Lactobacillus acidophilus FSI4: SD55_1638
Help
Entry
SD55_1638 CDS
T03681
Name
(GenBank) cell wall-anchored surface protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
laf
Lactobacillus acidophilus FSI4
Pathway
laf02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
laf00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SD55_1638
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rib
RibLong
Pectate_lyase_5
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
aRib
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP46938
LinkDB
All DBs
Position
complement(1645827..1651601)
Genome browser
AA seq
1924 aa
AA seq
DB search
MLSKNNFKERLRKMEPRKERFSIRKFSIGAASVLIGFSFMSMAGNQKVQAATEEEPVVAT
KNTEQQSKTDGTQSAEEQSSADAGNAQNNKSAKANATTPSNQNATDSKLTQSSAQDLSKD
NVNSDSKNASDSTSEVKQNNQAIQPETSKPSREVENNETAKNASASQTTNTLNVNKASET
QAKSGSESVTSPNKGLVSENKAKVEVKSSTQPKAAMLSLVQESNPATQTETVTDYSTFLN
ALRNANTGTINLQNDIDFSNANLKHGPNNGLSGKYERLNNTGIARAITINGNGHELKMGD
RYIEFTSANQKNTNSNWDIQLKDLTLQTTSGYGPFWFDNTADEAAKNTITFNGVTTTTDS
HEIMWYNGGGASTTHVKFEGNNTINSTLNGNTAAIYAYSVEAVNGNTTFNVIDSSPDNAG
ANRSAILISIDAAHAGKVIVDKGATLTINGDNQVNVPKMNSADSYGTMGIRFQNWAKTDI
DKAKTSVVQVNGNLNLNMGKGGSTAILGSYVDVQPDGNVTINTQQNGTSTVAGDLALGHR
GTHFGVIAGGIEVSDDYAGLRIANGGSLKIVRPTDVNSTQPLISYGDAGSSGGKTFTVNV
ENGGTLDLQDGATDPQTWSFSNTSSTGNTNMPWAGLITMWGTSGTNTIKINNPKYINLQR
TGNQTGSLMRLEGTTNNVSINGDINNVITPLAQWDEGAKNNPSYYWYIENEANQNNWGNY
ANRFVQSGKNPQPAANAGVTTFMHSSGSVQMAPNQAGTNSSKFSNGEVAQTLNEAINYQA
PYLNQFLNHFSWWAPQRIAMGSGLEDVVKPTDAEKYQPEVKTINGNTKQTLKDLTAKDGI
KGLLSSDGTETTDLSSVKSVSWYDTATDATGWKSLMGDETEPTNPTGDLKTTDKSAWAKV
TYQDGSIDFANIPLNITEPTANLYTPSYKPVTVEQGQSATDDPAFTDQAGKDATAPTGTT
FTTGTDTPDWATINSSTGTVTVKPGANVTVGAYNVPVTVTYPDKSTDETTVPVIVTKAGQ
TVTWGDKGAVVTSVDTSKLNAHETTENSQVLSAGGVVTAEGYELTDGKLSTTATPITIDP
STVSWTTTPDTNVDTATATGKKIENSTIKIDFTNNDAAKNSLGSKNGVVTTNPFTIDAKG
AGAKAVTAPVDIKLGSDLNSEQFDQLVDNNIPIDEIASTTWATMPNEKGQGGVIKITFTD
KDANGNPTYLNINIPASSIKVTTDAETNTPQGQNVSTKVGEVPDPAEGIRNKSDLPDETK
YTWQDTPDTTKPGKKPAVVVVTYPDGSKDTVSTNVIVDAKPEIKTITTTVGGDPVATEGI
ANLNNGGNTPVDGYPTSATWTTKPDTSKSGTTTGTATVTYPDGTKETVTIPVTVNKSSQV
TMTYDFYSTVTIDNPDGTSTTEPRQHISFTYLGIPTDADVNVEFKNVAIPSFDGYTPEVS
LTTPSAEGTPMATLEKGVDGKWTLKLPKPELSYPYYNYTISYKKSGSETPTDADKYTPEG
QDVNTKTGVVPDPAEGIKNKSDLPEGTKYTWKDTPDVTTSGNKPATVVVTYPDDSKDEVP
VTIHVTNPTTPTDADKYTPEGQDVNTKTGVVPDPAEGIKNKGDLPDGTKYTWQDTPDVTT
SGDKPVTVVVTYPDGSKDEVSVTIHVTNPTTPTTPTTPTTPTDADKYTPEGQDVNTKTGV
VPDPAEGIKNKGDLPNGTTYTWKATPDVTTPGDKPVTVVVTYPDGSKDEVPITIHVIDNT
PNQPSSKDDNNTPKKSDADKNTPKGKDITVKQGETPNPADGIKNKGDLPSGTKYTWKNTP
DTSTPGRRTATIVVTYPDGSQDEVTININVMAENSANNNSNTNVHDDVAKQNNAPQAQDM
TVPSINSATNGTNVKAQTGAQVSHKNSLPQTGSNDNKAGIFGLAIATVGSLFGLAFGKKR
KEDE
NT seq
5775 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatccaagaataatttcaaagaaagattaagaaagatggaaccgagaaaagaacgg
ttttccattcgtaagttttctattggagcagcttcagttttgattggcttcagctttatg
agcatggctggaaatcaaaaagttcaagctgctactgaagaggagcctgtagtagcgact
