Keratinibaculum paraultunense: JL105_10710
Help
Entry
JL105_10710 CDS
T07032
Name
(GenBank) sigma 54-interacting transcriptional regulator
Organism
kpar
Keratinibaculum paraultunense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
Sigma54_activ_2
AAA_5
PAS
Mg_chelatase
AAA
SpoVT_C
PAS_8
AAA_2
HTH_8
PAS_9
AAA_7
HTH_50
AAA_16
NtA
PAS_4
AAA_22
GAF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQY79636
LinkDB
All DBs
Position
complement(2189029..2190783)
Genome browser
AA seq
584 aa
AA seq
DB search
MNLFNIQKSTQEVAEAISAVLNVDVTIVDIHLNRVAATGEYKNLIGRSLPKNCAFESIAN
KRKPEFIDNPNISQKCKGCSLRGSCAEMATVGYPILNGEDLLGVIGLIAFNMEQKKKLQR
EYNSLIVFLSKLGDLLAGNLKYANTIINLKIQTEETKKIIDGLGNGIICTDNLGNIKFVN
SKAEDYLKIDSNNIINKSIFEIIPSLQLNFKEYIPIETKLTIDNKRESFVIKIIPVMIQD
KKVSNIIEIHETFNMVKSAFTLLEGQNNISFDDIIGDSPKMLKSKEMSERVATSKSSILL
RGESGTGKELFARAIHNSSNRKNAPFVAINCASIPDNLLEAELFGYEGGAFTGAKKTGQM
GKFELANEGTLFLDEIGDLPIHLQPKLLRVLQEEAFMRVGGRELIPVNFRLIAATNRNLE
DMISKGEFREDLYYRLNVIPIHIPPLRERIGDIEKLSNYFINKYCKKLNKDLKYFSKEVK
EAFSRYNWPGNVRELENVIEYLVNVVNSREIKLENLPYNIKQYFKGNNAKKDSLKEIMDD
YEKNILKSYLEAYGNTTKDKEKIASILEIDLSTLYRKLNKHNLQ
NT seq
1755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttatttaatatccagaagtcaactcaagaagtagcagaagctatttcagcagtt
ttaaatgtagatgtaaccattgtagacatacatttaaacagggtagctgctacgggagag
tataaaaatttaataggacgaagtttacctaaaaattgtgcatttgaatccattgctaat
aagagaaaacctgagttcatagacaatcccaacataagtcaaaaatgtaaagggtgtagt
ctaagaggaagctgtgcggaaatggcaacagttggttaccctatattaaatggtgaggac
ttattaggggtaatagggcttatagctttcaatatggagcaaaaaaagaaacttcaaagg
gaatataattcattaatagtttttttaagtaaattaggcgatctattggctggtaatcta
aagtatgcaaacacaataataaatttaaaaattcaaacagaagaaacaaaaaagataata
gacggactgggcaatgggattatttgtactgataacttgggaaacataaaatttgtcaat
tctaaagcagaagactatttaaaaatagatagcaataatattataaacaagtctatattt
gaaataattcctagtttacagttaaattttaaggagtacattccgattgaaactaaactt
actatagataacaaaagagaaagttttgttataaagataattccagtaatgatacaagat
aaaaaagtaagcaatataatagagatccatgaaacttttaatatggtaaagagtgctttt
actctattagaaggacaaaataacattagttttgatgatataattggagatagtcctaaa
atgttaaaatcaaaggaaatgtccgaaagagttgcaacaagtaaatctagtatactcctt
agaggtgagagtggtacgggaaaggagttatttgctagggctatacacaattcaagcaat
aggaaaaacgctccctttgtggctattaattgtgcttctattcctgataatttattagaa
gcagaattattcggatatgaaggaggtgcttttactggtgcgaaaaagacaggacagatg
ggaaagtttgaactagccaatgaaggaaccttatttttagacgaaataggagatcttcct
atacacttacagcctaaattattaagggttcttcaagaagaagcttttatgcgagtagga
ggcagggagcttattccagttaattttagattaatagctgctaccaatagaaatttagaa
gatatgatatctaaaggagaatttagagaagatttatactatagattaaatgttatacct
atacatatacctcctttaagggagagaataggagatatagaaaagttaagtaattatttt
attaataagtattgcaaaaaacttaataaggatttaaaatatttttccaaagaagtaaag
gaagcttttagtagatataattggcctggtaatgtaagagaattagaaaatgtaatagaa
tatttagtaaacgtggtaaatagtagagaaattaaattagaaaatctaccttataacata
aaacaatattttaaaggtaacaatgctaaaaaggatagcttaaaagaaattatggatgat
tatgagaagaatatattaaaatcctatttagaagcttatggtaatacaactaaggataaa
gaaaaaattgcttcaatattggaaattgatttgtcaacattatatagaaaattaaataaa
cataatttgcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
