Lactococcus sp. NH2-7C: QJV49_04875
Help
Entry
QJV49_04875 CDS
T10489
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
lacn Lactococcus sp. NH2-7C
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
Gly-zipper_C13G5-2
Gly-zipper_Omp
DUF1269
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGV31338
LinkDB
All DBs
Position
complement(1017180..1022318)
Genome browser
AA seq
1712 aa
AA seq
DB search
MADIMVDSVTTGIDLNETKAVEAINRLKSAVKDSTREWQINEAQAKSAGDAVSASKYRYE
GLSEAMEKQKAYIANLSEGMKTINRDTDAGEKAYQKYNAQLTTAERSLASMTGQLNRAKS
AYEYQQTGIEDLNKSLSANDKLMQSQIDLYEKTRNKMGAAKAEVSGLSSSYAKQTEIYRA
QVTELKRLEAAEGTSSETLVKQKTRVNEAASSVLNYRNKLLEANLAVTKMQPFNSESIIG
KGLNTVYKTTEKATDAMAAGYQKVKNAAYQSAFGIAAIGAAAIKGSQMAADLQDSYIRTA
NLAVTGGEKVEEVTKNVAQMQKDGAKYSVEYGKSQAEIAEGYQELIKRGYTSTEALGAMR
SELQASVASGDDFNNVLSVTSQVVDAYGMRTDNAAKMTKNTKDVVNQLAYAADMTATDFA
SMGKSMEYVGDSAHSAGFQLSETSSAIGILSNHGLEADKAGTGLRKVINSITGALSDQSA
SQEDAAKSEAALNEKIAEHQKKLEEAQAVVNSGTGNTKAATKAIEKQKEAIGKLQDKVDQ
LQSGGAAKDMLSKLGIKNSDLVDANGNLRDLTTIMSIVNDHTKNMGTAEKNSVFQQLFGT
TGQQAGIILAQNNKELEELNNKVKNSADGQGYVANLAKKNMGSVKSEIKQFKAAGEAVLI
MIGQKFLPVLSDAATSMAKAFNSKEGKQGLEEIASWIAKIFQGIVDTVKFIGTHKDEVVT
FGKIFAGIWATKKIGDVIVWLEKLKKSLLEIQAIDALSGGLGTGNIKTSVGKEIATEGET
VASTLTKGGIAKEGEALVASGSLSKATSLIPRLLGIIGSVGGSTVLSGGINAGAELLSKD
TTAQKTGGVAGSLGGAAAGAAIGSLIAPGIGTAIGAAIGGMGGKNLGKKLGDLINDGLKE
SSLKSEKLPVVKFDPKAPTKDMKEFSKDYQGFLDKINKASNVDIIDEKSLEKAKKATADA
YTKMSKDIDKFYQNQEKDSKKQVDILVKNGVITQAQADKMTKGQKDSDDKQKAAQKKNLD
EMKKNTDNYYASVSKEQKNYDIQSQKDASNHANLMKKIKSGNTSELLKIEKTYGKNSPEY
QQEMNKEIAKENSDFNKAQQAAKKKHNEAMNKLEKDYAKTQTKAEEQMNNQINTATKIAQ
NKQLDLLDDLKNKKGKLNQKQLIDTLEKADDEYKGVKDKAQKQKDDVVKAANEQYKKSVA
AIDKQRAENSSITKAQYDEMIKTAKKQRDDSIGHANEQYKGVVDKAQKTHKETIDFANDK
ADKNVKAAAGEQKQTVEQYTKGFRDSRDLINSFVDGINGVLNFLHKGWGNIGHVSLKGYA
VGTRGLAQDETALVGEEGFELAHHPNRGIFAVGQQGPEIRNLKAGTSILPHSMSKEFLSL
TANLPAHADGVSGFLSDALGWVKSTYKDVTSVISKGPKGVVEAIYNGLGLDNLENDFPPV
VTRMAKGSAQTAEDNFIKFLQSFFKKAESDAGVSQGSPSGSGVQRWAGQVKQALAANGLS
TSQDMIDRVLRQIATESSGNEKAVQGNIGDINNITGDLAKGLMQTISSTFNANKFPGHGD
IFNGYDNLLAALNYAKKTYGPSLSFLGNGHGYENGGIINAHGFYEIAEGNRPEMVIPLDP
QKKSRATQLLNQAKQTINANSSQQSNYLGDGGQLVVLVSSILTLLKNGQADPTIIQLMLD
KNSFAQELVEPMNKQLSVLNSRNKIINAGRTT
NT seq
5139 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagatataatggttgattcagtcaccacagggattgacttgaatgagacaaaggct
gttgaggctatcaaccgcttaaaatcagcagttaaagatagtactcgtgaatggcagatt
aatgaagcacaggctaaatctgctggagatgctgtttctgcatcaaaatatcgctatgaa
ggtcttagcgaagcaatggaaaagcaaaaagcttatattgctaacctttcagaaggtatg
aagacaatcaatagagatactgatgctggtgaaaaggcttatcaaaaatataatgctcag
