Kangiella profundi: CW740_08075
Help
Entry
CW740_08075 CDS
T05254
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
kpd
Kangiella profundi
Pathway
kpd02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kpd00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CW740_08075
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
Calx-beta
MetallophosN
CooC_C
Big_1
Cleaved_Adhesin
GHMP_kinases_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUD79202
UniProt:
A0A2K9ANL2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1731066..1735598)
Genome browser
AA seq
1510 aa
AA seq
DB search
MFGGNNIAEAAGSDSVKVVLSKPKLSKPLTTVAKPLPEVTNARKYKLRQSGEKVPGYDLI
REVPNQNHPFADELLLRNTDFDKDPVLQKSQKHDKFSPLLPSIGTGFDGMGNVTGAVPPD
TVADVGPNHVVQMVNTALAIWDKEGNQLAGPIAINQLWSGFGGLCESTNRGDPIVLYDSA
ADRWMLSQFAFTDGFTDNRECIAISQTNDPTGAYYLYDFAYSTTKFNDYPHFGVWTDAYY
MGVNQFQAPNLNYAGAGVVAYERDKMLAGQPAQQVIIDLQNLYPNAFTPMPADIDGTYLP
PEGMPGYFVTSGATPNTMDVYTFDVDWNTPENSSFSLKNSVPVAEYNGGICSYARDCITQ
PNAQKLDAIGERMMFRLAYRLLDGTDHKLVANHNVVGSDTDDNIAGVRWYEFDLDPVTGQ
ASVANQGTFNLADGNSRWMGSAAMDAAGNIGVAYSVSGPSTNPSIRFSGRYADDPADTLT
VPEQELKAGGGAQAGANRWGDYSSLSVDPEDDCTFWYTTEYYKAENDNSSAWSTYIGSFK
FDNCVAGPKGYIEGTVTDNSGNPIAGAKVSAGAATVVTDESGNYTMTLPAGSIYDLGFSK
YGYIAGSVNNIDLAEDEVEDVDIVLDNAEAITISGTVADGSGLGTPLYAEVMIKAPGATI
TTFTDPVTGQYSIDAYEGTLVKIQASSIDPGYLEQSYDILPENTPVQNFDLQIDSNCTAQ
GYIWNTFFEGFDSGVPPAGWTVEDISGSGMQWQAASTAPKGNLLNVSGEAAAIDSDAAGT
NNLVSSVLVSPTIYVADIESTTLNFASLFRTFGYSDVYTVDISVDGGEWTAVHTFNPTNM
VETISVDLSAQLAGATSFKIRFAYEADYEYYAYIDNVTFGTPSCIASSGSYQSGYVVDAN
TQLPIIGAQVTSGNSTATTVATVDNEQLEDGFFRIFIGSGGTAEAEVTASNYKTVTVDLS
GYGLSQPIALDAGLLELGAADFEVAEGLDRTVTAQLENLGNADANYELSLYITRDDSPVA
KPYGIFHQATRRFGPKALQEMDTKKIRYRSMAPSVPEVEVEFVSQFPTELTLGWGIGFDK
TTSEIWVGDVTAGGAPLDALHKYVDGIKTGHFIDTSAVTVGYAADLAYNARTNTFWQVAV
TGDTCIHEIDTVAGTVTGNKICPTFGTSQRGLAYDPISGTFYAGSWNDSVVHQFDAEGNI
LRSINVDLAVSGLALNPVTNHLFVMSNDAAGSIEPDIVVLDASTPELDPIGLIYVPSVDT
DGDDVAEDLMDGGQAGLAIDCDGNLWAVNQSRQTVVGITSGETGVCDITPTWVELKADSG
SIGANQAGELELDVSTKSLSVGNYSAQLIMTNDTPYGSIVKPVNLTVREPQYGQLGVSGN
SGAIRNGGDIQVTVSRVDGSDYQVSVDYTTVNGTANSGTHYTAASGTLTWADGDTEDKVI
TISTIDTDQSSDLNFSVELSNPEKAQLGTSQVNLTIQKDPPKRGGGGSAGFAILALLALA
GLARRRKYLS
NT seq
4533 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgggggaaataatattgccgaggcagcaggaagtgattctgtcaaggttgtatta
tcaaagcctaaacttagtaagccgctaaccacagttgcaaaaccattgccagaagtaact
aacgctcgaaaatataaactacgtcaatctggggaaaaggttccaggttatgatttgatt
cgtgaagtaccaaatcaaaaccatccttttgctgatgaacttttacttcgtaacacggat
tttgataaagaccctgtgttacaaaaaagccagaagcacgataagttttcaccgctatta
ccttctataggtactggatttgacggtatgggtaacgttaccggtgccgtaccaccggac
actgttgctgacgtaggcccgaaccacgttgtgcaaatggttaatactgctttagccatt
tgggacaaagaaggcaaccagttggcgggtcctatagctatcaaccagctttggtctggt
tttgggggcttgtgtgagtcaactaaccgcggtgatcccatcgttctatacgatagtgcc
gctgaccgctggatgttaagtcaatttgcgtttaccgatggctttacagataacagagaa
tgtatagcaatttcgcaaactaacgatcctacaggtgcttactatctgtatgattttgct
tatagcacaacgaaattcaatgattacccacactttggtgtttggactgatgcttactac
atgggtgtaaatcaattccaagcacccaatttgaattatgcaggcgcaggtgttgttgcc
tatgaaagagataaaatgcttgcaggccaaccagcgcagcaagtcattatagatctgcaa
aatctttatccaaatgcatttacaccaatgccagcggatattgatggtacttatctgccg
ccagaaggaatgccaggttactttgtaacatcaggcgctactccaaatactatggatgtt
tacacgtttgacgtggattggaataccccagaaaactcatcttttagtttgaaaaactcc
gttcctgttgctgagtacaacggcgggatatgtagttatgcgcgtgattgtatcactcag
cctaatgcacaaaagcttgatgctattggtgaacgaatgatgttccgtttggcatatcgt
ttactggatggaactgaccataaattggtagcaaatcataatgtggttggctctgatact
