Ligilactobacillus acidipiscis: LAC1533_1991
Help
Entry
LAC1533_1991 CDS
T05349
Name
(GenBank) Choline binding protein A
Organism
laca
Ligilactobacillus acidipiscis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_70
Choline_bind_3
KxYKxGKxW_sig
Choline_bind_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SFV41414
UniProt:
A0A1K1KV98
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2167621..2172102)
Genome browser
AA seq
1493 aa
AA seq
DB search
MERKQRYKMYKSGKNWVIAPLVFFGIALGFQAGVHNVFADETIQKPQVVNLNSPVGDQKE
NSTSTDSQEDTASDKDPIQTNGEEKVANQSQSEKTVTTDAGSNQKKASFEENDGQADDQQ
QLKGKDQLNDETINNNDQNNRTQSDNVNDKQQNNDQNNRTQSDNVNDKQQNNDQAAVDSQ
KDSNEALRNDLNKQQPSTRNLVLKNDQPKQVKENGFWYLRDKNGHNLIGFQNIQDQNKRV
YYNNRGQMQYGEQKISNNWYLFDNVTGAMQTGFKYLSKGNKTVYYNEQGKMQKGQAKVAD
NWYLFDNITGARQTGFKRIAQQNKTVYYNNVGQMQYGQQKIQNSWYLFDNVTGAMQTGFQ
RIPEQAKTVYYDQQGKMSHGQWKINGAWYLFDQNTGAVKVGLQKIADQNKTVYYDKKTAQ
MLKGQQHVDNRWYLFDKVTGAMQTGLRAIPEQKKLVYYDPKNGQMQYGTILMDGQNGTKS
IFYFDKTTGALTAIGDQTWYDEAQNDMPFSFDESSMSTVNGYLSWTGWYRPKGYHQNGQK
WVQTGASDWRPYMLYIWPSNDIQAKYIQYFVGHGYTDQSLGLTAKNVNKLNGSTNSQLLN
DYSRKLRDAIEKEIFENNYSTSKLASTMDGFVAFVPEFNGLSELPVEKQPGYKPDNSGTV
DNDQLLFVNSGNGNQKQGNTTNADSQFRNLNHTIWNQYGTEKDGNKFGPELLVGNDIDNS
NPVVQAENINWEYFLLKYGEIMGYGSDANFDGFRNDAADNIDADVLDQQAQLLNDMFDLK
GSEANANGHLVYNEGHHSGAANMLGNKNNQQLYMDSQEFYTLLNTLGKAHGKRNKLTDLI
TNSVVDRHNDNTDSSAQPNWSFVTNHDQRKNVINQIIIDSHPGVTDIMGDSYKAEYAVQA
WEKYYNDELQTNKQYAIYNVLAQYAILLSNKDTVPQIYYGDMFDETKPYMESKSIYYDGI
VAMLKARQKYVAGGQSYQSYGDDLIASVRYGKGNASAQAKGSDPLGRTTGMAVIVSNNPT
MQQRTITVAMGKAHANQQYMNLINTTASSSNVGGVSYNSDSILTTDSDGNLVLTIKGYAN
PLVNGYLGVWVPVGAAEDQVATTADSTAKKSSGKIYESNAALDSHVIYEDFSLYQPEFAD
INKSAYVVLADHAQDFADMGVTDFWMAPPYTSFSMSRYNEGYSINDRYTLGTDEAPTKYG
TGAQLADALKAIHAAGMKAQVDMVMNQMIGFPTQEAVTVSRTDNYGNTLSVDGKTFANEV
YLPYTIGGGQGQSTYGGKFLDELKQKYPDLFTTKAGSTGVAPDSSTHITQWSAKYENGTS
TQNIGIGRVMKEKDGNYDYVESGNNHLLHTQLPSEFTSEEKWLSNNSQSTGWIHVKGQTY
YYDKGTVVLGEQKINGHWYMFDSQTGVMDTGFTNISKAKKTVYYDIDGKMLYGEQKINGH
WYYFDQITGSRATGFKKLSGKTVYYNANGQMLYGRQVINGHVYNFDRVTGALK
NT seq
4482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaagaaaacagcgttataagatgtataagtctggtaaaaattgggttattgcaccc
ttagtatttttcggaatcgctttaggttttcaagctggagtacataatgtttttgccgat
gaaacgattcaaaagccgcaagttgtcaatttgaattctccggtcggagaccaaaaagaa
aattctacttctactgatagtcaggaagatactgcttcggataaagatcctattcaaact
aatggtgaagagaaggtagcaaatcagtctcaatctgagaaaacagtgactactgatgca
ggcagtaatcagaaaaaggcctcttttgaagaaaatgatggacaagctgatgatcaacaa
cagctaaaaggtaaagatcaattaaatgatgaaactatcaataacaatgatcaaaataat
agaactcagagcgacaatgttaatgataaacagcaaaacaatgatcaaaataatagaact
cagagcgacaatgttaatgataaacagcaaaacaatgatcaagcagcagttgattcacaa
aaagattctaacgaagctttacgtaatgatttaaataagcaacaaccatctactagaaat
ttagttttgaaaaatgatcaaccaaagcaagttaaagaaaacggattctggtatctgcgc
gataaaaatggacataacttaattggttttcaaaatattcaggatcaaaacaagcgtgtc
tactataataatcggggacaaatgcagtacggcgaacaaaaaatcagtaataattggtat
ctgtttgataatgtgactggtgcgatgcaaacgggctttaagtatctttcaaagggcaat
aaaactgtttattataatgaacaaggaaagatgcaaaaggggcaggctaaggttgctgat
aactggtatttgtttgataacattactggggctagacaaacaggttttaaacgtattgct
caacaaaataaaactgtttactacaacaatgttggtcaaatgcagtatggacaacaaaaa
atacaaaatagttggtatctgtttgataatgtgactggtgcgatgcagacaggctttcaa
aggatacctgagcaagctaagacagtctattatgatcaacaaggcaaaatgagtcatggt
cagtggaaaatcaatggtgcgtggtatttatttgatcagaatacaggggctgtcaaagtc
ggcttacaaaagatagcagatcaaaataaaactgtctactatgataagaaaactgctcaa