ttaaccacagcagaacgttctcttgcctcaatgacagggcaattaaaccgtgcaaaatca
gcttatgagtatcaacaaaccggtattgaagatttaaataaatctttaagtgctaacgat
aaactcatgcagtctcaaattgatttatatgagaaaactcgtaataaaatgggagctgcc
aaagccgaagtttctggtctatcttcttcatacgcaaagcaaaccgagatttatagagcc
caagtaactgagcttaaacggttagaagctgccgagggtacaagttcagaaacgcttgtt
aagcaaaaaacaagggtaaatgaagctgcttcgtcagtattgaactacagaaataaactt
ttagaagctaacttggcagttacaaaaatgcagccgtttaattccgagtctatcattggt
aaaggtttaaataccgtttacaaaacaactgagaaagctaccgatgcaatggcagcagga
tatcaaaaagtaaaaaatgcagcctatcagagtgcttttggcattgcagcaattggggca
gcagctatcaaaggttctcaaatggctgctgatttacaagacagttatattagaacagca
aatcttgcagtaactggaggagagaaggtagaagaagtaacgaaaaatgttgctcaaatg
caaaaagatggcgctaaatactctgttgaatatggtaaatctcaagcagaaattgcagaa
ggatatcaagaacttattaaacgcggatacacatctactgaagctttaggtgctatgcgt
tcagaattacaagcctctgttgcttctggcgatgattttaataatgtattgagcgtaacc
tcccaagttgttgatgcttatggtatgcgtactgataatgcagcaaaaatgactaagaat
acaaaagatgtagttaatcaattagcttatgcagcagatatgacagcaacagattttgca
agcatgggtaaatctatggagtatgttggtgactcagctcattcagcaggtttccaacta
tcagagacatcttcagcaattggtattctttcgaaccacggtttagaagctgataaagca
ggtactggacttcgtaaagtaattaactcaattactggtgcattaagtgatcagtcagct
agccaagaagatgctgctaaatcagaggctgcacttaatgaaaaaattgcagagcaccaa
aagaaactagaagaagctcaagcagttgttaactctggcacagggaacactaaagctgca
actaaagcgattgaaaagcaaaaagaagcaatagggaagcttcaagataaagtagaccaa
ttgcaatctggtggtgctgccaaagatatgctttctaagctaggaattaaaaatagtgat
ttagtagatgctaatggtaacctacgggatttaacaactattatgtccatagtaaatgat
catacaaaaaatatggggactgctgaaaaaaactctgttttccaacaattatttggaaca
acagggcaacaagctggtattattctcgctcaaaataataaagaacttgaagaactaaat
aataaagtgaaaaactctgctgatggtcaaggatatgttgcgaatcttgccaagaaaaat
atgggatcggttaagtcggagataaaacaatttaaagcagccggagaggctgttttaatt
atgattggacaaaagttcttgccagttctatctgatgcagcaacgtcaatggctaaggca
tttaattctaaagaaggtaaacaaggacttgaagaaatagctagttggattgctaagatt
ttccaaggtatcgttgatactgtcaaatttatcggaactcataaagatgaagtagtaacc
tttggtaaaatctttgctgggatttgggctactaaaaaaattggagatgttattgtatgg
cttgaaaaattgaaaaaatctttacttgaaattcaagccattgatgcattatcaggaggt
ttaggaacaggaaatattaaaacttctgtaggaaaagagattgctactgaaggtgaaacg
gttgcttcaacactaactaaaggcggaattgctaaagaaggtgaagcgttagttgcctct
ggcagtttatcaaaagctacttccttaattccaagattattaggaattattggctctgtt
ggtggaagtacagtcttgtctggtggaataaatgcaggagctgaattactcagtaaagat
actaccgctcagaaaactggcggagttgctggctcactcggtggagcagcggcaggtgca
gctattggatctcttatcgctcctggtatcggtacagcaattggtgcagcgattggcgga
atgggtggtaaaaacttaggtaaaaaacttggggatttgattaatgacggattaaaagaa