gacgataacattgcaggcgttcgctggtatgagtttgatcttgatccggtaacggggcaa
gcttcggtggcaaatcaaggtacgtttaacttagccgacgggaactcccgctggatgggt
agtgctgcgatggacgctgccggtaatatcggtgttgcttatagtgtgtcaggtccttcc
actaatccttcgattagatttagtggtcgttatgcagatgatcctgcagatactttgaca
gtacctgaacaagagctcaaagcgggcggtggagcacaggctggagctaaccgatggggt
gactatagtagcctgagcgttgatccggaagatgactgtactttctggtataccactgaa
tattacaaagctgaaaatgataatagttctgcttggtcaacttatattggtagctttaaa
tttgataactgtgttgccggaccaaagggctacattgaaggtacggtaacggataactca
ggtaatcctatcgcaggtgctaaagtttcggctggtgcggcgacagttgttactgatgaa
tcaggtaattacaccatgacgttgcctgctggtagcatttatgacctaggcttttcaaaa
tacggttatattgctggtagtgttaacaacatcgatcttgctgaagatgaagttgaggat
gttgatatcgtactggacaatgccgaagcgatcaccattagcggaacagtggccgatggc
tctggcttaggtacgcctctctacgctgaagtgatgattaaggcaccgggtgcaacaatc
actactttcacagatccagtaaccggtcagtactcaattgatgcttatgagggtactttg
gttaagattcaggcatcatcaattgaccctggttatcttgagcaaagttatgacatttta
cctgaaaatactccagtccagaactttgacttgcagattgattcaaattgtactgctcaa
ggttatatctggaatactttcttcgaaggttttgattcaggagtaccgccagcaggttgg
actgtagaggatatttctggttcaggtatgcagtggcaagcggcatcgacagcaccaaaa
ggcaacttgcttaatgttagcggcgaagctgcagcaattgacagtgacgcggccggaact
aacaatttagtgagctctgtattggtatcaccaactatttatgttgctgatattgagtca
actacattgaattttgccagtctgtttagaacattcggttattccgatgtttatacagtt
gacattagtgtcgatggtggtgaatggacagcagtccatacatttaatccaaccaatatg
gttgaaactatctcggttgatctttctgcgcaacttgctggagccacaagcttcaaaatc
cgttttgcatatgaagcagactatgagtattacgcctacattgataacgtaacttttggt
acaccaagctgtatcgctagctctggttcctatcaaagtggttatgttgtagatgctaat
acacagcttcctatcatcggtgcgcaagtaacgtcaggtaattcaacagcaacaacagtt
gctaccgttgataacgaacagttggaagatggtttcttcagaatctttataggttcagga
ggtacggctgaagctgaagttacggcgagtaactataaaactgtgactgttgatctaagt
ggttatggtctgtcacaaccaatcgcactggatgctggcttgcttgaactaggtgctgct
gattttgaagtggccgaaggtttggatcgcacagttacagcgcaacttgaaaaccttggc
aatgctgacgctaactatgagctttctctttacattactcgcgatgactctccagtggct
aagccatatggtattttccatcaggcaacgcgcagatttgggccaaaagcactacaggaa
atggatacgaaaaaaatccgttaccgctcaatggctccaagtgttccagaggttgaggtt
gaattcgtttctcaattcccaacagagctaactttgggttggggtattggctttgataaa
accacatctgaaatttgggttggtgatgttacggctggtggcgctcctttagatgcattg
cataaatacgttgatggaattaaaactggtcacttcattgataccagtgctgttaccgtt
ggttatgctgcagatttagcctacaacgctcgtactaatacgttctggcaggtagctgta
acaggcgatacttgtattcatgaaattgatacagttgctggtacagttacaggcaataaa
atctgtccaacttttggtacttcgcaacgtggtctggcatacgatccaatttcaggaact
ttctatgctggttcttggaacgatagcgtagttcatcagtttgatgctgaaggtaatatt
ctacgctcaatcaatgttgatctagctgtttcaggacttgcattgaacccagtaacaaac
catctatttgtaatgtcaaatgatgcggctggtagtatagagcccgatatcgtagtacta
gatgcatccacacctgaactagatccgattggcttaatctatgttccatcagttgataca
gatggcgatgatgtagcagaagacttgatggacggtggtcaggctggtcttgcgatagat
tgtgatggcaatttgtgggcggttaaccagtctagacaaactgtcgttggcattacctca
ggagaaactggagtgtgcgatattacgccaacttgggttgaacttaaggctgacagtggt
tccattggtgccaatcaagctggcgagctcgagcttgatgtttcaaccaagagtttatcg
gtaggtaactatagtgctcagctaatcatgactaatgatacgccatacggttccattgtt
aagccagtaaacttaacagtacgtgagcctcagtatggtcaattaggtgttagcggaaac
tctggtgcaattcgtaacggtggtgatattcaggttactgtttctcgtgttgacggatct
gattatcaggtgtctgttgactacacaactgttaatggtactgctaattcgggaacccac
tatactgcagcttctggtacgctaacgtgggctgatggtgatactgaagataaggttatt
acgattagtacaattgatactgatcaaagttcagacctgaactttagtgtcgagctatct
aacccggaaaaagctcagcttggtactagtcaagttaacttaacgatccaaaaagacccg
ccaaaacgtggcggtggtggtagtgcaggatttgctatccttgcgttattggcactggca
ggtctagcaagacgtagaaaatacctttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system