Kordia sp. SMS9: KORDIASMS9_04092
Help
Entry
KORDIASMS9_04092 CDS
T05562
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
kos
Kordia sp. SMS9
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kos00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
kos02000
]
KORDIASMS9_04092
Transporters [BR:
kos02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KORDIASMS9_04092
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
YadA_head
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXG71834
UniProt:
A0A345H5J6
LinkDB
All DBs
Position
complement(4680058..4682739)
Genome browser
AA seq
893 aa
AA seq
DB search
MRKQLPLVVVFILCVLGITGLQAQTLNETMGTGSGVSITTGDFNTFYGDSTGSFITSGSR
VTLFGYSAGRSVTTSELVAIGYLAGYSNTTGFDNTFMGYEAGRLTTTGGDNTFIGAESGE
NNTTGYDNTFVGEESGANNTTGYENTFIGEDAGFSNTTGYKQTFVGNEVGISSDVGYRNT
GIGSESMSDVDDGHHNTGVGDSAAIDIGDGIYNTMVGAAAGVATEWADYNTFIGAQAGWD
NNRTNNTSNANHNTYVGFSTGFTNREGQYNVGMGSLADFDNTNRSNTMFFGYDITASNNN
VMGFGNYSFIDGQYSISLGIDHDIRGDYSIMMGYLGNMGTLADYSVGIGDRVNVAENDAV
GIGRSVDIDNQFAIAIGSTTIAQNDGAIVMGYQASSTDPSALNPTNNIAIGNAANVQGTN
SVAIGNAATAVNDNTMVLGGVTNPLSVGIGTDTPNANASLDLTGATKGLQLNRMTTAERT
AFGSSLGATDEGMVVYDSETDNSFYWDGTQWKGMMDTDTDTQDLSLVTNTLSLTDGGSVD
LSPYLDNTDAQAISVAADVLSITGDAGTVDLSPYLDNTDSQAISVSSDILSITGDAGTVD
LSGYLDNTDNQDLAISANVLSISGGMTTIDLSGYLDNTDEQDLSLSGTTLNISGGTGVDL
APLQDGTGTDAQAISVASDILSITGNASTVDLSGYLDNTDSQNLSLSGTTLNITGGTGVD
LASLADGTGTDDQNLTSATLSGNTLTVAIEGGTSVNVDLSPILSALEAENIAQQAQIDDL
ITRVDAIEVCACDGTLSVVPANNANRSGAILYQNIPNPFNNTSSIRYFIPQELTGDAAIV
FVNTAGQVISNVELTQKGDQELNINTNSLSSGMYYYTLYVGGKKVATKKMIIE
NT seq
2682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaacaattacccctcgtagttgtgtttattctgtgtgtattaggaattacagga
ttacaagcacaaacactcaatgagactatgggtactggttccggagtaagtatcactact
ggagacttcaacacattttacggagatagtacaggtagttttatcacttccggatcaaga
gttaccctttttggatacagcgcaggacgaagcgttactacaagtgagcttgtggctatt
gggtatctagcaggatattcaaataccacaggttttgataatacctttatgggatacgaa
gcaggtcgtttgaccactactggtggagataacacatttatcggagcggaatctggagaa
aacaatacgactggttacgataacacgttcgtcggtgaagaatctggagcaaataacact
actggttacgaaaacacattcatcggagaagatgcaggttttagtaacactactggttac
aaacaaacatttgttggtaacgaagtaggtatttcttctgatgtaggataccgaaataca
ggtattggtagtgaatctatgagtgacgttgatgacggtcaccacaacacaggagttgga
gattctgctgcaattgatattggtgacggtatttacaacaccatggttggtgccgctgcg
ggtgttgctacagaatgggcagattataacacattcattggagcacaagctggttgggat
aacaaccgtacaaataatacatcaaacgcaaaccacaacacgtatgtaggtttctctact
ggttttacaaaccgtgaaggacaatataacgttggtatgggatcgttagcagattttgac
aatacaaaccgttcaaatacaatgttctttgggtacgacattactgcaagtaacaacaac
gtcatgggatttggtaactactctttcatagatggacagtactcaatttctttaggtatt
gatcatgacattcgtggagattactctattatgatgggatatttaggaaatatgggaacc
ttagccgattactcagttggtattggtgatcgtgtgaatgttgcagaaaatgatgccgtt
ggtattggtcgttcagttgatattgacaatcaatttgccattgccattggttctactaca
attgcacaaaatgatggagctattgttatgggatatcaagcttcttctacggatccaagt
gctttaaatcctacaaataacattgctattggtaatgcagcaaacgtacaaggaacaaat
tcagttgctattggtaatgcggcaactgccgtaaatgataataccatggttcttggtgga
gttacaaacccattaagtgtcggtattggtacagatacaccaaacgcaaatgcttcttta
gatttaacaggcgcaactaaaggtttacaattaaaccgtatgacaaccgcagaacgtact
gcttttggaagctcattaggagcaaccgacgaaggtatggttgtatacgattccgaaact
gacaattcattctattgggatggaacgcagtggaaaggaatgatggacactgataccgat
acacaagatctatcattggttacaaatacattaagcttaacagatggaggctcagtagat
ctttctccatatttagacaatacagatgcacaagcaatttctgttgctgctgatgtatta
agcattacaggagatgcaggaactgtagatttatctccatatttagataatactgatagt
caagcaatttctgtttcaagtgatatattaagtattacaggagatgctggaaccgtagat
ttatcaggatatttagacaatacagacaatcaagatttagcaatttcggcaaacgtatta
agtatttctggaggaatgacaacgattgatttatcagggtatttagacaatacagatgag
caagatttatcattatctggcacaacgttaaatatttctggtggaactggtgttgattta
gctccattacaagacggaacaggtacagatgcacaggcaatttctgttgcttcagatata
ttgagcattacaggaaacgcttctacagtagatttatcaggatatttagacaacacggat
agtcaaaacttatcattatctgggacaactttaaatattacaggaggaaccggtgttgat
ttagcttcgcttgcagacggaacaggaacagatgatcaaaacttaacatctgcaacgttg
tctggaaatacattaacggttgcgattgaaggaggaacttcagtaaacgttgatttatct
ccaatcttatcagctttagaagcagaaaatattgcacaacaagcacaaattgatgactta
atcacaagagtagatgctattgaagtatgtgcatgtgatggaacactttcagtagttcct
gcaaacaatgctaatagaagtggtgccattttatatcaaaacattccaaatccatttaac
aatacatcttctatccgttacttcattcctcaagaattaacaggtgatgctgctattgta
tttgtgaatacagcaggacaagtaatttctaatgttgaattaacacaaaaaggagatcag
gaattaaacattaacacaaactcattatcttctggtatgtactactacacattatatgta
ggtggtaaaaaagtagctacgaagaaaatgattatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
