Candidatus Kinetoplastidibacterium kentomonadis: CKSOR_00194
Help
Entry
CKSOR_00194 CDS
T05428
Symbol
rng
Name
(GenBank) Ribonuclease G
KO
K08301
ribonuclease G [EC:3.1.26.-]
Organism
kso
Candidatus Kinetoplastidibacterium kentomonadis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kso00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
kso03019
]
CKSOR_00194 (rng)
03009 Ribosome biogenesis [BR:
kso03009
]
CKSOR_00194 (rng)
Messenger RNA biogenesis [BR:
kso03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
CKSOR_00194 (rng)
Ribosome biogenesis [BR:
kso03009
]
Prokaryotic type
rRNA processing factors
CKSOR_00194 (rng)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_E_G
S1
RNase_E_G_Thio
RNA_pol_Rpb1_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWD32321
UniProt:
A0A3S7J9H9
LinkDB
All DBs
Position
complement(201623..203104)
Genome browser
AA seq
493 aa
AA seq
DB search
MKNNQTILINSNFLETRIAILENNILKEIYIEDIAKKSLVGNIYLGKVIRILPGLQCAFI
DIGLEKKAFLHVDHLLENKYKLLNDKKLIENIIYNGQILKVQVLKDELNNKGVLVSTQIK
INGKYIIFLPYMNNNKIFLKFSKKIKSKKIKNDLYNKFNKIIKNYLNNYLINGCFLFRSI
AENITSEELYRDLKIIFHFFKNLNIYDEHKKPCLIFNQSNTLKDILIDIIEPNIQDIFID
NKKITYEFKNWAYEFMPHIYYKIQYYEKNDLFKIYNIDETMNISLSRKINLKSGGYIIID
QTEALIIIDVNTGSFIGNKDPEDTYLKVNLEAIKEIARLLRLRNLSGIILIDLIDMKKRD
NKNVVLKELKDNIINDKAKVNILGFTALGLLEISRERKKNSYLSNLFEPCNICNKTGLIK
TVETIFHEICRKIINSSYDINIKKLKILASKPIIDIFIEKNYISFISNHINKKIILEINS
IYNKEQYNIINIF
NT seq
1482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataatcaaactattttaataaattctaattttttagaaaccagaattgctata
ttagaaaataatatattaaaagaaatatacatagaagatatagctaaaaaaagtttagtt
ggaaatatatatttgggtaaagttataagaattttacctggattacaatgtgcttttata
gatataggattagaaaaaaaagcttttttacatgtagatcatttacttgaaaataaatat
aaattattaaatgacaaaaaattaatagaaaatattatttataatgggcaaattttaaaa
gtacaagttttaaaagatgaattaaacaataagggtgttttggtatctactcaaattaaa
attaatggcaaatatataatatttttaccatatatgaataataataaaatttttttaaaa
ttttctaaaaaaataaaatctaaaaaaatcaaaaatgatttatataataaattcaataaa
attattaaaaattatttaaataattatttaattaatggttgttttttatttagatctatt
gcagaaaatatcacatcagaagaattatatagagatttaaaaattatttttcattttttt
aaaaatttaaatatatatgatgaacataaaaaaccttgtttaattttcaatcaatcaaat
acattaaaagatattttaatagatattatagaacctaatatacaagatatatttatagat
aataaaaaaattacatatgaattcaaaaattgggcatatgaatttatgcctcatatatat
tacaaaattcaatactatgaaaaaaatgatttgtttaaaatttataatatagatgaaaca
atgaatatttcattatctcgtaaaataaatttaaaatctggaggatatatcattatagat
caaacagaagcattgatcattatagatgttaatacaggtagttttattggaaataaagat
cctgaagacacttatttgaaagttaatttagaagcaattaaagagattgctagactatta
aggttaagaaatttaagcggaataatcttaatagatttaatagatatgaaaaaaagagat
aacaaaaatgtagtattaaaagaattaaaagataatattatcaatgataaagctaaagta
aatatattaggatttactgctttaggattacttgaaattagtagagaacgcaaaaaaaat
tcatatttaagtaatttgtttgaaccatgtaatatatgtaacaaaaccggtttgataaag
acagttgaaacaatatttcatgaaatatgtagaaaaattattaattcttcatatgacatt
aatataaaaaaattaaaaattctagcatctaaacctattatagatatatttattgaaaaa
aattatatttcatttattagtaatcatattaataaaaaaattatattagaaattaattca
atatacaataaagaacaatataacattattaatattttttga
DBGET
integrated database retrieval system
