Lacinutrix sp. Bg11-31: CW733_08920
Help
Entry
CW733_08920 CDS
T05225
Name
(GenBank) antibiotic ABC transporter ATP-binding protein
KO
K18890
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
laci
Lacinutrix sp. Bg11-31
Pathway
laci02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
laci00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
CW733_08920
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
laci02000
]
CW733_08920
Transporters [BR:
laci02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
CW733_08920
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
AAA_30
MMR_HSR1
Zeta_toxin
AAA_29
AAA_22
AAA_21
DUF87
DEAD
AAA_15
AAA_23
DUF5906
FtsK_SpoIIIE
AAA_16
Ebola-like_HR1-HR2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUC82242
UniProt:
A0A2K8XH35
LinkDB
All DBs
Position
1981755..1983521
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MSNKKENIFDITLFKRLFEYTKPYKTVFYGVLLSVLIIAGLSIATPKLLQIVIDDHIKTM
QEEGFLYYIILMISLLLLQTIFQFFFQFYAAWLGQNIVQDVRILLFNHMLKFKMKYYDNS
SVGMLITRAVTDMERIADIFGQGLFMIMRDLTVMLVISIYMLSTNIKLSLIVFVTMPIVL
YATKIFQRYMKTAFEQVRTEVSNLNSFVQERVTGMKILQLFTRETTENRNFKAINERHKK
GWLKTIWYNSIFFPIADFLASITTGLVAYFGALMVLVEGTATVGQLFSFMMMIPLLFRPL
RQIADKFNTLQMGMVAAKRVFKIIDTTSQIDDTGTIEVSKFKGDITFKDVHFSYVENEEV
LKGISLDVKSGETVAIVGSTGAGKSTIINLLNRFYEINSGEILVDNIDIKTVTLSSLRSK
IAVVLQDVFLFADTIMVNISLNNPNISEAQVIQAAKDIGIHDFISSLPNGYNYNVKERGA
MLSSGQRQLISFLRAYVTNPSILILDEATSSVDSYSEQLIQNATDKITKGRTSIVIAHRL
ATIQKADKIIVMDAGEIVEQGTHEELLKKENGYYRNLYEVQFLKADVA
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtaataaaaaagagaacatattcgacattaccttattcaagcgtttgtttgaatat
acaaaaccgtataaaactgttttttacggtgtacttctatctgttttaattattgcaggt
ttaagtattgctacacctaaattactacaaatagtaattgacgatcacataaaaacaatg
caagaagaaggcttcttgtattacattattttaatgatttctttacttctattacaaaca
atttttcaatttttctttcagttttatgctgcttggcttggacagaatattgtgcaggat
gttaggattttactgtttaatcatatgctaaaattcaaaatgaagtattatgataattct
tcggttggaatgctaataacacgagctgtaacagacatggagcgcattgcagatattttt
ggacaaggcttgtttatgattatgcgagatttaactgtcatgttagttatatctatttac
atgctctctaccaatataaaacttagcttaatagtgtttgtaaccatgccaattgttttg
tatgcaactaagatttttcaacgttatatgaaaacggctttcgagcaagtgagaacagaa
gtttcaaaccttaactcttttgtacaagagcgcgttacaggaatgaaaattcttcaatta
tttacaagagagacaacagaaaacagaaattttaaagctattaacgagcgacataaaaaa
ggttggttaaaaacaatttggtataattcaattttctttccaattgctgatttcctagcg
agtatcaccacaggattagtagcatactttggagcattaatggttcttgttgaaggtacc
gcaactgtaggtcaactattctcgtttatgatgatgattccgctattatttagaccgcta
agacaaattgcagataaatttaacacgctacaaatgggaatggtagctgccaaacgtgta
tttaaaattattgacaccacatctcaaattgatgatacaggaacaatagaagtttcaaaa
tttaaaggtgacattacttttaaagatgttcactttagttatgttgaaaatgaggaagta
ctaaaaggcatttctcttgatgtaaaatcaggagaaactgttgctattgtaggctctact
ggagctggaaaatctactattataaatttattaaacaggttttacgaaataaatagtggt
gaaattttagtggataatatcgatattaaaacggtaactttatcttcattaagaagtaaa
attgcagtagtgttacaagatgtctttttgtttgccgatactattatggtaaatatttct
ttaaataatcctaatatttctgaagcacaagtaatacaagctgctaaagatattggtatt
cacgattttatttctagtttaccaaatggttacaattacaatgtaaaagaacgtggtgct
atgttaagttctggacaacgacaattaatctcttttttgagagcttatgttactaatcct
agtattttaattttagatgaagcaacctcttcggtagattcgtattctgagcaattaata
caaaatgctacagataaaattactaaaggcagaacttctattgttattgctcacagatta
gcgaccatacagaaagctgataaaattatagtaatggatgctggtgaaattgtagagcaa
ggtactcacgaagaactacttaaaaaagaaaatgggtattatagaaatctttatgaagta
cagtttttaaaagctgatgtggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system