Lysinibacillus agricola: FJQ98_03310
Help
Entry
FJQ98_03310 CDS
T07480
Name
(GenBank) LPXTG cell wall anchor domain-containing protein
Organism
lagr
Lysinibacillus agricola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen_bind
SpaA
DUF3244
CarboxypepD_reg
Gram_pos_anchor
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQP13114
LinkDB
All DBs
Position
682796..688024
Genome browser
AA seq
1742 aa
AA seq
DB search
MQKLKKLNIAIILMLLVFQTVLSPISVFASEDISSTPSEQSEVTEQQADMGQQVDTEQPD
TDSGDEESSGNASDTNEEESTNQSPESDIGEEISKDVDEDSEGEETTNDDSVILPLNKEE
LAAQQIPATLTSFEMKINGKTVENGGFGTELPKDTLANFTIKFSVPMQNDQEEAWGDGSW
FEFQLPKSLIDFDEKFNGSRTVDGITYTYTTTDNKVRVELNGMTPESASSQPEELTITFN
SEFNNLSDEIEQELEIPAVTGGSDTIKAKFTFLPSTSNKTVSKSEVGTPTPTASGNHEME
WQVWVNEAGKTLNNPKLIDNPTPLAGSPSHEIVANSVNVYQYEVGLNGVKNQTGNGTQVI
ENGDWGNIESKLTGKYAYKITYKTAVSLDSDKRDGEVKFNNTVTFTNNGQSETSKQATHT
ITYGKALEKKLVSNTNYKTEWRIDYNHNLLNIGKDNAKITDTITGPHEIDTSSIKVYKMN
DATGNVVNEVSQGEEVKTGFTIDGDAKTFTLTFDSAILDAYTIVYDANYNKQDFYETEDG
PFKNSVTSGSGKTNNKSYELTENLLEKSHKVDFDKKVITWTIEIKSDNPKKPINNLTLTD
TFTADDADGKHELIANSVKLNGTDANYTLIEKGFTITDINVPSGETATITYQTSFAIDDN
GVVQNQGYGNKATTKWTSGKETYEKTDTDKYVPDTTTVNNGSKSGKFDYVTQEFTWDVKV
NINKKDINGAVLVDTVGDGHKYVRGTIEVLPLTNLGGSDTGGTIGTKPISSDYYDVSDES
DKGFTLTFKSLSEEINNKAYVVRYKTMDDDKILGIGSDNKKEEGNVYTNGATFKTNGTQE
FTLDSTPVIIDGDVANNLITKNTPTQDAAKELITWTLDVNKSHSDLGKEVTLTDLPGDNL
MLLENNIKIAPYTVTPTGITNGAWQTPEQLGLTVTFDTVGGFSIVFPDLINKGYQVQYET
VGFGKFKDSLINTATLNYTGQTMANQQTEDKFNGNFNFSSSESSFTSTRGSAKFTKVGID
SATGQFKENLADVTFQLIKKTATNEYIIKTATTNENGEFTFDNVAYNDYFIREVAAPIGY
DKMGDYPFKLDEDTTLDRNPDLVMQLVNTTPIVGSACTQFEITINDIDGKSITSGTVTLI
DKNGLETAPYTVTNGKVTLPNNFTAGEYTVIHSVEGDLGSVTVKYDGKCKDVIQPAPKCE
NFTIVVEDEEGNIRTNIKELTLKSDTTEVKISSDASGKFIFESNKNNPENGVKPGEYTVY
EGNQFLGTVTLTYKEKCGHEFIVKQLPRCEKFELTVKDVDGNKITDDTTIIVVKDIEEKE
IINTTTKTGVIELTDLEPGTYTVEVDGEKIGTFQTNIECEKSVQPAPKCDLFTVTVKDEN
GNPRPNVSNITIKDKTGATIATNKTTNELGQITIPSENIPSGVYDVYQGDLFIGQITVKY
SVNCEAEISAAPACPTFTLTVLTKFGTPNANAKITIKDAKGNIVKGADDNGVLTTSIAGT
VVLPDKAIKQGTYYVYEGNSLIGSFTVKDTCSATVKPSSTGGGGDGGGWTPDPEKPVVPE
KPTPDPEKPVDPNKPNPDPEKPVDPNKPNPDPEKPVDPEKPTPEPEKPVGPGKPVDPEKP
GNSTTDPKNPTNPGKPSVQEVIDQGTNLPPYNSSTTNTNTLDAYKDFLNKYNSLSKEEQA
EVAKSLDIDKIKADAEKLEAQLKAKGKLPQTDGANQTALTLIGVALVLGALFLLRRRNTE
VK
NT seq
5229 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaattaaaaaaattaaacatagcaataatcttaatgctactcgtattccaaacc
gtactatcaccgatttcagtgtttgcgagtgaagacatttcttcaacaccgtcggaacaa
tcagaagtaactgaacaacaagctgacatgggacaacaagttgacactgaacaacctgac
acagatagcggggacgaagaatctagcggtaatgctagtgatacaaatgaagaggaaagt
actaatcaatctcctgaaagcgatataggagaagaaataagtaaagatgtagacgaggat
