Lactococcus sp. NH2-7C: QJV49_08755
Help
Entry
QJV49_08755 CDS
T10489
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
lacn Lactococcus sp. NH2-7C
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
Glucosaminidase
LysM3_LYK4_5
LysM_RLK
MHCassoc_trimer
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGV29617
UniProt:
A0AA49EV26
LinkDB
All DBs
Position
complement(1721594..1722919)
Genome browser
AA seq
441 aa
AA seq
DB search
MPVSRIKVKNRHLKKKAKKPLAFYKPATKFAGAVLIAGTLTTTHELLLQQTSPMVQAATN
STEAFIESIAASAKPVADSNGLYPSVMIAQAILESNWGSSQLSRAPYYNLFGIQGTYQGK
SVVFKTQEYLNGKWVTKDMPFRVYPSFNQSFQDNAYVLKTTNFGNGPYYAKAWRANAATY
QDATAALTGKYATDPNYGASLNRIISQYNLTRFDGASSAGTSNTGGSTATNTNNNSNTST
SSTTYTVKSGDTLWGISQKYGISVAQIQSANNLKSTIIYIGQKLVLTTSSPSSNTNGSNA
SGNSAASTTPTTSVTPAKPASQTTIKVKSGDTLWGLSVKYKTTIAQLKNWNHLSSDTIYI
GQNLIVSQSAGSSSSSTGSSSASTSSTSNPSAASNTSIHKVVKGDTLWGLSQKSGSPIAS
IKAWNHLSSDTILIGQYLRIK
NT seq
1326 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagtttctcgtattaaagttaaaaatagacatttaaaaaagaaagccaaaaaacca
ctggctttttataaaccagcgactaaatttgctggcgccgttctcattgcaggaactttg
acgaccactcatgagcttttgctccaacaaacaagcccaatggttcaggctgcaaccaat
tcgacagaagcttttattgaaagtattgctgcatcagcaaaaccagttgccgatagtaat
ggtctttatccttcagtcatgattgcccaagctattttggaaagtaactggggttcaagc
caactttctcgtgccccctattataatttattcggtattcaaggaacttaccaaggaaaa
agcgttgtttttaaaactcaagaatatcttaatggtaaatgggtcacaaaagatatgcca
ttcagggtttatccatcctttaatcaaagtttccaggataatgcttatgttttaaaaact
acaaacttcggaaatggtccttattatgctaaagcttggcgagcaaacgcggcaacttat
caagatgcaaccgcagctttaacaggaaaatatgcaactgaccctaattatggagcctcc
ctgaatcgaattatttctcaatataatctgactcgttttgacggagcttcttcagctggt
acttctaatactggtggttcaacagctacaaataccaataataattcaaatacaagtaca
agctcaaccacttatactgttaaatctggtgatacgctttggggaatttcgcaaaaatat
ggaattagtgttgctcaaatccaaagtgcaaacaatcttaaaagtacaatcatttatatt
ggtcaaaaacttgtattgacaacttcaagtccttcgtctaatacaaatggttcaaatgct
tctggaaattctgccgcaagcacaacgcctactacttcggtaactcctgctaaaccagcg
tcacaaacgacgattaaggttaaatctggcgatacgctttgggggctttctgtcaaatat
aaaacaacgattgctcaactcaaaaattggaatcacttgagttctgatacaatttatatt
ggacaaaacttgattgtttcacaatctgccggctcttcaagctcttcaacaggttcaagc
tcagcctctacgagttcaacttctaacccttccgcggcttcaaatacctctattcataag
gttgttaaaggagatacgctttggggactttcacaaaaatctggcagcccaattgcttca
atcaaggcttggaatcatttatcaagtgatactattttaattggtcaatatctccggatt
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
