Kwoniella pini: 30173666
Help
Entry
30173666 CDS
T10980
Symbol
I206_107158
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K15147
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5
Organism
kpin Kwoniella pini
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kpin00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
kpin03021
]
30173666 (I206_107158)
Transcription machinery [BR:
kpin03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
Middle
30173666 (I206_107158)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Med5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
30173666
NCBI-ProteinID:
XP_019009737
UniProt:
A0A1B9HZ55
LinkDB
All DBs
Position
10:join(952999..953070,953130..953190,953246..954225,954302..954453,954522..954651,954725..955069,955153..955254,955331..955554,955617..956466)
Genome browser
AA seq
971 aa
AA seq
DB search
MAQETLSLSEVIGRAYARALPPKKFVQLLKSTVRSSPDAQDDLASAILPFLLPSPPSLIL
SYLTNLLSSSILTSRTIFIHILFYLSDHDLPPIPIINSIFNILASNLTGLEEPIPSFLSS
PSSSNLETDKIPPEVGTSASAMNSPIINRENQMSTLSLILPLLKTISSNPSLSLNSSLVI
YLSKVVSILSNFPLPSLDVGLEVGGLLPDLPEEINTHLRDHLSGLMTDLNNQGPTSQIQM
QNGNVQSQVSQGVQDIQMNNLSNDRSQRKAPLKESIIFLIEWLKRSSKFDKSPRAGKELG
HNWILLLKAGKYLTMDSSQFLSVLLEVGIQDLIRTDVEDLEAAQNWNILVGIMPALLSWW
KEHAEEEFPFPVNITEILTDLFRNHSMAMQSYSENLSQRYTVLIQNAENEEEGSTFTSLE
GWTLLSLQETLISKLVQSSLITSDEASTVAPGANSHTFSMGESLTNRLSSESHPHLPPLV
HTIQYAYSASASFSEEVIQIIKSCPSIPPPESVFTYIASQPGLLGCLTSTISAKALLSLM
EKQLLDIGVDENSRNDDPQGSLTRFGEGVALVEAFVAFYQLPLPPLLQDARCASSFSHLD
DESKECMNGWVKAIFGSDGIEDAILLATPPQKLYSLTSTLIQQAILAVAASQIDLDTLHS
GLSYFSQPLLSWCLGGVVSWLCKEIKRQGLLSALHLVVLQDLILGHSCPEALIRVNLKVL
NDLLNDNSLIEVFQSSNFDLNGIKLKLNHFNLNELLSIPSINSSIPLNESLKLLRKIDEN
NSSINWEKTFFNSIENELKLKSNKKIIKIIFKEIFNFNFNFNKINNDNLIKFIPLILNFK
FNKNQNILLLNTFINFSFNENFLKSLNYDYNNNNQEEKDLIEILKNSLIFNSIFNLNLNS
NENKKDFLILNFINELEYLFNKSLKGLNEISIKEIIENENYNSNKKLNLNRKQQLILNII
KSLKNDDFFNL
NT seq
2916 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgcaagagactttatcgcttagtgaagtcataggcagagcttatgctcgagcttta
cctccgaagaaattcgttcaactgcttaaatcgacggtaagatctagtccagacgctcaa
gatgatcttgcatctgcaatcttacctttccttctaccttccccgccctccttgatcctc
tcatacctcactaatttactttcttcctccatcttaacgtcaagaacaatcttcatccac
attctattctacttgtcggatcatgatctacctccaataccaataataaactccatattc
aatatcctcgcttcgaatctaacaggactcgaggaacccattccatccttcttatcgtct
ccttcttcatctaacctcgaaacagacaagataccacccgaagtgggtacttcagcatcg
gcgatgaattctccaatcatcaatagagaaaatcaaatgtcaactttatccttgatttta
cctttgttaaagacaatttcatctaatcctagtttatcacttaattcatctttagtcatt
