Lactococcus sp. NH2-7C: QJV49_03080
Help
Entry
QJV49_03080 CDS
T10489
Name
(GenBank) PTS sugar transporter subunit IIA
Organism
lacn Lactococcus sp. NH2-7C
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
HTH_11
PTS_IIB
HTH_Mga
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGV30991
UniProt:
A0AA49EXD6
LinkDB
All DBs
Position
complement(644565..646505)
Genome browser
AA seq
646 aa
AA seq
DB search
MINYDLDILFFSKHKLWKLERILEVTNLDKEKFYRILEEFNKKLENQGLKKLEYKNECLA
ISNKIENFEETRYSINQKTFILSEVERRSLIYLLIFTNESSFSIALFQKYLQVSKNTVLS
DLKKLREELMSKNVQIEYSRKKGFSLNFEEKILQEKAWYYLQNLSEDAGFYILSKVLNDK
DPLTIFKNNQLLKKIMQELQIEVVYSRYLSTLLFASLLKCRGFEKGSENINELLKSLIIG
MSDGKNTIEQDNGLYRMAFNIMENVMKLAAIEFDDFTKTFMALLAHLTPAYYRLKNHFEL
KNVLLERIKKEYHSLFLLMDNVLQPLKEEVGKISESEKAYFVILFGGEIYKNKYSGKSLK
AIVLCVNGISSSLIMQKRLESLFPTMEFILSARVSHFEKLPINSYDIIFSTVPVKSDKKV
YLMSAFPEQREENKLYNQVLQDFQLPGFIKPSAQTILDSIEPYIIIKKPASKLDLIKIIE
KKLNRTRKEGKLSGVMLTDLLTKEKINFTNRELTWQEAIELAAQPLLDKHEIEERYIKAI
IDKVEAFGPYIDLGLGIALPHARPEEGVKKLGMSFLRCEHPVKLMNDDKHEIKLFIVLAA
IDNETHLRALSTLTKILSNKERLGQLLVATNAAEVEQILLKEEGEK
NT seq
1941 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaattatgatttagacattctctttttttcaaaacataaattatggaaattagag
cgaatattggaggtcactaatctagataaagaaaaattttatcgaatattggaggaattt
aataaaaaattagaaaatcaaggtttaaaaaaattggaatataaaaatgaatgcttagca
atttctaataaaatagaaaattttgaagaaactcgttattctatcaatcaaaagacattt
attttatcagaagttgaaaggcgctcccttatttatttacttatttttacaaatgaatct
tccttctcaatagctctttttcaaaaatatcttcaagtaagtaaaaatacggttttaagt
gatttaaaaaaacttagagaggagcttatgagcaaaaatgttcagattgaatattcaaga
aaaaaaggattttccctcaattttgaggagaaaattttacaggagaaggcttggtattat
ttacaaaatttatctgaggacgcaggattttatatcttatcaaaagttttaaatgataaa
gatccattaactatttttaagaataatcaattattgaaaaagataatgcaagaactacag
attgaggttgtttatagtcgatatctttcgacattactgtttgcaagtctgctcaagtgt
agaggttttgaaaaggggagtgaaaatattaatgagctactcaaatcattaattattggg
atgtccgatgggaaaaatacaattgagcaagacaatggtttatatcgaatggcctttaac
attatggaaaatgttatgaaactagcagcaattgaattcgatgatttcacaaagaccttt
atggcgctattagctcacctaactcctgcatactatcgattaaaaaatcattttgaatta
aaaaatgtcctgcttgaacggataaaaaaagagtaccactccttgtttttactgatggat
aacgtccttcaaccattaaaagaagaggtcggtaaaatttcagaatctgaaaaagcttat
tttgtcattttatttggtggagagatctataaaaataagtactcaggtaaatcattaaaa
gcaattgtactctgtgtaaatggaatcagttcgagtttaataatgcaaaaaagactagag
agtttattcccgacaatggaatttattttgagtgctcgagtctctcattttgaaaaacta
cctataaattcatatgatattattttttcaacggttcctgtaaagtcagacaaaaaagtt
tatcttatgtcagcttttccagagcagcgtgaagaaaataagctctataatcaagtttta
caagattttcagctcccaggttttataaaaccatctgctcaaactattttagattcaata
gaaccttacattattataaaaaaaccagcaagtaaactggatttaataaaaattattgaa
aaaaaattaaatcgtactagaaaagaagggaaactatcaggagttatgctaacagattta
cttacaaaagaaaaaataaattttaccaatagagaattgacctggcaagaagcaattgaa
ttagctgcacaaccccttcttgataaacatgaaattgaagagcgttatatcaaagctatt
attgataaagtagaagctttcggcccttatattgatttaggattgggaattgcccttcct
catgctcgaccagaagagggggtcaaaaaattaggaatgtcatttttaagatgcgagcat
ccagtaaagttaatgaacgatgataagcatgaaattaaactttttattgttttagcagct
attgataatgagacccatcttagagctttatcaacacttactaagatattatcaaataaa
gaacgcttggggcagttacttgtagcaacaaatgcagcagaagttgaacaaatactttta
aaagaagaaggagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
