Lactobacillus acidophilus FSI4: SD55_1170
Help
Entry
SD55_1170 CDS
T03681
Symbol
addA
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
laf
Lactobacillus acidophilus FSI4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
laf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
laf03400
]
SD55_1170 (addA)
Enzymes [BR:
laf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SD55_1170 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
laf03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
SD55_1170 (addA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Viral_helicase1
DEAD
AAA_12
ResIII
AAA_30
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP46529
LinkDB
All DBs
Position
complement(1144150..1147773)
Genome browser
AA seq
1207 aa
AA seq
DB search
MPQFTKEQQQAIDDRGHDILVSASAGSGKTTVLVERVLKEIISGTQVSELLVVTFTKAAA
EEMKTRIKTALTKELAKPGVNRKYLREQLNQVDTANISTIDAFCLEVIRRFYYSVNLNPS
FKILTDETQAALIKERALREIEAESLTDENSGIRYFYDNFAGDRDANSPRDLLLDLYNFA
MAKPEYRSWLKNLAKIYEVNNNIVKSKLWQNQIKSYLLNTFVSLQKKIEEYLNNPTIETK
ELAKVKEDFSLFTQNLDKFIDAIKNDEDYDQQRNLLRLCKFEVKYRKSAKWDEDIQEFYA
ETQKLKSEAKSQIFDIFTAFYATDEKEQTRIMQESQKIVSAISKAELALIDRFNELKRNE
NFLDYSDMEQLAYQILSADTSNSQMAREFYQNKFKEILIDEYQDINALQERIIQQVKNTD
KNTLFMVGDVKQSIYGFRQAEPSLFLKKYHGFASEENKHEKRILLSDNFRSTEPVTKTVN
QLFKSILSSDFGGIDYSKEGQLIFGAKYYPDALPKASEIIVHKKQKDIDNDNNGIDFSEV
EMVLARIKQLKKEHFQVLDSTTGEVRALKYSDIAILTRSHGDNLEIMQEFAKRDIPLFIT
DAENYFQTFELTVIMNYLKIIDNPDQDIPLVTVLRSPLFNFSEKDLAKIRINSKNSGFYS
AVASYVGIGDELSDRCKNFLNKLDELRKFATTHRISELIWSIYAQTNLLEIMTGLPNGEQ
RRINLEALYERASSYESAGFKGLYQFINFINRMRRSQKDLAQPLLSKEAGNAVRLMTIHG
SKGLEFPVVFYLGMQHQYQLRDLKGNYVINPDSLGITLRQEHYRVDSLVKAIGNVTKKRQ
LLEEEARVLYVALTRAKQKLILVGDIANLDKKVQDWSIELDQSGQLSLADKLSVTNPLGF
MGPALAFDKHIVINMNDISNALDQSQSVLYVEYKDSDNFEFKKDEDKVVGDSKNNNYTMD
KLISTTKKLYQFDYPFKDASETTAYQAVSEIKKAFNDPIETELENSRLLSSTNRYLQPID
TKPNFLYQTKFTGAEIGTATHLILQYYDYTGDGSEKQLDYEIEELIKQKKLNPDIVPSLH
KDQIQWFVHSSFAKSFWKNPENLQREVDFSSLISAKNLFKDFSDANAKILVHGTIDGYFV
SNDGIILFDYKTDHVNKSYLDKSINLIKEKYTGQLRLYEQAINEFGEEKVIGKYLILLDA
KQVVEVK
NT seq
3624 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgccacaatttacaaaagagcaacagcaagcaattgatgatcgtggtcatgatatttta
gtttctgcttcagcgggtagtggtaaaacaacagttttagttgaacgcgttttaaaagaa
attatttcaggaacacaagttagtgaattacttgttgtaacttttactaaagcagcagct
gaagaaatgaagactaggattaagacagcgctaactaaagaattggctaagcctggcgta
aatcgaaaatatttacgtgaacaattaaatcaagttgatacagctaatatttcgacaatt
gatgcattttgtttagaagtgattcgtcgtttttattattcagttaacttgaatcccagt
tttaaaattttaactgatgaaactcaggcggccttaattaaagaaagagcattacgtgaa
attgaagctgaatcgttaactgatgaaaattcaggtattagatatttttatgataatttt
gctggcgatagggatgctaatagtcctagagatttattgcttgatttatataattttgca
atggctaaacctgaatatcggtcatggcttaaaaatttagctaaaatttatgaagttaat
aacaatattgttaagtcaaaactttggcaaaatcaaattaagtcgtatttattaaatact
tttgttagtttacagaaaaagatcgaggaatatctaaataatcctaccattgagactaaa
gagctggctaaagttaaagaagattttagtttatttactcaaaacttagataagtttatt
gatgccattaaaaatgatgaagattatgatcaacaaagaaatttattaagactatgtaaa