agtgaaggtgaagaaacaacaaatgatgactcggtgatattgccgttgaataaggaggaa
ttagctgctcaacaaattcccgctactttaacatcatttgaaatgaaaattaatggtaaa
acagttgaaaatggtggttttggtacagagttacctaaagatacattagcaaactttact
attaaattctctgtccctatgcaaaatgatcaagaagaagcgtggggagacggtagctgg
tttgaattccaattaccaaaatcattaattgactttgatgaaaaatttaatggtagtaga
acagttgacggtatcacatatacttatacaactactgataataaagtacgtgtagagtta
aatggtatgacaccagaatcagcgagttctcaaccagaagaattgacaattacattcaat
tctgaatttaataatctatctgatgaaattgagcaagaactggaaattccagcagtcact
ggtggtagtgatacaattaaagctaaatttactttcttgccatcaactagcaataaaaca
gtaagcaagtcagaagtaggtactcctacaccaacagcaagcggtaaccatgagatggaa
tggcaagtttgggttaacgaagctggtaaaacgttaaataatccaaaactaatagataat
ccaactccgctagcaggttcaccatcacatgaaattgtggctaattctgttaatgtttat
caatatgaagttggtttaaatggtgtgaaaaatcaaacaggcaatggaactcaggttatt
gaaaatggtgactggggaaatattgaaagtaagttaactggtaaatacgcatataaaatt
acgtataaaacggcagtatcattagattctgataagcgtgatggtgaagttaaattcaat
aacacagttacatttactaataatgggcaaagtgaaacttctaaacaagctactcataca
attacgtatggtaaagcgctagaaaaaaagttagtcagcaatacaaactataaaacagag
tggcgtattgattacaaccataacctgttaaatatcggtaaagataatgcaaagataact
gatacaattacaggccctcacgaaattgacacatcaagcatcaaagtatataaaatgaat
gatgcaactggaaatgtagttaatgaagtgtcgcaaggtgaagaggttaaaacaggcttt
actattgatggagatgctaaaaccttcacactaacatttgatagtgctattttagatgca
tatacaattgtttatgatgcgaattacaataaacaagatttctatgaaacagaagatggt
ccatttaagaacagcgtgacaagcggttcaggtaaaacgaataataagtcgtatgaacta
actgagaatttactagaaaaatcacataaagttgactttgataaaaaagtcattacatgg
acgattgagattaaatctgacaatcctaaaaaaccgattaacaacctaacattaactgat
acatttacagcagatgatgcagatggtaaacatgagttaatagctaattctgtaaagctt
aacggtacagatgcaaattatacccttattgaaaaaggctttacaatcacagatattaac
gtgccttcaggtgaaacagcaactataacttatcaaacaagcttcgcaattgatgataat
ggtgtagtacagaatcaaggttatggtaataaagctactacaaagtggacaagtggtaaa
gaaacatacgaaaaaactgatacagataagtatgttccggatacaactacagttaacaac
ggtagtaaatcaggtaagttcgattacgtaacacaggaatttacatgggatgtaaaagtt
aatattaataaaaaagatattaatggggccgtattagttgatacagttggagatggacat
aagtatgtacgaggaacaattgaagtactacctttaactaatttaggtggtagtgataca
ggtgggacaattggaacaaaaccgatttcttcagattattatgatgttagtgacgaatct
gataaaggctttaccctaacattcaagtctttatcagaagaaataaacaacaaagcatac
gttgttcgttataaaacaatggatgatgataaaattcttggtatcggttcagataataaa
aaagaagaaggaaatgtttatacgaatggtgccacatttaaaacaaatggtactcaagag
tttacacttgattcaactccagtaataattgatggagatgttgcgaataatttaattacg
aaaaatacaccaactcaagatgcggctaaagaattaattacttggacgttagatgtaaat
aaatctcattctgatttaggtaaagaagtaacattaacagacctaccaggtgacaactta
atgttattagagaataacattaaaatagcaccatatacggtaactccaacaggtattacg
