Kosmotoga olearia: Kole_0192
Help
Entry
Kole_0192 CDS
T00914
Name
(GenBank) LVIVD repeat protein
Organism
kol
Kosmotoga olearia
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LVIVD
PQQ_3
Beta_propel
CPSF_A
PQQ_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACR78918
UniProt:
C5CIS9
LinkDB
All DBs
Position
complement(216631..218505)
Genome browser
AA seq
624 aa
AA seq
DB search
MSCVVRKGFKSWKLVMVVTLVLFLLTACPGFNNPDGNDEAEKQYVYAAGGVEGLLIFEVS
DPENPILVSYYDTDGCAYGVTVSGGYAYVADDYNGLVVIDISEPSNPAEVGHYDTADAAY
GVTVVGNYAYVADNDNGLVVIDISEPSNPAEVGHYDTAGAAYGVTVVGNYAYVADNDNGL
VIIDISDPTNLLQIGHYDTVGYACGVTVVGDYAYVADWENGLVVIDISDPSSPILVGRYD
TDGSAYGVTVSGDYAYVADDDNGLVVIDISESSSPVEVGCYDTADEAYGVTVVGNYAYVA
DGGNGLVVIDISDPTNPVQIGHYDTGRWASEVVVSGNYAYVADGDNGLVVIDVSDSVKVG
HYDTAGDACGVTVEGDYAYVADWENGLVVIDISDPSNPILVGRYDTAGYACGVTVVGDYA
YVADDYNGLVVIGISEPTNPVQIGHYDTDGWANGVTVAGDYAYVADMSSLVVMDISDPSN
PIPVCHYDTDGYACGVTVEGDFAYVADWGNGLVVMDISDPSNPILVGHYDTNGWACGVEV
SGDYAYIADGDNGLVMIDISDQSNPVEIGSFDLNGFVYRVTVAEDYAYVANWDNGLVILD
ISDPSNPKLVNDMPWITLYGICGN
NT seq
1875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttgtgtagtcagaaaagggttcaaaagttggaagttggtgatggtagttaccctg
gtattgtttctgttaacagcttgtccaggttttaacaatcccgatggcaatgatgaagca
gaaaagcagtacgtatatgccgcgggtggagttgaagggttgttaatatttgaggttagt
gacccggaaaatcccatactggttagctattatgacacggatggttgtgcatatggggta
acggtatcaggaggctatgcgtacgtggcggacgattataatggtcttgtggtaatcgat
atatctgaaccgtcaaatcctgcggaggtaggccactatgacacggctgatgctgcatat
ggagtaaccgtagtcgggaactacgcatatgtggcggacaatgataacggtcttgtggta
atcgatatatctgaaccgtcaaatcctgcggaggtaggccactatgacacggctggtgct
gcgtatggagtaaccgtagtcgggaactacgcatatgtggcggataatgataatggtctg
gttatcatagatatatccgatccgacaaatctcttacagattggtcattatgacacagtt
ggttatgcatgcggagtaacggtggtaggagattacgcatacgtggcggactgggagaac
ggtctggtggtgatagatatatccgatccatcaagtcccatactggttggtcgttatgac
acggatggtagtgcatatggagtaacggtatcaggagactatgcgtacgtggcggacgat
gataacggtcttgtggtaatcgatatatctgaatcgtcaagtcctgtagaggtaggctgc
tatgacacagctgatgaagcatatggagtaaccgtagtcgggaactacgcatacgtggca
gacggtggtaacggccttgtggtgatagatatatccgatccgacaaatccagtgcaaatt
ggtcattatgacacaggtaggtgggcaagtgaagtagtggtatcaggaaactatgcgtat
gtggcagacggggataacggtcttgtggtaatcgacgtatctgattctgttaaggtaggt
cactatgacactgctggtgacgcatgtggagtaacggtggaaggagattacgcatacgtg
gcggactgggagaacggtctggtggtgatagatatatccgatccatcaaatcccatactg
gttggtcgttatgacactgctggttatgcatgcggagtaacggtggtaggagattacgca
tacgtggcggacgattataacgggcttgtagtgataggcatatccgaaccgacaaatcct
gtccaaattggtcattatgacacggatggttgggcaaatggagtaacagtagcgggagac
tacgcgtatgtagcggatatgagcagtctggtggtgatggatatatctgatccgtcaaat
ccgataccggtttgtcattatgatacagatggttatgcatgtggagtaacggtggaagga
gatttcgcatacgtggccgattggggaaatggcctggttgtgatggatatatccgatcca
tcaaatcccatactggttggtcattatgacacgaatggttgggcatgtggagtagaggta
tcaggagactatgcatatatagcagacggagacaacggtcttgtgatgatagacatatct
gatcagtcaaatcctgtggagataggtagttttgatttgaatggttttgtatatagggta
acggtagcggaagactacgcgtacgtggctaactgggataacggtctggttatcttagat
atatccgacccatcaaatcccaaattagtaaatgatatgccttggatcacgctttacgga
atatgtggtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
