Kordia sp. SMS9: KORDIASMS9_00039
Help
Entry
KORDIASMS9_00039 CDS
T05562
Symbol
inlJ
Name
(GenBank) internalin-J
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
kos
Kordia sp. SMS9
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kos00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kos02000
]
KORDIASMS9_00039 (inlJ)
Transporters [BR:
kos02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KORDIASMS9_00039 (inlJ)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXG67857
UniProt:
A0A345GU69
LinkDB
All DBs
Position
complement(50834..58153)
Genome browser
AA seq
2439 aa
AA seq
DB search
MRLRLLFALLIFTNIIWATTETPPPSNDNFANAIPVSCGGNYTASTAEATLDENNAPDGF
GADLDAPNIWYSYTGNGIPETITLDLCASGYDTSYLIYTGTSGNLTLVAGNDDNEGQCGP
GYRSYGTFESDGITTYYITITGYNPTSIGAVDLTVSCLPADIVYITDANFEQALIDLGID
SGTVNGYVSVADVDQVNDLNISNKNITSLSGIEAFTALEILICNNNAIRSINLENQPSLT
LLNCSDNDLTFLSVKNGNNTNITSFNALNNFDLACIEVDNTAYSTTNWTNIDSGVSFTQN
DCTNVTFVPDDNFEQYLIDQGLDDVLDNYVLTNNINTIEVFSISSRQIHDLTGIGGFTAL
EELNCTSNELTSLDLSQNVALRRLKCYFNELTSINLTQNTALERLECFVNNLTTIDLTQN
TALNYLRAELNPLGTLDLSQNLVLDYINLSRTQLTAINLTANVALENIVLTNNLLTSIDV
SQNVNVKGLFVDDNSLTSINVVTNQALQQFYCDNNAIEYLDLSNNTQLVSLQASNNALTG
IDLKSGNNTILPSAIGGFFDVTGNPNLTCIEVDDVAYSTTNWTDIDPGLTFSTNCNPSPI
PPNDECVDAIPVPISDGGCNTTVSGTLAGATDSNVYQCFGNTNSFSDVWYSFVATDTAHD
IKILNTSGINSSVFHTVIDAQTYSCGNITDAVYCTDALERQATGLTIGDTYYIQVFTDVA
NSTETFDVCVSTLNIPGQTYVPDDNFEQALIDLGYDDVLDDYVTTANINTVETLDVSSEN
IADLTGIQGFTALKNLKCTSNNLISLDVTQNTVLEILDFGLNNITAIDITQNTVLKILRF
QQNSLSSIDVSQNVDLEIFAGMFNGLQSLDVTNNTKLTLLNCWSNGIDEIDLSQNPDLEF
LSMRINDLVSLDISANPVLRSLDCHANELTSLNVQNGNNSNFTTFVATNNSTLNCIQVDD
VTYSTTNWTQISSGSSFSTDCGYLENDECVDAILVPISDGGCNTTVSGTLAGATDSNVYQ
CFGNTNSFSDVWYSFVATDTAHDIKILNTSGINSSVFHTVIDAQTYSCGNITDAVYCTDA
LERQATGLTIGDTYYIQVFTDVANSTETFDVCVSTNTIPGQTYVPDDNFEQTLIDLGYDT
TLDNYVTTANINTITSLNVVGKNIASLTGLEDFTALQSLDFSINNVTTVDLTQNAQLRFL
LLTGNSLATINVSQNPLLRGLTVEENLLTTIDVTQNPLLESLNISKNLFTSIDVTQNAGL
TNLDVGENSLSQINVTQNPVLAFLTLDKNNFSAVDVTNNPLLSSLSVEENSLTTIDITQN
PVLLGAYFGYNQLTTIDVSQNLALETLVVTANSQISTIDVSVNAALKNLRINSTQISEVN
VSNNLNLEGLSVSNCPITGVDLTANVALQNLGVVGSQLTTIDVSQNPAFVSLFCSNTSTL
TSVNIQNGNNTNVTTFFALNTPNLTCVQVDNVAYSAANWSNVDAGINFSANCGFPVNNTC
VTAINVPISGIACNNVIEATIVGATNSNSLQCFGNNANFTDVWFSFVATETTHKIALQNL
TGSPNFLWHSLIDAQAYTCGNITDAIYCTDALEDTATGLTIGNTYYIQVYSHVANANTTF
DICVTSFAIPGQTYVPDDNFEQALIDLGYDITLDNYVTTTNISGIENLNISERSIADLTG
IEDFTALKELRCETNNLTNLNITQNTQLTLVHAFNNTLTNVDFTQNTALVQLFISNNQLS
TIDVSQNTALVDLGIFTNPQLGSIDVSNNSNLKTLNISYTPVSEIDVSNNLALERLSFVD
CPISEIDVTANLELRQLSTSQSLVTSVDVSGNPLFEWISCRNSPLLTQLNLQNGNNTNFV
FFLATDTPNLTCIQVDNAAYSTANWTNITPGTSFSTDCGYLTNDECVDAINVPISDATCN
NVIAATMAGATNSNSLQCFGNNVNFTDVWFSFVATETTHKIALQNLTGSPNFLWHALIDA
ETYTCGNITDAIYCTDALEGEATGLTIGNTYYIQVYSHVANANTTFDICVSTNSIPGQTY