aatggggcttggcaaacacctgagcaattaggattgactgtaacgtttgatacagtaggt
ggctttagcatagtattccctgacctaattaataagggctatcaagtacagtatgaaaca
gtaggctttggtaagtttaaggattctttgataaacacagcaacattgaattatactggt
caaacaatggctaaccaacaaactgaagacaagtttaatggtaactttaactttagtagc
tcagaatctagctttacttcaacacgaggtagcgcaaaattcacaaaagttggtattgat
tcagctacaggtcaattcaaagaaaatttagctgatgttacattccaacttattaaaaag
acagcaacgaatgaatatatcattaaaacggctacgacaaatgagaatggtgaatttaca
tttgataatgtagcgtacaacgattatttcattcgtgaagtagcagcaccaattggctac
gataaaatgggagattatccatttaagttagatgaagatactacactagatcgtaatcca
gatttagtaatgcaacttgtaaatacaacaccaatagtaggtagtgcgtgtacacaattt
gaaattactatcaatgatattgatggtaagtcaattacatcaggcacagttacattaata
gataaaaatggtttagaaacagcaccatatacagtaacaaatggcaaagttacattacct
aataatttcacagctggtgagtatacagtaattcattcagttgaaggtgatctaggtagc
gttacagtgaaatacgatggtaaatgtaaagatgtaattcaaccagcacctaagtgcgaa
aacttcacaatcgtggttgaagatgaagaaggaaatatccgtacaaatattaaagagtta
acgttaaaatcagatacaacagaagtaaagatatcatctgatgcgtcaggtaagtttatt
tttgaatctaacaaaaataatcctgaaaatggcgtaaaaccaggtgagtatacggtgtac
gaaggtaaccagttcttgggtacagtaactttaacgtacaaagaaaaatgtgggcatgaa
tttatcgttaaacaattaccaagatgcgaaaagtttgaattaactgtgaaagatgtggat
ggtaataaaattactgatgacactacaataattgttgttaaagatattgaagagaaggaa
atcattaacacaacaactaagacaggcgttattgaattaactgatttagaaccaggtact
tatacagttgaagtggatggtgaaaaaattggtaccttccaaaccaatatcgaatgtgaa
aaatcagttcaaccagcaccaaaatgtgacctattcacagtaacagtgaaggatgaaaat
ggcaatccacgtcctaatgtaagcaacatcacaatcaaagataaaacaggagcaactatt
gctacaaacaaaacaacaaatgaattaggtcaaattactattccatctgaaaatattcct
tcaggtgtgtacgatgtatatcaaggagacctatttattggtcaaattacagttaaatat
tcagttaattgtgaagcagaaatatcagcagcacctgcttgtcctacatttacattaaca
gtactaactaaatttggaacgcctaatgcgaatgcaaagataacaataaaagatgctaaa
ggtaatattgttaaaggtgcagacgacaatggagttctcacaactagtattgcaggaacg
gttgtattaccagataaagctattaaacaaggtacgtactatgtatatgaaggaaatagt
ttaattggctcatttactgtaaaagatacatgctctgcaacagttaaaccttcatcaaca
ggtggaggcggagatggcggtggctggacgcctgatccagaaaaaccagttgttccagaa
aaaccaacaccagatccggagaaaccagttgatccaaacaaaccaaatccagatccggag
aaaccggttgatccaaacaaaccaaatccagatccggagaaaccagttgatccagaaaaa
ccaacaccagaaccagaaaaaccggttggtccaggaaagccagttgatccagaaaagcca
ggtaactcaacaacagatccaaaaaatccaacaaatcctggaaaaccatctgtacaagaa
gtcattgatcaagggacaaacttaccgccatataattcttctacaacaaatacgaacaca
ttagatgcgtataaggatttcctcaataagtacaacagcttatcaaaagaggaacaggca
gaagtagcaaaatctcttgatattgacaaaatcaaagcagacgctgaaaaattggaagct
caattaaaggcgaaaggcaaactaccacaaacagatggagcaaatcaaacagctcttaca
ctaattggtgtagcgctcgttctaggtgcgttattcttattgcgtcgtcgcaatacggaa
gtgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system