Lactobacillus acidophilus NCFM: LBA0689
Help
Entry
LBA0689 CDS
T00231
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease subunit A
KO
K03701
excinuclease ABC subunit A
Organism
lac
Lactobacillus acidophilus NCFM
Pathway
lac03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lac00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
LBA0689 (uvrA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lac03400
]
LBA0689 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
lac03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
LBA0689 (uvrA)
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
LBA0689 (uvrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrA_inter
UvrA_DNA-bind
ABC_tran
SMC_N
AAA_16
RsgA_GTPase
nSTAND3
nSTAND1
AAA_29
AAA_23
AAA_22
AAA_33
DnaJ_CXXCXGXG
AAA_14
AAA_15
AAA_21
AAA_25
Viral_helicase1
NACHT
AAA_24
RNA_helicase
SLFN-g3_helicase
cobW
BCA_ABC_TP_C
Mtrc-MtrF_II-IV_dom
DUF1924
MMR_HSR1
T2SSE
Septin
DUF87
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAV42564
UniProt:
Q5FL60
LinkDB
All DBs
Position
680917..683757
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
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NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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actaagagggctcaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
