Lactobacillus sp. IBH004: LDX54_06200
Help
Entry
LDX54_06200 CDS
T10732
Name
(GenBank) PRD domain-containing protein
Organism
lach Lactobacillus sp. IBH004
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
HTH_11
Mga
PTS_IIB
HTH_Mga
HTH_AsnC-type
HTH_24
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZN41359
LinkDB
All DBs
Position
complement(1036895..1038379)
Genome browser
AA seq
494 aa
AA seq
DB search
MVKDLNQSIINYLKVNHGFNSSAKISQELHVSRKTIIRRIDQLNKNFPEKIIVSKRSQGF
ELVYQNYLKYDHRNSTTFSQINERQENILTRLLIASPKAVSITDIINSMYVSEAVIQNDE
KIIAAKIRKWNLSLVRKQRFLSIKGTEKNIRNAIIEVVLHVNNTTEISSLRNSIGKYDDQ
DFDFALEQLKLAVKSLNNNLPYPYNINFFTHIYILLNRARTYKSVNYSVESKSSIKRKSR
ENPEIFKICHKIIQHIENYLNVRPLTLEVETYYLFEYLISSRLGDKKSEITSDDHRLAEQ
VSEKYITSVSHFLKTNFSRYILNDIKNHIFSMIIRLKMQVSLPNALLNDIKLEYKPVFEA
TKLASEQVSHQFHLPTISDNETGFICLYFVKYLEAQPERNKKVRVYIICTTGIGTSEIIS
TKIRKLMPELKVIGLGSSFEIEDILKKYKNIDLIISTVPITIKTNIPVELVSAFLTKEDE
KNVRQAVLRIQKQQ
NT seq
1485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaaagatttgaatcagtccataatcaactatttaaaagtaaatcatggtttcaat
tcttcggctaaaatttcacaagagttacacgtctcacgtaaaacaataattaggaggatc
gatcagctaaataaaaatttcccagaaaaaataattgtatcaaaacgaagtcaaggattt
gagttagtctatcaaaattatttaaagtatgatcacaggaattcaactacattttcacaa
attaatgaacgtcaagaaaatattttaaccagacttttgattgcgtctcctaaagcggtt
tcaataacggatattattaatagtatgtatgttagtgaagcggtaattcaaaatgatgaa
aaaataattgctgcgaagattagaaaatggaatttgtcattagtccgcaaacaacgcttt
ttaagcatcaagggtaccgaaaaaaatattagaaatgccattatagaagtcgttttacat
gttaacaacacaacagaaattagtagtttacgtaatagcattggaaaatatgacgatcaa
gattttgactttgcattagagcaattgaaacttgcggtgaagtctttaaacaataatctt
ccatatccctataatattaatttttttacgcatatttatattcttttaaacagagccaga
acctataagtcagtaaattattcagttgaatcaaaatcaagcataaaaagaaaatcgcgg
gaaaatccggaaatttttaagatatgtcataaaattattcaacatatcgaaaactattta
aatgtacggcctctgacattagaggtagaaacatactatctattcgagtacctgatttca
tctcgattaggtgataaaaaaagtgaaataacttccgatgatcatagattagcggagcaa
gtttctgaaaaatacattacttcagtttcacattttttaaaaaccaattttagcagatac
atattgaatgatattaaaaatcatattttttcaatgattattcgcttgaaaatgcaagtt
tcattaccaaatgctttattaaatgatattaaattggaatacaagccagtctttgaggct
actaaattagcttctgaacaagtaagtcatcaatttcatttaccaacgatttctgataat
gaaacaggctttatatgtctttactttgttaagtatttggaagctcaaccagaaagaaat
aagaaggtacgtgtttacattatttgtactacaggcattggcacatcagaaataatctcg
accaaaataagaaaattaatgccagagttaaaagttatcggattaggttccagctttgag
atagaagacatattaaaaaagtataaaaatattgatctaataataagtacagtaccaata
acgatcaagaccaatatacctgttgaattggtcagtgcttttctaacaaaagaagatgaa
aaaaatgtcagacaagcagttctcagaatacaaaagcaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