tttgaagtaaagtatcgcaaatctgccaagtgggatgaagatattcaagaattttatgct
gaaacacaaaagctaaagtctgaagccaaaagtcaaatttttgatatttttacagctttt
tatgctacagatgaaaaagaacaaactagaataatgcaagaaagccaaaaaatagtgagt
gctatttctaaggcagaacttgctttaattgatcgttttaatgagttaaagcgtaatgaa
aatttccttgattatagtgatatggaacaactagcatatcaaattttgagtgccgatact
tcaaattcacaaatggctcgtgaattttatcaaaataaattcaaagaaattttaattgat
gaatatcaggatattaatgctttacaagagcgaatcattcaacaagtgaaaaatactgat
aaaaacactttgtttatggtgggggatgttaagcaatctatttatggatttagacaagct
gaacctagcttatttttgaaaaagtatcatggttttgccagtgaagaaaataaacatgaa
aagagaattttattatctgacaattttcgatctacggaacctgtaactaaaacggtaaat
caattattcaaaagtattttaagttcagattttggtggaattgattattctaaagaagga
caattgatttttggagctaagtattatcctgatgctttacctaaagctagtgaaattatt
gttcataaaaagcaaaaagatatagacaacgataataatggaatagatttctctgaagtt
gaaatggtcttagctagaattaagcaattgaaaaaggaacattttcaagtattggatagt
acaactggggaagtgcgtgctcttaaatatagtgatattgcaattttaactagaagtcat
ggggataatttggaaattatgcaggaattcgctaagcgtgatatccctttatttattact
gatgcggaaaattattttcaaacttttgaattaacggttatcatgaattacttgaaaatt
attgataatccagatcaagatattccattagttactgttttgcgttcaccattattcaat
tttagtgagaaagatttagctaaaattagaattaatagtaaaaatagtggtttttatagt
gctgttgcttcatatgtaggaataggtgatgagcttagcgatagatgtaaaaatttctta
aacaagttggatgaattgcgtaagtttgctacaactcatcgaatttcagaattaatttgg
agtatttatgctcaaactaatttattggaaattatgacagggttgccaaatggtgaacag
cgtcgtatcaacttagaggctctatatgaaagagcatcatcttatgaaagtgcaggtttt
aaagggctatatcaatttatcaattttattaatcggatgagacgtagccaaaaagattta
gctcagccgcttttatctaaagaggcagggaatgcagtacgtttgatgacaattcatggg
tcaaagggattggaatttccagtagtattttatttgggaatgcagcatcaatatcaattg
cgtgatctaaagggaaactacgtgattaatccagatagtttgggaattactttaagacaa
gaacattatcgtgttgattctttagtcaaggcaatcggaaatgttactaaaaaaagacaa
ttacttgaggaagaagcacgtgttttatatgttgctttaacaagagcaaaacaaaaattg
attttagtcggtgatattgctaatttagacaagaaagttcaggattggtctatcgaacta
gatcaatctgggcaattatcgctggcagataaattatcagtaactaatcctttaggattt
atgggcccagcgttagcattcgataaacatattgttattaacatgaatgatatttcaaat
gcattagaccagagtcaatctgtattatatgttgagtataaagactcagataactttgaa
ttcaaaaaagatgaagataaagttgtaggagactctaaaaataataattatacgatggat
aaattgataagtactactaaaaaactgtatcaatttgattacccatttaaagatgcaagt
gaaactacggcttaccaagcagtttctgagataaagaaggcatttaatgatccaatagag
acagaattagaaaattcacgtttattatcatcaactaacagatatttacaaccaattgat
actaaacctaattttctttatcaaactaaatttactggtgcagaaatcggtactgctaca
catttgattttacagtattacgactatactggtgatggtagtgagaagcaacttgattat
gaaattgaagaattaattaagcagaaaaaactaaatcctgatattgtgcctagtttacat
aaagatcaaattcagtggtttgttcatagtagttttgcaaagtctttttggaaaaatcca
gagaatttacagcgagaagttgatttttctagtttaatttctgcgaaaaatctatttaaa
gattttagtgatgctaatgctaaaattttggttcatgggacaattgatggctattttgtc
tcaaatgatggtatcattttgtttgattacaaaactgatcatgtgaataaatcctactta
gataaatctattaatttaatcaaggagaaatatacaggtcagcttcgtttgtatgagcaa
gcaataaatgaatttggcgaagagaaagttatcggaaagtatttgattttacttgatgct
aaacaggttgttgaagttaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
