTAGNEDYPTPPSQHSYSSTLDATPKH
YNNLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVTVPNQTQITQMPDANGKMQ
VFA
NT seq
7392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatatccaatggattattttctcctttttattttgtttgcatgttggtgaa
gggtttcgctgtgtggataaatacagaccttgtgaaaatggagggacatgcatagataca
ccctctagatgcatatgtcgcccgggattcattggtcctctctgtcagcacctggatccc
tgtcatcgatcaccatgtctgaatggggcagcttgcaggagccaggtggttaatgatatt
ccacagtacacatgtgtgtgccagagagggttcagaggccaagactgctccctcatcgat
gcatgtgccacaagtccctgtgccaatggggcgcgctgtgtcaattggaacagccactac
aactgttcgtgtccacctggctatcagggaaagaactgccgcaacgacatcgatgagtgc
cgcaagcctggtgcatgtctcaatggtggcctctgcagtaatacccatgggtctttccag
tgccagtgccagcaaggatacagtggacgtacatgtgaggtgtccaccttaccctgtgcc
ccatctcagtgccttaatggaggcacctgtcgccagacgagtgaccattcctatgaatgt
gcttgtctagcagggtttgagggacacaactgtgagaataatgtggatgactgtccaggt
cacaaatgcatgaatggaggaatatgtgtagatggagtcaatacttacaactgccaatgt
ccacctgaatggacaggacaatactgtgctgaagatgtcaatgaatgtctcatgcaaccc
aacgcctgccataatggtggtacttgcttcaacaccattggtggccatacttgtgtttgt
gttaatggctggactggagatgactgcagtgagaatattgatgactgtgcaatagctgtt
tgcttcaacggggccacctgccatgaccgtgtagcatcctttttctgcgaatgcccagtt
gggaagacaggtttactgtgccaccttgatgatgcatgtgtgagtaatccgtgcaatgag
ggtgcagtatgtgacaccaacccacttaatggccgtgcaatttgcacctgccctgctggt
tttgtgggaggtgcctgcaatcaggacatggatgaatgttcaattggtgcaaacccatgt
gaacattttgggaaatgtgtaaatacagagggctctttccaatgtcagtgtggccgagga
tatgctggaccacgctgtgagattgacatcaatgaatgtctttcaatgccctgccagaac
gatgcaacctgcttggaccgtattggagagttcacctgcatctgtatgccaggctacatg
gggactttctgtgaagttgatgtagatgactgtgaaagcaacccatgtgtgaatgatggc
atctgtcgagacatggtcaatggcttcacatgcacctgccagccaggctttactggcacc
atgtgtcaaatcgacatagatgagtgtgctagcacgccttgccagaatggagcaaaatgc
tacgatcggcccaatgggtttgagtgccgctgtgcagaaggttatgaagggaaactctgc
gagagtaatatcaacaactgtcaacctgacccatgccaccatggtacttgcatagatggc
attgctagctacacatgtaactgttatcccggatacacaggctatcgctgtgagaatcag
ctcaatgagtgccacagcaacccctgtcagaatgggggcaagtgcgtggacatggtcaac
aagtatatctgtcagtgccagcatggaacttcaggtacaaactgtgaggttaactttgat
gactgtgccagtaacccatgtgattatggcatctgcaaagatggcatcaaccgctttgac
tgtgtttgcaaacctggctttacaggtcctaaatgtaatgtggaaatagatgagtgtgcg
tctagcccctgtagaaatgggggaacatgtgttgatgaagaaaatggatttcactgccag
tgtcctgaaggctttaagcccccttactgttactcccaggtggatgagtgtggcagcagc
ccatgcatccatggctcctgcagagatgacatcaatggttaccgctgtgactgtgaaccc
ggatgggtaggaaagaactgtgacctggacaggaatgactgtttgccaagtccttgccag
aatgctgggacatgcatcgaccagctcaatggtttcatctgcaagtgccgccaaggcttc
agaggtaacctctgccaggtgaacatcaatgaatgtgcttctagcccttgtctgaacaag
ggcacttgtgtggatggagtggcaagttttacctgtctgtgtgagcttccctatagtgga
cccacttgtgctgaggtcctcacaccttgctcccctaatccctgtgccaatcacgcagtc
