Kordiimonas sp. SCSIO 12610: KFF44_13870
Help
Entry
KFF44_13870 CDS
T08324
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
koz
Kordiimonas sp. SCSIO 12610
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTW54879
LinkDB
All DBs
Position
3029563..3032682
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MNKLIEWWARNTVAANLLMIGLFLLGAISFFKMEREIEPTVRFPGLEIRVAWPGASPEDV
EKQIIERIEESVRDLDNIDWVRSFASEGSANVVILALDDVDFVQFQNDVKVRVDSISSFP
RDIEPPQVTQFINRNEYIRIAVSGDIGERNLKRLAEELRREVAVLPAISLVELFGVRREE
VTIEVSEDALRRYNLTFSQVSDAIRASSLNLSSGALQTEAGQYTVAIRNQADTEAQFSKI
IVRQTVDGATIRLSDVANIIDGFEDNEILATLNGQPAVLIQVLTTEYMNIVQASESVKEW
ITKRQDSLPEGVELTLWTDQAEAFNSRMTTIGESALYGLLLVVVVLLLTLRPKVAFWVTA
GIAIAYAGAFFILPYVGVSINMLSTFAFLLVLGIVVDDAIVVGENIHSESQKTGGGITAA
VLGAQLVAKPVVFAVLSTIIMFLPWLFLSGSTTEFTRNITWVVVSALTISLIESLLILPA
HLSKMKPREKLNAFGRFQKRIADSIINFAQTKYRRIGTWAVNRRYLSMSIFFAVMFFGFG
LFGSPFVKTGFFPEIESDQINVNVVMPEGTPYSRSLEVLKQLQDAEKALEQEVNARTGGE
GKLIENWYTRSRRDSVLAIVKLAPPEVRDMSAKDASIRLRELMGEVPDAEEVSVDYTQSD
GDPGFELSVRHPDLKVLQDAVNALETQMRTYEALYDIRNNLQGDSQEIRMTLKPGTEKLG
LTLAQVSQQIRNAYFGLEVSRIPRSGQDVRVMVRYPKEARRSIESLKDFRVRTVDGNEVP
LTAIADLEYAPGIKRIARWNGNRAARVSADMKDDVRDDIMKDLEENFFPTWEKQFPGVVR
GSIGQAEGERRFFQELLQLNLIAFFVLYMMLAVAFKSYWQPILIMIAMPFAFVGAVFAHF
AMDMTVGLFSFFGIAAAIGVVINDNLVLMDYYNRLRLRGMDAYEAVVESGVARFRPIMLT
TVTTIIGLIPMMLEQSIQAAFLKPIVLALAAGVFIAFFVTLILVPSMCAAGADASAFFGR
LKTRIFNRGNGYEVPSQAE
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaattaatcgaatggtgggcacgaaatacagttgccgccaacctcttaatgatt
ggcctatttctactaggtgctatttcattctttaaaatggagcgtgaaattgagccgacg
gttcgctttccaggtctggaaattcgtgtcgcttggccaggtgcttcaccagaagatgtt
gaaaaacagataattgagcgaattgaagagtctgttcgtgacctggataatatcgattgg
gtgcgttccttcgcgagtgaaggatcagcgaacgttgttattctggcgcttgatgacgtt
gattttgttcaatttcaaaatgacgtaaaagtgcgcgttgattccatatcttcgtttcct
cgcgacattgaaccgcctcaggttacccaatttattaaccgcaatgaatatatccgcatt
gctgtaagtggtgatattggcgaacgtaacctcaagcgtttagctgaagaattgcgcaga
gaggttgccgttttaccagcgatctcgcttgttgagctctttggcgtaagacgtgaggaa
gtaacgatcgaagttagcgaagatgcccttcgtcgatataatctgacgttctcgcaggtt
tctgatgcgattagagcaagctctttgaacctttcatcaggggctcttcaaacagaagct
ggtcaatacaccgttgccattcgcaatcaagcagatacagaagcgcaattcagtaaaatc
atagttagacaaactgttgacggtgctacaatcaggctttctgatgttgctaacatcatt
gatggttttgaagacaatgaaatattagcgactttaaatggccaacctgcggttcttatt
caggttctaactactgaatatatgaatatcgtacaggcttctgagtccgtaaaagaatgg
