Lacibacter sediminis: H4075_03515
Help
Entry
H4075_03515 CDS
T06746
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
lacs
Lacibacter sediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_9
PAS
PAS_4
PAS_8
HisKA_3
PAS_3
HATPase_c
PAS_7
HATPase_c_2
HATPase_c_3
PqqF_C_3
PUMA_CC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNA45284
UniProt:
A0A7G5XII1
LinkDB
All DBs
Position
788415..791096
Genome browser
AA seq
893 aa
AA seq
DB search
MSRFAPDLDLQHRLVKRSIIMLTVVFVISLLSFAGWMFSVEWLKHPISGLVAMNPLTSLC
FVGLVIALRFKLKYKGKRSHGAFADSIAVIVLVITFSKLLALAAGWDYSLDQLIFFNEVN
SDTVSGFTNRMAPNTALCFGLLAVGVLFFHKLQRFFLIAAQTATVLVLMVAVFSILGYIF
GAKEFYEVQNYIPMALSSGICFFLFSLAILFASPGTGIMQQLTSKYSGSFIAWRLFLPAF
ILPVLIGLFRLWGQRSGLYNLEFGSALFVTSMILFFLSLIWVNTLLLNRREQSQEEIIAE
KNYMANLVEQTSDAILSTDPYLNIMSWNNGAEEIYGYKKEEVMGKPLGSFLKSTLDPETS
EKLLADLNKRGYYNAEYIFFNKQQQPVNVQASVTVLKNQEHQITGYVAVHRDISERKQLE
KQLKEFNNQLEIQVKEKTAELRDVFERISDAFIGVDNDYNVVYINKRAELLFNISSDQLT
NTSVYKLFSTTEGEVERAIKETFISREYVYLETWLAQFQKWFELNVYPSPSGLSIYIRDI
TIRKKALLELNASEEKYRLFFENSMDGILLTDGKGQIFSANKAATEIFGMTEEEICSGGR
PAILDETDPNWPKFFDARNRYGKAQGELRHFRKNGSTFLAEITSVKFKNASGEEQTNTII
RDITERKRAEEDLNESYQQIRRLTAYLQKVREDERAHIAREIHDELGQQLTVMKMDVSWM
KKKIKNGDVNAVPAKMDELQEILDGTVSTVRRIATDLRPSLLDDIGLIAAIEWEVDMFTK
RTGIKVNLSKPESAVTMPDESVTGLFRILQESLTNIIRHASASQVDIHLENQNNDFILYI
EDNGKGFDMNTVAGKKTLGLLGMKERSAMMRGIFTINSEPLKGTKLEVRVPLS
NT seq
2682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcgatttgcgcctgatcttgacctgcagcatcgcctggttaaaagatcaattatc
atgttaacagttgtatttgtcattagcctgctttcatttgccggctggatgttttcagtt
gaatggctcaagcaccccattagcggattggtagccatgaaccctcttacatcactctgt
tttgtaggcttggtaatagcgcttcgttttaagttaaagtataaaggcaaaagaagtcat
ggggcattcgccgatagtattgctgtaatcgttcttgtaattactttttccaaactgtta
gctcttgcagcaggatgggattattcacttgatcaattgatatttttcaatgaagtaaat
agcgatactgttagtgggtttacaaacagaatggcaccaaatacagccttatgttttggg
ttattggcagtgggtgttttattctttcataaacttcaacgattttttctgattgcggca
caaacagcaacggttcttgttctgatggttgctgtattttccatacttggttacatattt
ggagcaaaggagttttatgaagtgcagaattatatacccatggcactcagttccggtatt
tgtttttttctgttttcacttgccatattgttcgcctctccgggcacaggaattatgcag
cagttaacaagtaagtatagcggtagttttattgcatggaggctgtttctgcctgcattt
attttacctgtgttaattggtttattccgtctatgggggcaacgttcgggtttgtataat
cttgaattcggttcagccttattcgtaacaagcatgatcctcttttttctttcgcttatt
tgggtaaatacgttgctgcttaaccgtcgtgaacagagccaggaagaaattattgctgaa
aaaaattacatggctaatcttgttgaacaaaccagcgatgccattttatcaactgatcct
tacctcaacatcatgagctggaataacggagcagaagaaatctatggttataaaaaagaa
gaggtaatgggtaaacctttggggtcgttcctgaaaagcacactcgatcctgaaacatct
gaaaaactcctggccgatctgaacaagagaggttactataacgctgagtatatttttttt
aataaacaacaacagcctgttaacgtacaggcatcagttactgtattgaaaaatcaggaa
caccaaattaccggctacgttgcagtacatcgggatatttcagaacgaaagcagcttgaa
aaacaactgaaggaatttaacaatcaacttgaaatacaggttaaagaaaaaacagctgag
ttgcgggatgtttttgaacgtatatcagatgcgttcattggggttgataatgattacaat
gttgtttatataaacaagagagctgaattattattcaatatcagttctgatcagttaaca
aacacttcagtgtacaaacttttttcaaccactgaaggtgaggttgaaagggcaatcaaa
gaaacgtttatttcaagggagtatgtatatctcgaaacatggttggctcagtttcaaaaa
tggtttgagttgaacgtatatccatctccgtccggtctatccatttatataagggatata
acaatcaggaaaaaggcattgctggagttaaatgcaagtgaggaaaagtatcgtctcttt
ttcgaaaacagtatggatgggattttgcttacagacgggaaggggcaaatcttttcagcc
aacaaagctgcaacagaaatttttggtatgaccgaagaagaaatatgcagcggtggcaga
cccgctatacttgatgaaactgacccgaactggccgaaattctttgatgcccgtaaccgt
tacggtaaggcgcagggtgagttgcggcatttcagaaaaaacggttcaacatttttagcc
gagattacttcagtgaaattcaaaaatgcttcaggcgaagaacaaacaaacaccatcatt
cgtgatattacagaaagaaagcgtgcagaagaagatctgaatgaatcctatcagcaaatt
cgcaggttaacagcctacctgcaaaaagtgcgggaagatgagcgtgcacatattgcccgt
gaaattcatgatgaattgggacagcagctgaccgttatgaaaatggatgtttcctggatg
aagaaaaaaataaaaaatggtgatgttaatgctgttcccgcaaaaatggatgagcttcag
gaaatattggacggcaccgtttctacggttcggcgtattgcaaccgatttgcgaccgagt
ttacttgatgatattgggcttattgcggcaattgagtgggaggttgatatgtttacgaag
cgcaccggaataaaagtaaacctgtcaaaacctgaatcggccgttacgatgccggacgaa
agcgtcaccgggttgttccggattttacaggagtcactaacaaatattatccgtcatgct
tctgcgagtcaagtagatatacatttggaaaatcagaacaatgactttattttgtacatt
gaggacaatggcaagggtttcgacatgaataccgttgccggtaaaaaaacactcggtttg
ttaggaatgaaagaaagatctgccatgatgcgtggtatctttaccattaacagcgaaccc
ctaaagggaacaaagttggaagtgcgggtgccattaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