aaaaatactgagcaacaatcaaagactgatggtactcaaagtgctgaagaacaatcaagt
gcagatgcaggtaatgctcaaaataataaatcagctaaggcaaatgcaactacaccaagt
aatcaaaatgctactgatagcaaacttactcaatcttctgctcaagatttatcaaaggat
aatgttaattcagactcaaagaatgcatcagattctacaagtgaagtaaagcaaaacaat
caagcaattcaacccgaaacttctaagccctcaagagaagttgagaataatgagactgct
aagaatgcttcagctagtcaaacgactaatacattaaatgttaataaagcatcagaaact
caagctaaatcaggtagtgagtcagttacctctcctaataaaggtctagtttctgagaat
aaagcaaaagtagaagttaagagtagtacacaacctaaagctgcaatgctatcattggtt
caagagtcaaatcctgctactcaaactgaaacagtaacagactactcaacgtttcttaat
gctttgcgtaatgctaatactggcactattaatttacaaaatgatattgactttagtaat
gcaaatttaaagcatggtcctaataatggattatctggaaagtatgaacgccttaataat
actggaattgcacgtgctataactattaatggtaacggccacgagctaaagatgggagac
cgttacattgaatttaccagtgctaatcaaaaaaatactaatagtaattgggatattcaa
ttaaaggatcttaccttacaaactaccagtggatatggaccattctggtttgataataca
gcagatgaagcggctaaaaatactattacttttaacggggtaactactactactgattca
catgaaattatgtggtataacggcggtggtgcctcaactactcatgttaaattcgaaggc
aataatactatcaacagtacgcttaatggtaatactgcagccatctatgcttatagtgtt
gaagcagtaaatggaaatacaacctttaacgtaattgatagctcaccagataatgcaggt
gctaatagatcagcaattttgatttcaattgatgcagctcatgcgggtaaagtcatcgtt
gataaaggtgctacattaactattaatggagataatcaagttaatgttccgaaaatgaat
agtgctgattcttatggtacgatgggaattcgtttccaaaactgggctaaaacagatatc
gataaagctaagaccagtgttgttcaagttaacggtaatttaaacttgaatatgggtaaa
ggtggttcaaccgctattttaggttcttatgtcgatgtacaaccagacggtaatgttact
attaacacgcaacaaaatggtactagcactgttgctggtgacttggctctaggtcataga
ggtactcactttggtgtaattgctgggggtatcgaagttagtgatgattatgctggcttg
agaatcgctaatggtggtagtttaaagattgttcgtccaaccgatgtaaactctactcag
cccttaatttcatatggtgatgcaggttcttctggtggtaaaacatttacagtaaatgtt
gaaaatggtggtactcttgatttacaagatggtgctactgatccacaaacttggagcttt
agtaatactagtagcacgggtaatactaatatgccatgggctggtttgattactatgtgg
ggaaccagtggtacaaatactattaaaattaataatcctaagtatattaatttgcaacgt
accggcaaccaaactggatcattaatgcgccttgaaggtactacaaataatgtttcaatt
aatggcgatattaataatgttattaccccattagctcaatgggatgaaggtgcaaagaat
aatccttcatactactggtatattgagaatgaagctaaccagaataactggggtaattat
gcaaatcgctttgtacaaagtggaaagaatcctcagcccgctgcaaatgccggagttact
acatttatgcattcaagcggtagtgtacagatggctcctaaccaggcaggaactaattca
tccaagtttagcaatggagaagttgcccaaactctaaatgaagctataaattatcaagct
ccatatttgaatcaattcttgaatcactttagttggtgggcaccacaaagaattgccatg
ggaagcggcttagaggatgtagtaaaaccaactgatgctgaaaagtatcaaccagaagtt
aaaactattaatggtaatactaaacaaactttaaaggacttaactgctaaagatggtatt
aaaggcttgctttctagtgatggtaccgagacaactgatctttcttctgttaagagcgta
agctggtatgatacagctactgatgccactggttggaagagcttaatgggagatgaaaca
gagccaactaatccaactggtgatttaaagaccactgataaatcagcttgggcaaaagta
acttatcaagatggatcgattgactttgcaaatatcccattgaatattactgaaccaaca
gcaaatctttacactccatcatataagccagtaactgttgaacaaggccaatctgctact
gatgatccagcatttactgatcaagctggtaaggatgctactgctccaactggaactaca
tttactacaggtactgatacgccagattgggcaaccattaattcatcaactggtactgta
actgttaaaccaggtgccaatgtaactgtaggtgcttacaatgttccagtaactgtaact
