| Entry |
|
| Name |
(GenBank) head domain of trimeric autotransporter adhesin
|
| Organism |
|
| SSDB |
|
| Motif |
|
| Other DBs |
|
| LinkDB |
|
| Position |
complement(548664..552758)
|
| AA seq |
1364 aa
MKKNTLLIIALLFCVISYAQNFNYQAVVRDASNTPVANQSIGVLVRIIEGSPTGSVVYNE
THTVTSNAQGVITLPVGGGTSGANFLAINWSSQNQWIDIQVDITGGTSYVQLGTSKLQFV
PYAMYALNSGEAGNAGIFAVNGGVVSNGNGNNVTDDFVFGSDQLDNNGSFNAAFGNRMFY
DKSKAAFRAGYTQTDQWDEAKVGDYSVGFGEGGVASGRNSFSMGRNANATGNEAFAFGLN
AGGFADYARGFGLNARAHGINSTAIGRQLNANSMAEIQLGQYSNFVSGSTDTWVPTDRLF
VIGNGQEDINLALNSDALVMLKNGNTTLNGTLTIDGDNAGAGTSFTLPAQDGSANQIMQT
DGSGNVAWVTPAASAIPNGGTSGYVLSTDGLGVLSWVTNDDADNDPTNEIELPTQTGEAD
KFLTTDGTAVAWQDVPNELPTGGTNGQVLVTDGSGVYSWVNQTATAGFSTTGNVTSNANG
DTTVDDFVFGSTQIDDIPGIPDNNRIVFDKSNAGAFRAGSAFNTPYFNQDQMGGGSVGFG
VNNQAGGNYAATMGFFNNSSGYASFSTGDFNTASGAGSASIGSNNTTSGAYAMSLGIQLT
SESLAQITLGTNNTGVTGNAATFVATDRLFVLGNGADTANKSDALVVLKNGNTTINGTLT
IDGDNQEIERGYTLPAQDGNVDQVMTTDGAGNVAWADAATGSGAFITTTNITSNANGDTA
TDDFVFGSSQLEDITTATNDDSRMFFDKSKQAFRAGGASGSQWNDMNVGGNSIVLGNNSI
ASNTSAVAIGESNVASGVAAITAGTSLTAESFGQTSIGTYNTRVTGNATQFVETDRLFVI
GNGTNPDEAFRAVGFSDALVMLKNGNTTLNGQLTIDADNQGAGTGYTLPGQDGTANQILS
TDGSGSTSWVDAPMAAMSAFSTTASVTSNANGTIATDDFVFGSTQLDNDTNTTDDDRRLF
FDKSKGAFRAGIAEINEWDDASVGEFSIALGRRPFAEGSASIALGTFSSAIGDESVSIGH
AASTYGLRSTSIGYRVLAQSKEQITIGTYNTLVEGDLNNWVSTDRLFVIGNGDADNGTAP
RSDALVMLKNGNTTLNGQLTIDGDNQGAGASYTLPAQDGTANQVLTTDGAGNVAWAAVAA
GTMLPSGGTDGQLLKTDGSGNYAWVTDAVDDADNDPTNEIELPTQAGESGKFLTTDGTNP
SWTNTVEATSVKIPSLPAFNVAANGTVYTTAGEKEVGDWNSSVNTDLFNDGSHLNLTNGR
FTAPVDGLYFFSAQVRIDAINGASGSVYSRLMIVKNGNKQGFRNGLHSIRNADAGTANWD
TQHVSGILKLSAGDYVSVFVESTGDANFIVQTESGFNGYLVNKL |
| NT seq |
4095 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaaaaaaaacaccttattaataattgccttattattttgtgtgataagttatgcgcaa
aacttcaattatcaagcggttgttcgtgatgcgtccaacactcctgttgccaatcagtca
attggtgtactggtaagaattattgaaggaagtcccacaggaagtgtcgtgtacaatgaa
acacatacagtaacttccaatgcacaaggtgtcattacgctgccagttggtggtggaact
tctggagctaacttcttagcaatcaattggagttctcaaaatcagtggatcgatattcaa
gtagacatcacaggcggaacaagctatgtccaactaggcacctcaaaactgcaatttgta
ccgtatgctatgtatgcattaaacagtggcgaagctggaaatgcaggaatatttgctgta
aatggtggtgttgtaagcaacggaaacggaaataacgtaacagacgattttgtatttgga
tctgatcaattagataataacggatcttttaatgcagcctttggaaatagaatgttctac
gacaaaagcaaagcggcttttagagcaggatacacacaaacagatcaatgggatgaagcc
aaagtaggagattattctgtaggttttggtgaaggtggagtagctagtggacgcaactca
ttctctatggggcgtaatgccaatgcaactgggaatgaggcttttgctttcggattaaat
gcgggaggttttgcagattatgcaagaggttttggattaaatgcacgtgctcatggtata
aattcgacagcaattgggcgacaattaaacgccaactcaatggcagaaattcaattgggt
cagtacagtaactttgtttctggttcaacagatacttgggtgccaactgatcgtttattt
gtcattggtaatggacaagaagatatcaacttagcactaaacagtgatgctttagtcatg
ctaaaaaatggaaatacaaccttaaatggtacactaacaatagatggtgataacgcagga
gctggaacttcttttacacttcctgctcaagatggttcagccaatcaaatcatgcaaaca
gatggttcaggaaatgttgcgtgggtaacaccagcagcttcagccattccaaatggagga
acaagcggatatgtattgtctacagatggtttaggagttttatcatgggtaactaatgac