VPDDNFEQALIDLGLDTTLDDYVTTANINTVNDLNIRNLGIFDLTGIEDFAALEILNCGL
NFLGELDLSQNTNLNYLIADNAALVALNMQNGNNTNVTTFVTLGNVDLFCIQVDNAAYST
ANWTIIEAMTSFSEYCGNPIQLAAKVYLQGAMLQNTDGFMRTDLKDNNHILTVSPYTDAT
AILATDPVFTATGQDKIVDWIWVELRDAANPSVVLNGKSALLQRDGDIVEALSDNTSTPV
NFARAPGDYYVVIKHRNHLGIMLNMTISFTNMVTAVDFTDGNNQITHGANAQTTFGMPAN
TVGMWCGNVNGDGVVQYSGTNPDAPAILSTVLNDPDNFLNFPTFTVSGYEVNDVNMDGST
QYTGTNPDTPLILQNVLAHPGNFLNFSTYQIVEQLPQNE
NT seq
7320 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagattaagactactatttgcattattgatttttacaaacatcatttgggcaactaca
gaaacaccgccaccttccaacgacaactttgcaaacgctattccggtaagttgtggagga
aattatacagcatcaacagctgaagcaacgttagacgaaaacaatgcgcctgatggtttt
ggggcagacttagatgcaccaaatatttggtattcgtacacaggtaatggaattcctgaa
accattacgttagatttatgtgcttctggatacgatacttcgtatttaatatacacggga
acttctggaaatttaaccttggtggcaggaaatgatgacaatgaaggccaatgtgggccc
ggatatcgttcgtatggaacctttgaatctgatggaataacgacatattatattacaata
acaggatacaacccaacaagtattggagcggttgatttaactgtttcttgtttgccagca
gacattgtttatataacagacgcaaattttgaacaagcattaattgatttgggaattgat
tcgggaacggtaaatggatatgtgtcagttgccgatgttgaccaagtaaatgacttgaat
atcagtaataaaaacataacaagtctatcaggaattgaagcgtttacagcacttgaaatt
ttaatttgtaataacaatgcaattcgttctatcaatctagaaaatcaacccagtttaact
ttactaaattgtagcgacaatgacttaacatttctaagtgtaaaaaacggtaacaatact
aacataacgtcattcaacgctttaaataattttgatttagcttgtattgaagttgataat
actgcatacagtacaacgaactggacgaacattgatagtggagttagctttacacaaaac
gactgtacaaacgtaacatttgtgccagatgataattttgagcaatacttaatagatcaa
ggacttgatgatgtattggataattatgtactaacaaacaacataaatacgattgaagtg
ttttctatatccagtcgtcaaattcatgaccttacaggaataggtggttttacagcgctg
gaagaattaaattgcacaagcaatgagttgacgagtttagatttatctcaaaatgtagca
ttgcgcagattaaaatgttattttaacgagcttaccagcataaacttaacgcaaaataca
gcgttagaaagattggaatgcttcgtaaataatttaactacaattgacctcacacaaaat
acggcacttaactatttacgagcagagctgaatcctttgggcactcttgatctgagtcag
aatttggtattagattatataaatctctcaagaacacaattaacagccataaatcttact
gctaacgttgcattagagaatattgtgctaacgaacaatttactgacaagtatagacgtt
tctcaaaatgtgaatgtaaaaggtctttttgtggacgataattcactaacaagtataaat
gttgttaccaatcaagctttgcaacaattttattgtgacaataacgcaattgaatattta
gacttgtcaaataatacgcaactagtttcattacaagcttcaaacaatgcactgacaggt
atagacttgaaaagcggaaacaataccatacttccaagtgctatcggtggcttttttgac
gtaactggcaacccaaacttaacatgtatagaagtggatgatgtagcatacagtactaca
aattggacagatattgatccgggacttacgttcagtacaaattgtaatccatcaccaatt
ccaccgaatgatgagtgtgtagacgcgattccagtaccaataagtgacggcggttgcaac
acaacggtttcaggaaccttggcaggcgcaacagactcaaatgtataccaatgctttgga
aacacgaatagtttttcagatgtgtggtacagttttgttgccacagatacagcacacgat
attaaaatattaaatacttcaggaataaactctagcgtatttcacacggttattgacgca
caaacgtattcctgtggaaacattacggatgcagtttactgtacggatgcacttgaacga
caagcaacaggattaacgattggagacacctattacattcaagtatttacagatgtagca