tacccagacaagagtactgatgagactactgttccagtaattgtcactaaggctggccaa
acagtaacttggggtgataagggtgcagttgtaactagcgttgatacttctaaacttaac
gctcatgaaactactgaaaattcacaagttctttctgctggtggcgttgtaactgcagaa
ggttacgaattaacagatggtaaactttcaactacagctactccaattacgattgaccca
tcaactgtaagttggactacaacgccagatactaacgttgataccgcaactgcaactggt
aagaaaattgaaaacagcactattaagattgacttcactaacaatgatgcagctaagaat
agcctaggctcaaagaatggtgttgtaactactaatccatttaccattgatgctaaaggt
gctggtgctaaggctgtaactgctccagttgatattaaacttggctcagatttaaatagt
gaacaatttgatcaattagtagataacaacatcccaattgatgagattgcatctaccact
tgggcaaccatgcctaatgaaaaaggtcaaggcggagtaatcaagattacctttactgat
aaggatgctaatggtaatccaacttacttgaacattaatattccagcaagttcaatcaag
gtaactactgatgcagaaaccaataccccacaaggtcaaaacgtttcaactaaggtcggc
gaagttccagatccagcagaaggcatcaggaacaagagcgacttaccagatgaaactaag
tacacttggcaagacactccagataccactaaaccaggtaagaaaccagcagttgttgtc
gtaacttatccagatggctcaaaagatacagtttcaactaatgtaattgttgatgctaag
ccagagattaagacgattactacaactgttggtggagatccagttgctactgaaggtatt
gctaacttgaataatggtggtaatactccagttgatggttatccaacaagtgcaacttgg
actactaaaccagatacttcaaagtcaggtacaactactggcactgcgactgttacatat
ccagatggtactaaggaaactgtaactattccggtaaccgtgaataagagtagtcaagta
acaatgacttatgacttctactcaacggttactatcgataacccagatggcacatcaaca
actgagccaaggcagcacataagttttacttatctgggtattccaactgatgcagatgta
aatgttgaatttaagaatgtagctattccaagctttgacggttatactccagaagtaagt
ttgactacacctagtgctgaaggtacaccaatggctactcttgaaaagggagttgatggc
aagtggacattgaagttaccaaagccagaattatcttatccatactacaattacactatt
agctacaagaagtctggttcagaaacaccaaccgatgcagacaagtatactccagaaggc
caagatgtgaacaccaagaccggcgttgtaccagatccagcagaaggtatcaagaacaag
agtgacttaccagagggcactaagtatacttggaaagacaccccagatgtaactacttca
ggtaacaagccggccacagttgtagtaacttatccagatgattcaaaggacgaagttcca
gtaactatccacgtaacgaacccaacaacaccaaccgatgcagacaagtatactccagaa
ggccaagatgtgaacaccaagaccggcgttgtaccagatccagcagaaggtatcaagaac
aaaggcgatttaccagacggtactaagtacacttggcaagacaccccagatgtaactact
tcaggtgacaagccagtaacagttgttgtaacttacccagacggctcaaaggatgaagtc
tcagtaactatccacgtaacgaacccaacaacaccaaccactccaactactccaactact
ccaactgatgccgataagtatactccagaaggtcaagatgtgaacaccaagaccggcgtt
gtaccagatccagcagaaggcatcaagaacaagggtgacttaccaaatggtacaacttat
acttggaaagctaccccagatgtaactactccaggtgacaagccagtaacagttgttgta
acttacccagacggctcaaaagatgaagttccaattacaattcacgtgattgacaatact
ccaaatcaaccatcatctaaggatgacaacaatactcctaaaaagagtgatgctgataag
aatactccaaagggtaaagacattactgtaaaacaaggtgaaacaccaaatccagccgac
ggcattaagaacaaaggtgatttaccaagtggtaccaagtatacttggaagaatactccg
gatacttcaactccaggtagaagaactgcaacaatagttgtaacttacccagatggttca
caagatgaggtaacaatcaacataaatgttatggctgaaaatagtgctaataataacagt
aatactaatgttcatgatgatgttgccaagcaaaataatgcaccacaagctcaagatatg
accgtgccttcaatcaatagtgctactaatggcactaacgtaaaggcacaaacaggtgca
caagtatctcataaaaattcacttccacaaactggatcaaatgataataaagctggtatc
tttggtttagctatcgcaactgtaggcagtttgtttggacttgcctttggtaaaaaacgt
aaggaagatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system