Lactobacillus acidophilus NCFM: LBA1002
Help
Entry
LBA1002 CDS
T00231
Name
(GenBank) excinuclease subunit A
KO
K03701
excinuclease ABC subunit A
Organism
lac
Lactobacillus acidophilus NCFM
Pathway
lac03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lac00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
LBA1002
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lac03400
]
LBA1002
DNA repair and recombination proteins [BR:
lac03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
LBA1002
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
LBA1002
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
UvrA_DNA-bind
SMC_N
AAA_21
AAA_15
nSTAND1
DnaJ_CXXCXGXG
AAA_29
RsgA_GTPase
DUF463
cobW
nSTAND3
DUF4350
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAV42852
UniProt:
Q5FKC2
LinkDB
All DBs
Position
978443..980977
Genome browser
AA seq
844 aa
AA seq
DB search
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DLLA
NT seq
2535 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gatttattagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