aattcaacggaaacatttgatgtttgtgtatccacactaaatattccaggacaaacttat
gtgccagatgataactttgaacaagcacttattgatttaggatatgatgatgttttagat
gattatgtaactacggcaaacattaacacggttgaaacgttagatgtttcaagtgaaaat
attgccgatttaacaggaatccaaggttttactgcattaaaaaatttaaaatgtacatca
aataatttgataagtttagatgttactcaaaacacagtcttagaaattttagacttcgga
ctaaataacataacagctattgatataacgcaaaacactgtcttaaaaatattacgattc
caacaaaatagtttatcaagtattgatgtttcacaaaatgttgatttagaaatttttgca
ggaatgttcaatgggttacaaagtttagatgtaaccaacaatacaaaactaacactccta
aattgttggagtaatggtatcgacgaaattgatttgtctcaaaacccagatttagaattc
ttatctatgagaataaacgatctagtaagtttagacatatcagcaaatccagtactaaga
agtttagattgtcatgcaaatgaactaacatcattaaatgttcaaaacggaaacaattca
aactttacaacatttgtagcaactaacaattctacattgaattgtattcaggttgatgat
gtaacgtatagtacaaccaattggacacagatatcaagtggttcaagttttagtacggat
tgtggttatcttgaaaatgatgaatgtgtagacgcgattctagtaccaataagtgatggc
ggttgcaacacaacggtttcaggaaccttggcaggcgcaacagactcaaatgtataccaa
tgctttggaaacacgaatagtttttcagatgtgtggtacagttttgttgccacagataca
gcacacgatattaaaatattaaatacttcaggaataaactctagcgtatttcacacggtt
attgacgcacaaacgtattcctgtggaaacattacggatgcagtttactgtacggatgca
cttgaacgacaagcaacaggattaacgattggagacacctattacattcaagtatttaca
gatgtagcaaattcaacggaaacatttgacgtatgtgtgtctacaaatacaattcctgga
caaacctacgtgccagatgataactttgagcaaacacttattgatctcggatacgataca
acgctagacaattatgtaactacggcaaatattaacaccataacatctttaaacgtagta
ggcaaaaatatcgcaagcctaacaggacttgaagacttcacagcattacagtcgctcgat
ttttcaatcaataatgttactacagtagatcttactcaaaacgctcaattgagattctta
ttacttaccggaaattcactagcaactatcaatgtttctcaaaatccactcttaagaggg
ttaactgttgaagaaaatttattgacaactatcgatgtcactcaaaatccacttctagaa
tcactaaacatttcaaaaaatttatttacgtctatcgatgttactcaaaacgctggatta
actaatctagatgtaggagaaaattcactaagccaaataaatgtcactcaaaatcctgtt
ttggcctttttaacactagataaaaacaatttttctgccgtagacgttacaaacaatcca
ctactttccagtttatctgttgaagaaaattcattgacaacaattgatatcacccaaaat
ccagtattattaggtgcctattttggatacaaccaattaacaacaattgatgtttctcaa
aacctagcactagaaacgctagttgttactgcgaatagccaaatttcaacaatagatgtt
tctgtaaacgcagctttaaaaaatttaaggataaatagcacacagatatcagaagtaaat
gtttcaaataatctaaacttggaaggtttgtccgtgtcaaattgtcccataactggagtt
gatcttactgcgaatgttgcactacaaaatttaggtgtcgtaggaagccaattaactacg
atcgatgtatctcaaaatccagcatttgtaagcttattttgcagtaatacaagtacactt
accagtgtaaatattcaaaatggaaacaatacaaacgttacaaccttctttgctttaaac
acaccaaatcttacctgtgttcaggtagataacgtagcatatagtgcagccaattggagt
aatgtagatgctggaataaatttcagtgcaaactgtggttttcctgtaaacaatacctgt
gtaaccgcaatcaacgtcccaataagtggtattgcatgtaacaatgtaatagaagcgaca
atagttggtgctacgaactctaattcgctacagtgttttggaaacaatgcaaactttacg
gatgtgtggtttagctttgtagccaccgaaacaacacataaaattgcattacaaaaccta
acaggttcgccaaactttctttggcactccctaattgatgctcaagcatatacctgtgga
