Lacibacter sediminis: H4075_15360
Help
Entry
H4075_15360 CDS
T06746
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
lacs
Lacibacter sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lacs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lacs02000
]
H4075_15360
Transporters [BR:
lacs02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
H4075_15360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
CILP
DUF7382
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNA46805
UniProt:
A0A7G5XMV2
LinkDB
All DBs
Position
complement(3627807..3630794)
Genome browser
AA seq
995 aa
AA seq
DB search
MVLFLALVTTNVSAQQTQVSGTVKDDKGEPVASATVSVKGKNVSTTTGANGTFTIAAKAN
DVLEISAVSFATQEVRITSASTYNIVLSSSSVALTDVVVVGYGRSSKRTLSSAITSIKPE
DLNRGAIGDVGQLLQGKVPGLNITASGDPNRPAAVILRGASTVNSPQGPFYVIDGIPGAD
INAVAPDDIASMDILKDASATAIYGNRASNGVIMVTTKKGKKGKLQTAYNGYVGFETVSS
SLDLLDAAQLRAYAQKNNFTPSTNDDKGANTNWMKAVQKESALSHNHNLSFSGGTDKSSY
SASLNYLKKDGIMLQSSLERVIGRISAEHHALNDHLTLGLNMMSSNSKASNVPLQNMVFQ
QAVKFNPMSPIYNADGTFFENPNNTQYFNPVSIIKNAIDDTKYGSLQGNFTVEAKLPFNL
TFNSNLAYQRGTWLHGEYYNSYYSRNYSTGSFYTNGDPGGGRSLRNFYSNGLAYRGYYQS
SSKTLESYLTWAKKFGAHNIKAVLGYSWQKNTNNDGLQTSQTNFVNDYTGYTNLGLGNYQ
TVNGFAVDYGGAVYEETNFISDFFRLNYDFNEKILVQASVRRDGSSVFGKNKEWGYFPAA
SVAWRLSEEDFLKNVSFINDLKLRVSYGETGNAFGLGAYNAQRLYSKSGTYYNNGVFAAS
FRSSQGSNPDLQWEVTATKNIGLDYGFLRGKINGSIDLYEKTTTNMVFPYAVAQSIDPSG
FLWLNVGKIRNRGIEFSVNVNAVSQKNFSWNTGFNLASNKNVILDLKGPEQYGVNADSTY
YTQIDGPGTSGSRLQILAVGGPLGQFYSFQYAGKDASGNSLFYKKDKTTTTNPSNVTDYF
SLGSPHAKLMFGWNNTLRYKNFDLNFFIRGVLGNKIFNATRADLSYVVTAGQTNITPYAT
DDKRTDTRNNLFSSRYVEDGSYLRFDNATLGYRFNIKNEYISNLRFYATVNNLFVVTKYK
GIDPEINQGGASLGVDYNSFYPKTRTILLGVSVGF
NT seq
2988 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttctttttcttgcacttgttaccacaaatgtaagtgcacaacaaacacaggtaagc
ggaacagtaaaagatgataaaggtgaacctgtagcatctgccactgtatctgtaaaaggt
aaaaatgtttctacaacaacaggagctaacggtacattcacaattgctgctaaagcaaac
gatgtactggagatcagtgcggtttcttttgcaacacaggaagtaagaattacatctgct
tcaacgtacaacattgtattatcatcttcttcagttgctttaacagatgtggtggtggta
ggttatggtcgtagttcaaaaagaactctctccagcgctatcacatccatcaaaccggaa
gatctcaaccggggtgctattggcgatgtgggccagctgttacaaggtaaggtgcccggc
ttgaatattacagccagtggtgaccctaaccgtccggctgcggttattcttcgtggtgca
tcaacggtaaacagtccgcaaggtccgttctatgtaattgacggaattcccggagccgac
attaatgcggttgcacccgatgatattgcttcaatggacattttaaaagatgcctctgcc
acggctatctatggtaaccgggcttctaatggtgttattatggttaccaccaagaaaggg