tgcacccacacgccagactatctggggtatcaatgtaactgtaagccagggtggcaaggt
cagttgtgtaacatagatgtgaatgaatgcctgtcgaacccctgcaaaaaccgtgggacc
tgtactaacacacacggaggcttcatgtgctcttgcagagcaggattcactgggctaacc
tgtgaaacagacatcaatgactgtatgccaaatccctgcctaagtggaggttcttgcact
gatggagtaaactcattccactgtagttgcttgccagggtttacaggcccccgatgtgct
caggagattaatgaatgccagagctccccctgcaaaaatggaggcacctgtacagactat
gtaaactcctacacttgcacctgtccacccggcttcactggcatctattgtgaaatcaac
atccctgactgcactgaaagctcttgcttcaatggagggtcatgcacggataaaatcaat
ggttattcttgtacctgtcgctcaggcttcactgggtcgcactgtcaatatgaagtcaat
gagtgtgactcccagccctgtctcaatgggggcatctgtcaggatgccttggagtccttc
cgttgctcctgccccaaaggctatactggcaatcgatgccagacaccagttgattggtgc
agacgctcatctccatgccaaaatggcggacgctgtcaccaaaaggattcttcttttatc
tgtgaatgtcctcttggttggtctggtcggtactgtggcatcccaagagtctcatgtgag
atagctgctcgtcagcaagggatccaaacagacaaactgtgccaccacggtggtcactgt
gtcaacactgggaatacccacttttgtaaatgtcctgctgactatactggaagctattgt
gaaaatcaagtggaccaatgtgaagacaaaccttgtcgcaatggcgccacctgcaggtca
tatgttggcgggtaccagtgcgattgtatgccgggctacacaggacagaactgtgagata
gagatcaatgagtgtcagtctcacccatgccagaatggaggaacttgcattgatctggtg
gggcattatatctgctcatgtccacctggcacattgggtgttctctgtgagatcaatgaa
gatgactgcgctccaaccctgaggctgcgtggtgctccaccaaagtgcctgaacaatgga
acttgtgtggatagagtgggtggttatcgctgcaattgtccccctggttttacaggagaa
agatgtgagggagacataaacgagtgtcactccaacccctgtagtccctccaacagtctt
gactgcatccaattgcccaatgattacctatgtgtctgcaagcctgggtttacagggcga
aggtgtcagaacaggttcagtgtctgtgagtctcagccttgtcagaatggaggagcttgt
tctgtgaccacctcttccctaggatacatctgtacatgtcaacttggttatactggtcca
aactgtgaaagaagcatgtcctgtcgtgagctgtcttgctacaatggagggagctgtgca
gttacaataagaggggcacggtgcacctgtttgtcaggttatggtgggccccagtgtcag
catcgcagtaaggaagggtgttcctcccagccatgccggaatggggggttatgcactgaa
gaaaccagctttccatactttcactgccagtgtcccagtgggtggacaggtaaacgatgt
gaacaaagcactatgcctgagctctcggtgccttcgtgtcctctggcagagtgtaatgga
aaagccaatgatggtgtttgtgataaggaatgtaacacacttccttgtcgttgggatggt
ggtgactgctccctggcaatgaacccatgggctcactgtacaaacccacgctgctggcgt
gtttttaacaacagccagtgcgatgagtcctgtaacaatgctgactgtctgtatgacaac
tttgactgcagaaccaaggataaagtttgcaatccaatatatgagacctactgcatcgac
cactttgctgatgggatgtgtgaccctggctgcaacacagaagagtgtggatgggatggc
ttagactgtgaacagaaggttccagaagagcttgccgatggcgtcttagttttgatagtg
cttttgcctccagatgagcttcttcgcaccagaacagcctttttgcagaaattaagcgca
atcctgcgcacgtcagtgcgcttcaggcgggaccagaatggagatgcaatgattgaaccc
tacactcgtcgagaagcacgtctcaagcgagaactagagcctcaacaggaggttgtcggc
tccaaagtctatctggagatagacaaccgtttgtgttctcagggttcagaagattgtttc
cgtacagctgacagtgctgcagagtacctgggagccctgtctgcaagagatatgcttgat
tttccttatcccctcagagaggtccggggtgaaacaatgcctcagtaccctgttatacca