ataactaaacgtcaggacagcttaccggaaggtgtggaattaacactttggaccgatcag
gctgaagcctttaatagccgcatgaccacaataggcgaatctgcgctttatggtcttcta
ttggttgttgttgttctattgttaacattaagaccaaaagttgccttttgggtaactgcg
ggtatcgcaatagcctatgctggtgcgttctttatcctgccatatgttggtgtttcaatt
aacatgctatcgacatttgccttccttcttgtactagggattgtagtggacgatgcaatc
gttgttggtgaaaatattcacagcgaatcccaaaaaacaggggggggtattactgccgcc
gtattaggggctcaattggttgcgaaaccagtggtatttgctgtattatcaacgatcatt
atgttcttaccatggttgttcctatcgggttcgacaacagaatttacaagaaatattaca
tgggttgtcgtatcagcgctgaccatatctttgatcgagtctttattgattttgcctgct
cacttgtcgaaaatgaagccacgtgagaaacttaatgcgtttggacgtttccagaaacgt
attgccgacagcatcatcaatttcgcgcaaaccaaataccgtagaattggaacgtgggct
gttaatcgcagatatcttagcatgtctatctttttcgcagtcatgttctttggttttggt
ctgttcggttctccgtttgtcaaaactggctttttcccggaaatcgaaagtgaccagatt
aacgtaaatgttgtgatgcctgaaggcacgccatattcacggtcactggaagttttaaaa
cagctgcaggatgctgagaaagcactcgagcaagaagttaatgctcggacaggcggtgaa
ggaaaactgattgaaaactggtacacacgctctcgcagagatagcgtactggctattgta
aaacttgcgccacctgaagtccgtgatatgtctgcaaaagacgcttctattcggttacgt
gaactgatgggtgaagttcctgatgcagaggaagtatcagttgactacactcaaagtgat
ggtgaccctggttttgaactatcagttaggcaccctgacctcaaagtccttcaggatgca
gtgaacgcactcgaaacccaaatgcggacatatgaagcgctttatgacattcgcaataac
ttgcaaggcgatagtcaggaaattcgtatgacgttaaagccgggtaccgaaaagcttggt
ttaacgcttgcacaagtttcacagcaaatccgaaatgcatattttggactggaagtatca
cgaattcctcgtagcggtcaggatgttcgtgtgatggttcgctaccctaaagaagcacgc
aggtctattgaaagcctcaaagactttagagtgcggactgtggacggcaatgaagttcca
ttaacagcgattgcagaccttgaatatgccccaggcatcaaacgtattgcgcgctggaac
ggtaacagagctgcccgagtgagcgctgacatgaaggatgatgtacgtgatgatatcatg
aaggaccttgaggaaaacttcttccccacctgggaaaaacaattccctggtgtcgttcgt
ggtagcatcggtcaagcagaaggcgaacgtaggttcttccaagagcttcttcagcttaat
ctcatcgcattctttgtgctctatatgatgctcgctgttgcgttcaagagctattggcag
ccgatactgattatgattgcgatgccattcgcattcgttggtgccgtatttgcccacttt
gcgatggatatgacggttggcctctttagcttcttcggtatagcagccgcaatcggggtt
gtgattaatgataatctcgttctcatggattattataatcgccttcgcttgagaggtatg
gatgcctatgaagcggtggtagaatcaggcgttgcacgctttaggccgattatgcttaca
actgttacaacgattatcggattgataccaatgatgctggaacagtctattcaagcagct
ttcttgaagccaatcgtgcttgcgttagcggcaggtgtattcattgccttctttgttaca
cttatactcgttccaagtatgtgtgcagcaggtgctgatgcatcagctttctttggtaga
ctgaagacccgcatatttaaccgcggaaacggttatgaggtcccaagccaagctgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system