aaaaaaggtaaactgcagactgcctataacggttatgtaggttttgaaacggtaagcagc
agtttggatctgttggatgctgcccagttaagagcgtatgcgcaaaaaaataattttaca
cccagtactaacgacgataaaggtgcaaatacaaattggatgaaggctgtacaaaaagaa
tcagctttatcacataatcataatctttcttttagcggtggtacagataaaagtagttac
agcgcaagtttgaactatctaaaaaaagatggtatcatgctgcaaagcagtttagaaagg
gttatcggaagaatcagtgcagagcaccacgcattaaacgatcatttaacgttgggtttg
aacatgatgagcagcaacagtaaagcgtcaaatgttccattacagaacatggtgtttcag
caagccgtaaaattcaacccgatgtcaccgatatacaatgcagacggtactttttttgaa
aacccgaataatacacagtatttcaatcctgtttcaattattaaaaatgcgattgacgat
accaagtatggttctttacaaggaaactttacagttgaagctaaacttccttttaactta
acattcaattcaaaccttgcttaccagcgtggtacctggttgcatggtgaatattataat
agttattattcacgaaactacagtaccggaagtttttataccaatggcgatccgggcggt
ggccgaagcctgcgtaacttttattccaatggccttgcttacagaggttattaccaaagc
agttcaaaaacactggaatcttatttaacatgggctaaaaaatttggtgcacataacatc
aaagcggtattaggttacagctggcaaaaaaataccaacaacgatgggttgcaaacaagc
cagaccaatttcgtaaacgattatacaggttacactaatctgggtcttggtaactaccaa
acagtaaatggttttgcggtagattatggcggagctgtttatgaagaaacaaatttcatc
tccgacttcttccgtttgaactacgatttcaacgaaaaaattcttgtgcaggcttccgtt
agaagagatggcagttctgtatttggtaaaaacaaagaatggggttatttccctgcagca
agtgttgcatggcgactttcagaagaagatttcctgaagaatgtttcttttatcaatgat
ttgaagttgagagtgagttatggtgaaacaggaaatgcttttggactgggtgcttacaat
gcacaacgcctttacagcaaatcaggtacttattataacaacggcgtgtttgcagcatcg
ttcagatcttcacaaggttctaatcctgatttacagtgggaagttacagctaccaaaaac
attggtttggactatggattcctgagaggaaagatcaatggttcgattgatttatatgaa
aaaaccacaactaacatggtgttcccttatgccgtagcacaatcaattgacccaagtggt
ttcttatggttgaatgttggtaagatcaggaaccgtggtattgagtttagtgtaaatgta
aatgcggtaagtcaaaagaattttagctggaataccggctttaaccttgccagcaataaa
aatgtaatattagatttaaaaggacctgaacaatatggtgtaaatgccgactctacttat
tacacacaaattgatggtcctggtacttcaggaagtcgtttgcagattttggcagtaggt
ggccctttaggtcagttttattcattccagtacgcaggtaaagatgcttcaggtaattca
ttgttttataagaaggataaaacaacaacaacaaatccatctaatgtaacagattacttt
tcacttggcagtccgcatgccaaactgatgtttggatggaacaacacactccgttacaaa
aatttcgacctcaatttctttataagaggtgtgcttggcaacaagatatttaatgcaaca
cgtgccgatctttcttacgttgttacagcaggacaaacaaatatcactccttacgcaaca
gatgataaaagaactgacacacgtaataatcttttttcatcacgctatgtagaagatggt
tcttacctgcgtttcgataatgcaactttaggttatcgtttcaatatcaaaaatgaatac
atcagtaatctccggttttatgctacagtaaacaacctgtttgtagtaacaaagtataag
gggattgatcctgaaattaaccagggcggtgcatcattaggtgtagattataacagtttc
tatcctaaaacccgcactattctcttaggtgtatcagttggtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