aacattacagatgccatttactgtacagatgcattagaagataccgcaacaggattaaca
ataggaaatacgtactacatacaagtatattcacatgtagcaaatgcaaatactacattt
gacatttgtgtgacttcatttgcaattccagggcaaacatacgttccagatgataacttt
gagcaagcactcattgatctcggatatgacataactttagataattacgtaacaacaaca
aatatttctggcattgaaaacttaaacatctcagaaagaagtattgccgacttaacagga
attgaagattttacagcgttgaaagaattaagatgtgaaacaaacaatcttacaaactta
aatatcacgcaaaatacacaacttacccttgttcacgcatttaacaatacgctaacaaac
gtcgattttacacaaaacacagcgttggtgcaactattcatatcaaacaatcaattgtcg
actattgatgtatctcaaaatacagcattggtagatttaggtatttttaccaatccgcaa
ctaggaagtattgatgtatctaacaactcaaacttaaaaacattaaatataagttataca
ccagtttcagaaattgacgtttccaacaacttagctttagaacgattgtcatttgtagat
tgccctatatcagaaattgacgtaacagccaatttagaattgagacaattaagtacttcg
cagagtctagtgacaagcgttgatgtatctggaaacccattatttgaatggatatcttgt
agaaacagtccattgcttacacaattaaacttgcaaaatggaaacaatacgaattttgta
tttttcctagctaccgatacgccaaacctaacctgcattcaagtagataatgctgcctac
agtactgcaaattggacaaatattactccaggaacaagttttagtacagattgtgggtat
cttacgaatgatgaatgtgtagacgcaattaacgtcccaataagtgatgctacatgtaac
aatgtaatagccgcgacaatggcaggtgcaacaaactctaattcgttacagtgttttgga
aataatgtaaactttacggatgtgtggtttagttttgttgccaccgaaacaacgcataaa
attgcattgcaaaacctaacaggttcgccaaactttctttggcacgccctaattgatgca
gaaacatatacctgcggaaacattacagatgctatttactgtacagatgcattagaaggt
gaagcaacaggattaaccataggaaatacctactatatacaagtatattcacatgtagcc
aatgcaaatacgacattcgacatctgtgtatctacaaactcaattccaggacaaacctac
gtgccagatgataactttgaacaagcattgatcgatttaggcttagataccaccttagac
gattacgtaaccacagcaaacatcaacacggtaaacgacctaaacattcgtaatttgggt
atttttgaccttacaggaatagaagactttgccgctttagaaatcctaaactgtggctta
aactttttgggtgaattagatctaagtcaaaacacaaaccttaactatctcattgcagac
aacgcggcgttggttgccttaaatatgcaaaacggaaacaataccaatgtcactacgttt
gtcacactcggtaatgtagatttattctgtattcaagtagataatgctgcgtatagtact
gccaattggacaattattgaagctatgacaagttttagcgaatattgcggaaatcctatt
cagttggcggcgaaagtatacttacaaggcgcgatgctgcaaaatacagacggttttatg
agaaccgatttaaaagataacaatcatatcttaaccgtaagtccatatacagatgcaacg
gcgattcttgcaaccgatcctgtatttactgctacgggacaagacaaaattgtcgattgg
atttgggtagaactcagagatgccgcaaatccatcagtggtcttaaatggcaaatctgcg
ttattacaacgcgatggagacattgtagaagcactttcagacaatacgtcaactcctgta
aactttgcgcgcgcgccaggcgattactatgtcgttataaagcacagaaaccatttaggc
atcatgttaaatatgactatttcttttacaaatatggtcactgctgtagattttacagat
ggtaacaaccaaattacccatggtgcaaacgcacaaacgacctttggaatgcccgcaaat
acggtaggaatgtggtgtggaaatgtaaatggtgatggtgttgtgcaatactcaggaacc
aatcctgatgcgccagccattctctcaacagtactaaatgatcctgacaacttcctaaac
tttccaacgtttacagtaagtggttacgaagtaaatgacgttaacatggatggaagcacg
caatacacaggtacaaatcctgatacgccgctaatcctacaaaacgtactagcgcatcct
ggaaactttctaaactttagtacctatcaaatcgtagaacaactacctcaaaacgaataa
DBGET
integrated database retrieval system