gatgcagataacgatccaacaaacgaaatagaattgccaacacaaactggagaagcagat
aaattcctaacaacagacggaactgccgtagcttggcaagatgttcccaatgaattacca
acaggaggaactaatgggcaagtattagtaactgatggttcaggagtctattcttgggtt
aatcaaacagcaacagcaggtttttctacaactggaaatgtaacaagtaatgcaaacggt
gatacgacagtagatgattttgtatttggaagtacacaaatagacgatatccctggaatt
ccagataataatagaattgtattcgataaaagtaatgcaggtgcctttagagcaggtagt
gctttcaatacaccatatttcaatcaagatcaaatgggaggaggatctgttggttttgga
gtaaacaatcaagcaggaggaaattatgcagctacgatggggttttttaacaattcaagt
ggatatgcatctttctcaacaggagatttcaatacagcttcaggcgctggttcagcttca
ataggatctaataatacgacctcaggtgcgtatgctatgagcttagggatacaattaacc
tcagaatctttagctcaaattactttaggaacaaacaatacaggagtaactggtaatgcg
gcaacttttgtagcaacagatagattattcgtattaggaaatggagcagatacggcaaat
aaaagtgatgctctagttgtattaaaaaacggaaacacaactataaacggtacattaacc
attgatggagacaatcaagaaatagaacgtgggtataccttgcctgcacaagatggtaac
gtagatcaagtaatgacaactgatggagctggaaatgttgcttgggcagatgctgctaca
ggttcaggagcattcataacaactacgaacataactagcaatgctaatggagataccgct
acagacgactttgtatttggaagttcacaattagaagatattacaactgctaccaatgat
gacagtcgtatgttttttgataaaagcaaacaagcttttagagcaggtggcgcaagtggt
tcacaatggaatgatatgaatgtaggtggaaattctatagtgctcggaaataactctatt
gcaagtaatacgagtgctgtggcaataggagaaagtaatgttgcgagtggagtggctgcg
ataaccgctggtacaagtttaacagcagaatcatttggacaaacatctattggaacctat
aatacgcgagtaacaggaaatgcaactcaatttgttgaaacagatcgtttatttgttatc
ggtaacggtacaaatccagatgaagcttttagggctgtaggatttagtgatgctttagtc
atgctaaaaaacggaaatacaacgctaaatggtcaattaacaatagatgcggataatcaa
ggtgctggaactggatacacattaccaggacaagatggtactgcaaatcaaatactaagt
acagatggatcaggaagtacttcttgggtagatgcgccaatggcagcaatgtctgcgttt
tctacaactgctagtgtaactagcaatgctaatggaacaattgctacagatgattttgtt
tttggaagtacacaattggataacgatacaaatacaactgatgatgataggagactattt
tttgataaaagtaaaggagcatttagagctggaattgcagaaataaacgaatgggacgat
gctagtgttggagaattttctatagcattaggaagaagaccatttgctgaaggtagtgct
tctatagctttaggtacattttcttctgctataggagatgaatcggtatctataggtcat
gcagcttctacttatggcttgcgttctacgtccataggttatagagtacttgcacaatca
aaagaacaaattactataggaacatataatacattagtcgaaggggatttgaataattgg
gtaagtacagatagactttttgttataggtaatggtgatgcagataatggtactgcgcca
aggagtgatgctttagtaatgcttaaaaacggaaatacaactttaaacggtcaattaaca
attgatggagacaatcaaggtgctggagcttcgtatacattaccagcacaagatggaaca
gcaaatcaagtactaactacagatggagctggaaatgttgcttgggcagcagttgccgct
ggaacgatgcttcctagtggaggaactgacggacaactattaaaaacagatggttcagga
aattatgcttgggtaacggatgcagtagacgatgcagataatgatccaaccaatgaaatt
gaattaccaacacaagctggcgaatcagggaaatttttaactactgacggaacaaaccct
agttggacaaatactgtagaagctactagtgtaaaaataccaagtttgccagcgttcaat
gtagccgctaacggaaccgtatacactacagcaggagaaaaagaagttggcgattggaat
agttcagtaaatacagacctttttaatgatggaagtcatttaaacctcacaaacggacgt
tttacagctccggtagatggattgtatttcttctcagcacaagtacgaattgatgcaatt
aatggcgcttctggttcggtgtattcacgtttaatgattgtgaaaaatggtaacaagcaa
ggatttagaaacggtttacactctattagaaatgcggatgcaggaactgccaattgggac
acgcaacatgtaagcggaattttaaaactaagtgctggagattacgtatctgtatttgtt
gagagtactggagatgcaaactttatagtacaaactgaatcaggtttcaacggatattta
gtgaataaactataa |