atgttaaaaggacagcaacatgtcgacaatcgttggtacttgtttgataaagttactggt
gcgatgcagacaggtttaagagctattcccgaacaaaaaaagctggtttattatgatcct
aagaatggtcagatgcaatatggaacaattttaatggatggtcagaatggaactaaatca
atcttctattttgacaagactactggtgctttaactgcaatcggggaccagacatggtat
gatgaagcacaaaatgacatgcctttttcatttgatgaaagttcaatgagtaccgttaat
gggtacctgagttggacaggctggtatcgtccgaaaggttatcaccaaaatggtcaaaag
tgggtacaaaccggcgcttctgattggcgtccatatatgctttacatctggccttctaat
gatattcaggcaaaatatattcaatattttgttggtcatggatatacagaccagtcactt
ggtttaacggctaaaaatgttaataaactcaatggttcaaccaatagccagcttttaaat
gattattctcgcaagttaagggatgctattgaaaaagaaatatttgaaaataactacagc
acatctaagttagcaagtactatggatggctttgtggcttttgttccagaatttaatggc
ctgtcagagttacctgttgaaaaacaacctggctacaagcctgataatagcggcacagta
gataatgatcagcttttgtttgttaatagtggtaatggtaatcaaaaacaaggtaacacg
acgaatgcagacagccaatttcgtaatctaaatcatactatttggaatcaatatggaact
gaaaaagatggcaataaatttggacctgaattacttgttggtaatgatattgataattct
aatccggttgtacaggctgaaaacattaattgggaatatttcttgcttaaatatggcgaa
ataatgggctatggatcagacgccaattttgatggctttagaaatgatgctgctgataat
attgatgcagatgttttggatcaacaagcacagttattaaatgacatgtttgatttgaaa
ggttcagaagcaaatgcaaatggacatttagtgtacaatgaaggccatcattctggcgcc
gctaacatgttaggaaataagaataaccagcagttgtatatggatagtcaagagttctat
acattgttgaatactcttggtaaagctcatgggaaacgcaataagctaacagatttgatc
accaatagtgttgttgatcgtcacaatgataacactgattcttctgctcaacctaactgg
tcttttgtaaccaatcatgatcaaaggaaaaatgtgatcaatcaaattatcatcgattca
catcctggcgtaacagatattatgggtgatagttataaagcggaatatgcagtccaagca
tgggaaaagtattataatgatgaactgcagactaataagcaatacgctatttataatgtt
ttagcccaatatgctattttattaagtaataaagacacagtacctcaaatatattatggc
gatatgtttgatgaaactaagccctatatggaatctaagtctatatattatgatggcata
gtagcaatgcttaaagcacgccagaagtatgtcgctggtggtcaatcctatcaatcatat
ggcgatgatttaattgcgagtgttcgttatggaaagggaaatgctagtgctcaagccaag
ggctcagatccattggggagaactacaggtatggcagttattgtctctaataacccaaca
atgcagcaaagaacgattacagttgcaatggggaaggcacatgcaaatcaacaatatatg
aatctgatcaatactacggcttcaagttccaatgttggcggtgtatcctataattccgac
tcaattttaactacggattctgatggtaatttagttttaactataaagggctatgcaaat
ccactggtaaatggctacttgggtgtgtgggtaccagttggtgctgctgaagatcaggtg
gcaacgactgcggattcaactgctaaaaagtcctctggaaaaatatatgaatcaaatgct
gctttggattcacatgtcatttatgaagactttagtctttatcaaccagaattcgctgac
atcaataaatcagcctatgttgttctagcagatcacgcacaagatttcgccgatatgggt
gttactgatttctggatggctccaccatatacatctttttctatgagcagatataatgaa
ggttattcgatcaatgatcgttatacattaggaacagatgaagcaccaacaaaatatgga
actggcgcccaacttgctgatgcattaaaagctattcatgctgcaggaatgaaagctcaa
gttgatatggttatgaatcaaatgatcggttttccaacccaagaagcggttactgttagt
cggactgataattatggtaataccctttcagtagacggaaagacttttgctaatgaagta
tatcttccttatacaattggtggtggtcaagggcagtctacctatggtggtaagttcttg
gatgaactaaagcaaaagtatccagatttgtttacgactaaggcaggttctaccggggtt
gcacctgattcaagtacgcatattacccaatggtccgcgaaatatgaaaatggtacttca
actcaaaatattgggatcggaagggttatgaaagaaaaagatggtaattatgattatgtt
gaaagtggtaataaccatttattgcatacacaattgccaagtgaatttacttctgaagaa
aaatggttgagtaataattctcagagtactggttggatccatgttaaaggtcaaacctat
tattacgataaaggtactgtggtcttaggtgaacaaaaaatcaatggtcattggtatatg
tttgattcacaaacgggtgtgatggataccggttttaccaatatttcaaaagcgaagaaa
actgtttattatgacattgacggaaaaatgctgtatggagaacaaaaaatcaatggtcac
tggtattattttgaccaaataacgggtagtcgtgcaacaggttttaagaagttatctggt
aagacggtatactataatgcaaatgggcaaatgttatacggtagacaagttattaatggt
catgtttataattttgatcgtgtaactggtgctttgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