ctatggagcaagctgatgctggcagggatagtttttctttttattttggtcatcgttgtg
atgggcatgttgatggtacgcagaaaacgggagcacagcactctctggttccctgaaggc
ttctttctcaagaaggaacccagcagtaacaagaaccgcagggaacctgtgggccaagat
gctcttggaatgaaacacatgccaaaaactgttgaggaatctcttcttggagatcatagt
gatcagtggacggactcagactgccctgaagcaaaaagacttaaggtagaggagccaagc
atgctttcagatggtgaagatgcggtggattgcagacagtggacacagcaccaccttgca
gctgctgacattcgtgttccacccacaatggccctcactccacctcaaggagaatttgaa
agcgactgcatggatgttaatgtccgaggcccagatggctttacacctctcatgctggca
tcattttgtggaggaggcctagaacctgaggtggcagaggaggaggagaatgaagagtgt
tcagccaacatcatctctgacctaatctatcagggtgcatcccttgctgcccaaacagac
cgtactggtgagacagcactacacttggctgctcgctatgcccgtgctgatgctgctaaa
agattgctggatgccggggcggatgctaatgctcaagacaacacaggacgcacaccatta
catgctgcagtggctgcagatgcacaaggtgtcttccagattctaatcagaaatcgtgcc
actgatctggactcccgtatgtatgatggctctactgcgctgattctggctgcgcggctg
gcagtggagggcatggtcgaggaacttattacttgtcatgcagatgttaatgcagttgat
gaactgggtaaatcggccttgcactgggctgctgctgttaacaatgtggatgcaactgtt
gctctgctgaagaatggagctaacaaagatatgcaagatctcaaggaggaaactcctctg
ttccttgcagctcgtgaaggcagctgtgaagctgtgaaggtgctgcttgctcactttgca
aaccgagaaatcacagaccacatggacaggttgccaagagacatcgctcaggagcgtatg
caccacgacattgtgcagcttcttgatgagtacaacacagtaagaagtccccagggccat
ggaggggctggacatcaactcactggggggcacactctgtccccactcatgtgccctccc
actgccttccttcctagtctgaagaacaccccacaaggcaagaagaaccgtcggcctgga
gccaaaggttccagcctgggaggccagcatgctactagtctgaaggagtcggtaaaagct
cgcaataagaagctcactctggacatgcagagtgcattattggacagctcagttactctg
tccccagttgactcactggactcaccacatggtggagctagcaatgctggctacatcaca
aaccccacttcccctgtggccatgcagtcacccattttccactcctccatgtctgtccca
agcactccaatggtacatagtaacatgctggaaggagggggcccctttgctgtgtcactt
gcccaaattaatgaccttggagctggaggaatgtctttaccaggtcgtgtctccatggct
tcagatgtcaaccatggctatgtgctgagttctggccagctgggagtcaacatgggaatg
gtcagtcctgttagtgtgccctttgactggcacaaccgcttgccaccctcctctcagtgt
ggtcagcaggtagtgaatatggtgcatagtagccaggcaagcatgcatcctcagagtcca
gccatgcaacagcagagcatgcttatgcaccaacagctctactgcagtcccatgctgcag
cccacacctgttacctccacacctgccatcagcccagtaaagctgccttccattgctgag
cagcagcagctcatcaatcacagcatcaccaaccagcaaagcattgctcgcatgagcact
tccactccaccaacacctcagacctcgcagcccccaccatcattcttccagcagcagctg
cctcagcaaccctctcagctgaagcctcctgctcagtccacccaggcagccacaccagca
ggccagcccactcaggcccttccctcccagccaagcagcagcactgcagggaacgaggat
tatccaacccctccttcccaacacagctattcatccacattagatgccacgcccaagcat
tacaacaatttgcccagtgagcatccctatctgaccccttctccagagtctcctgagcac
tggtccagtccctctcctcactgtgtctctgattggtcagattccacacccagcccagca
gttactgtccccaaccagacccaaattactcaaatgccagatgcaaatggcaagatgcag
gtgtttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