tcttcactaaaaagtgaaaaactaccagttgttaagttcgatcctaaagcaccaactaaa
gatatgaaagaattctccaaggactaccaaggtttcttggataaaattaacaaggcatca
aatgttgatattattgatgaaaagtcacttgaaaaagctaagaaagcaactgctgatgct
tatacgaaaatgtctaaagatattgataagttttatcagaatcaagaaaaagattctaaa
aagcaagtagatattctagttaaaaatggtgtaattactcaagctcaagcagacaaaatg
accaaaggccaaaaagattcagacgataagcagaaggcagctcagaaaaagaatcttgat
gagatgaagaagaatactgataattactatgctagtgtttctaaagagcaaaaaaactat
gatatacaatctcaaaaagatgctagtaatcacgctaacctgatgaaaaaaattaaatct
ggtaatacttctgaacttcttaaaatagaaaaaacttatggcaaaaattctcctgaatat
caacaagaaatgaataaagaaattgctaaagaaaatagtgatttcaataaagctcaacag
gctgcaaaaaagaaacataatgaagcgatgaataagcttgaaaaagattatgcaaaaacg
caaaccaaagccgaagagcagatgaataatcaaatcaatactgctactaaaattgctcaa
aataaacagcttgatttacttgacgatttaaaaaataaaaaaggaaaattaaatcaaaaa
caattaattgatacgctcgaaaaggctgacgatgaatataaaggagttaaggataaggct
caaaaacaaaaagatgatgttgtaaaagcagcaaatgaacaatataaaaaatccgttgca
gcaattgataaacaacgtgcagaaaacagttctataacaaaagctcaatatgatgaaatg
ataaaaactgctaaaaagcaacgtgatgattcaattggtcacgctaatgaacaatataaa
ggcgtagtagataaggcacaaaaaactcataaagaaacaattgactttgctaatgataag
gctgacaaaaatgtaaaagctgctgcaggagaacaaaaacaaacggtagaacagtataca
aaaggatttagagattcaagagacttaattaactcatttgttgacgggattaacggagtc
cttaacttcttacataaaggttgggggaatatcggtcacgttagccttaaaggatatgct
gtaggtactcgtggattagctcaagatgaaacagctttagttggtgaagaaggatttgaa
cttgctcaccatccaaaccgtggtatttttgcggttggtcaacaaggtcctgaaattcgt
aatctgaaagctggaacttcaattcttcctcactcaatgtcaaaagagttcctatcatta
acagctaatttgccagctcatgctgacggtgtatctggtttcttgtcagatgcgcttgga
tgggttaaatcaacctataaagatgttacaagtgttatttcgaaagggcccaaaggggtt
gtagaagctatttataatggcttaggactagataatttagaaaatgactttccgccagtt
gtaactaggatggcaaaaggttctgctcaaactgctgaggataattttattaaattctta
caatcattcttcaaaaaagctgaatcagatgcaggagtttcacaaggttcgccatctggt
tctggtgttcaacgttgggctgggcaagttaaacaggcgcttgcagctaacggcttgagt
actagccaagacatgattgaccgtgtacttcgccaaattgcaactgaatcaagcgggaat
gaaaaagcggtccaaggaaacatcggagatattaacaatatcactggtgaccttgctaaa
gggttgatgcaaacaatttcctcaactttcaatgctaataaattccccggtcatggggat
atttttaacggttacgataacttattagctgctcttaattatgctaaaaaaacctatggt
ccaagtttgtcattccttggaaatggacatggttatgaaaacggtggaatcataaatgct
catggtttctatgaaattgctgaaggaaatcgtcctgagatggttattccgcttgatccg
cagaagaaatcaagagctacacaattattgaatcaagctaaacaaacaattaatgcaaat
tcatcacagcaaagcaattacttaggagatggtggacagttagttgttttagtttcaagt
attttaacactattaaaaaatggacaagcagaccctaccattatccaacttatgttagat
aaaaacagttttgcacaagaattggtagagcctatgaacaaacaattaagtgttttaaat
agccgtaataaaataataaatgcaggaaggacaacataa
DBGET
integrated database retrieval system