Lacinutrix sp. Bg11-31: CW733_03875
Help
Entry
CW733_03875 CDS
T05225
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
laci
Lacinutrix sp. Bg11-31
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
laci00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
laci02000
]
CW733_03875
Transporters [BR:
laci02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CW733_03875
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUC81316
LinkDB
All DBs
Position
complement(833917..836124)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MKYLILVVAFMATNCVLAQQTITGKVTDNFTQEPLEDVTVYFAQLEKGTITNSEGLFNLS
GLPEGNQTIIFSILGFETVSKTINLPLKGTLNIALNSSAIEMEELIISTPFHRLQSDNVM
KVERESMSALKQNGAVTLADGITSIAGVESISTGLSIGKPVIRGLSSNRVLVYAQGVRLE
NQQFGGEHGLGINGSGIESVEIIKGPASLLYGSDAIGGVLYINPERFAVQNTSSADFNTN
YYSNTKGYSTNVGYKSSSDNFKFLFRGSLAEHSDYKTEDYRVTNTRFREQDFKAGLGYQK
EGFKTDFRYNVNHSKLGLPEEIGEQSTAKTPLLPYQDLTNHIFSSKSKVFFNNSSLDVNL
GYTYNDRKEFEEHHDEEEHDEAHEDEVLAAALHMKLKTANYNIKYNLPTLGKFETIVGVQ
GMHQINSNYGEEQLIPDATTNDFGILATSHIHFNKVDVQLGARYDNRNINVIDGLNKEFN
SINAAIGAKTNLTEKVVARLNIASGFRAPNLAELTSFGSHEGTNRFEIGNTNLKNEQNFQ
ADLALEYKNEHVEVFANGFYNSINNYIYLTPNGTFINEDPVFNYLQQNANLYGGEFGLHF
HPHPLDWLHFESSFETVTGKQDNGDYLPLIPANSLTNTIRVEFDKKWINKSYAFVKLKNT
FQQNNVSNFETPTGSYTLLSAGFGGDFTVFNNRLSLSVSGNNLTNKTYINHLSRLKGDGV
FNIGRNINVGLSYKI
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatttaattttagttgtcgcattcatggcaactaactgcgtattagcgcaacaa
acaataacaggtaaagttacagacaatttcactcaagaacctttagaggatgtaactgta
tattttgcacaacttgaaaaaggcacaattacaaatagtgaaggattatttaatctttct
ggattaccagaaggtaatcaaaccattattttttctattcttggttttgaaaccgtttca
aaaaccataaatcttccattaaaaggtactttaaatatagcacttaactcttccgcaata
gaaatggaagagctcattatttctactccttttcatagattacaaagtgacaacgttatg
aaagtagaacgcgaaagcatgtctgctttaaaacaaaacggagctgtaacattagcagat
ggtattacaagtattgcaggagtagaaagtatttctacaggattaagcattggtaaacct
gtaattcgtggcttaagttctaaccgtgttttagtttatgcacaaggcgttagattagaa
aatcaacaatttggaggcgaacatggattaggaataaatggctcaggaattgagagtgta
gaaattataaaaggacctgcttctctactctatggtagcgatgcgattggtggtgtatta
tacattaacccagaacgttttgctgtgcaaaatacttcttcagccgattttaataccaat
tattatagtaatactaaaggctatagcacaaatgtaggttacaaatcgtcatcagataat
tttaaatttctgtttagaggaagtctggctgaacattccgattataaaactgaagattat
cgtgttacaaacacgcgatttagagaacaagattttaaggctggtttaggctaccaaaaa
gaaggatttaaaaccgatttccgttacaacgtcaatcattcaaaattaggattacctgaa
gaaattggagaacaatctactgcaaaaacgccattgttaccttatcaagatttaacaaat
catatttttagctctaaatctaaagtgttttttaataattctagtctagatgtaaactta
ggctacacttataatgataggaaggagtttgaagaacaccatgacgaagaggaacatgac
gaagcacatgaagatgaagtgctagctgctgctttacatatgaaactaaaaacagcgaat
tataatattaaatataatttaccaacacttggtaaatttgaaactatagttggtgttcaa
ggcatgcaccaaatcaattctaattatggtgaagagcaattaattcctgatgcaacaact
aacgattttggcattttagcaacatcacatattcattttaataaagtagatgtgcaatta
ggagcgcgttacgataaccgaaatataaatgtgattgacggtctaaacaaagaatttaat
agtataaatgctgctataggagcaaaaacaaatctcacagaaaaagtagtagcaagatta
aatattgcttctggttttagagctccaaatttagcagaactcactagttttggatctcac
gaaggtacaaaccgatttgaaataggaaatactaacttaaaaaatgagcagaacttccaa
gcagatttagctttagaatataaaaatgaacatgttgaagtttttgctaacggattttat
aatagtataaataactacatttatcttactccaaacgggacttttataaacgaagatcct
gtttttaattacttacagcaaaatgcaaatttatatggaggagagtttggtttacatttt
catcctcatcctttagattggttacacttcgagagtagtttcgagactgtaactggaaaa
caagacaatggcgattatttaccattaattcctgctaatagtttaacaaacactattcgt
gtagaatttgataaaaaatggattaataaaagctatgcttttgtaaaactaaaaaacact
ttccagcaaaataatgtaagtaattttgaaactccaacaggtagttacactttgttaagc
gcaggatttggtggtgattttacggtgtttaacaatcggttatcattatctgtttctggt
aataatttaactaataaaacatacattaatcatttatcgcgtttaaaaggtgacggtgtt
tttaatataggacgcaacattaacgttggattgagctataaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system