tacctttcaaaagtagtttcaatattatcaaatttccctttaccatctttagatgtagga
ttagaagttggtggattattacctgatttacctgaagaaattaatactcatttaagagat
cacttaagtggtttaatgacagatttaaataatcaaggtccaacttcccaaatacaaatg
cagaatggaaatgttcaatcacaagtaagtcaaggtgtacaagatatacaaatgaacaat
ttatcaaatgatagaagtcaaaggaaagcgcctttgaaagaatcgataatattcctaata
gagtggttgaaaagatcaagtaaattcgataaaagtccaagagcaggaaaagaacttggg
cacaattggatattactcttgaaagcaggcaaatacttgactatggactcgagtcaattc
ttgagtgtcttgcttgaagttggaatacaagacttgatacgtacagatgtggaagatctg
gaagctgctcaaaattggaacattttggttggaatcatgcctgcattgttgagttggtgg
aaggaacatgcagaggaagagttcccctttcccgtcaatataacagagattttgacggac
ttattccgaaatcattcaatggcaatgcagtcatattctgaaaatcttagtcagaggtat
actgtcctgatacagaatgctgagaatgaggaggagggaagtacctttacctctctagaa
ggatggactctgctttcccttcaggaaactttgatatcgaagctcgtgcaatcgagtctt
ataacatcggatgaagcatcaacagttgctcccggtgcaaacagtcacacgttctcaatg
ggtgaatcattgaccaatcgcctttcatccgaatcgcatcctcatcttcctcctttggtt
cataccattcaatatgcctattcagcctctgcatctttctctgaggaggtgatccaaatc
ataaaatcatgtccttcgattccgcccccagaaagtgtattcacctacatagcttctcag
cccggtttattgggatgtttaacttccaccatcagtgcaaaggccttgctcagtctgatg
gaaaagcaacttctggatattggagtagacgaaaatagcagaaacgatgatccgcaaggg
agtctgactaggtttggagaaggtgttgcgcttgtagaagcttttgttgcgttttatcaa
ttgcccttgcctccgctattgcaggatgcaagatgcgccagtagcttctcccatctcgat
gacgagagtaaagaatgtatgaatggatgggtgaaagctattttcggatcagatggaata
gaagatgcgattctcttagcgactcctccacaaaaactttactcacttacttcaacattg
attcaacaagccatactagccgtcgcagcatcgcagattgatcttgatactttacatagc
ggtttatcatatttttctcaacctctgcttagctggtgccttggtggagtagttagttgg
ttatgtaaagaaatcaaaagacaaggtttattatcagcattacatttagttgtacttcaa
gatttaattttaggtcattcatgtcctgaagctttaattagagtaaatttaaaagtttta
aatgatttattaaatgataattctttaatagaagtatttcaatcatcaaattttgattta
aatggtataaaattaaaattaaatcattttaatttaaatgaattattatcaataccttca
ataaattcctcaattcctttaaatgaatctttaaaattattaagaaaaattgatgaaaat
aattcttcaattaattgggaaaaaactttttttaattcaattgaaaatgaattaaaatta
aaatcaaataaaaaaattattaaaattatatttaaagaaatttttaattttaattttaat
tttaataaaataaataatgataatttaataaaatttattcctttaatattaaattttaaa
tttaataaaaatcaaaatattttattattaaatacatttattaatttttcatttaatgaa
aattttttaaaatcattaaattatgattataataataataatcaagaagaaaaagattta
attgaaattttaaaaaattctttaatttttaattcaatttttaatttaaatttaaattca
aatgaaaataaaaaagattttttaattttaaattttattaatgaattagaatatttattt
aataaatctttaaaaggattaaatgaaatatcaataaaagaaataatagaaaatgaaaat
tataattccaataaaaaattaaatttaaatagaaaacaacaattaatattaaatataatt
aaatctttaaaaaatgatgatttttttaacctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
