Lysinibacillus agricola: FJQ98_16800
Help
Entry
FJQ98_16800 CDS
T07480
Name
(GenBank) peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein
Organism
lagr
Lysinibacillus agricola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_lysozyme2
Peptidase_M23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQP10903
LinkDB
All DBs
Position
3371429..3377914
Genome browser
AA seq
2161 aa
AA seq
DB search
MQALLDDLGSAKSMYRDMYETSKNSSGSAMRENEIYMRSLEARIALTRVEFEKLAVSIGD
AFLTDGMVTFLQLASGGLGTITSLVNGVGLLPIVLGTAGMATFALSNNFRTLSANVGSSI
ISLLGFRGAATATTTATNLLTATSRGLEVAWKGLGIAFKGFISSLGVGLPLVAIGFVIEK
LMSKMGEARQKAEELESANKEMLNSYSQNATDIDELSKKYEELEKKMALSNVDSKTINEY
RDIQNEIGTKLPSLVTGEDSYGNKLIGTSDALKVKIDLLKQQLEIDKQIADAEANKKRNE
DIDTYNSDMNSAKDKMQGRLQVLANYDDNSLKWAKKLDVPKDVVIRLVNDEGEPLYKTAD
EVAKKLDEVKTKHLEAKNSGNDGLVEYYSKLLFMLEETYKAVLPHELEMNKSTANLKTQY
IASLNAMISTNSSLQDSTKEMAQVFSSQLLSMSDSSNINDLKNGLETLFSYNGNDELSSK
ANEITANISKSFSDMANATEEDFGKTSTNVKAMLDGLPKLLKDVIKDEEDRKAVMDLLNK
TYENAVVQHEKIAKAAKESGISFEQAAANAVEFGEGAEQSGNAVSELASKMSEFKDVTEQ
MAGVSQSGVDALNDLIWQYDTLSNQLAGYTEQQLQDIYVKENLTAEERSVKKVLDDRVAI
MKELSGIYPDLLGKDGKAIALSDAKRKAIEQETKANEVLLKANKLSRDGKLSADQDAMLS
STRKTMRVIEDIKKEIAALNVLQKALQDTYNKAMESMKGGDPNSYTYGMKAARAGTLLGQ
AQFKTSNYTSELDALQNSLNTNIGKIDSFSTAIENSSKSTSSNTKATKENNAEKEKSIWI
TDKYKQKLEELNLAIEKQQKLQSKYPEWSKEYKKSLESQIKLEKEKLALQQKQAKAIQSQ
IASGKIQQTGSVSSPSTSNGKINGYSGKITSGYGERSDNHRGVDIAMPKGTRVDAPASGT
VIKAGSATSETNGKKMDWTYGNLVVIEDKNGIRHLLAHLDSTLVKVGDQVEAGTQIGKSG
SSGHSTGPHLHYEQNNSKGQTINPTATLNSIRSGNGTVTSSASSQQAVVWNYFKNKGLND
KAIAGLMGNIQQESGFNSSAVNKSSGASGIFQWLGGRKTGLQDYAKSVGKSWTDMQVQLD
YAWKELQSTEKKSLASLQRNDLSSSQHASEFERLFERSGGSAVGKRQDYANQYYNQFAGT
NGGAGIGIDTSQQAIDQAKSDLLSLQGDALNTQSIIDNLNEELVKSNLAYYDHLIDGVDR
SIQMSNILASQQSEHSKAYRDELEKETKHLKYKQTLLHNEANFIRNQLKRKDLSPALKGE
LTTQLSELSLAWWDVAESIKDVNEKIQNSKVESYIAKYDELRQIQDKTISYEKAKLEELD
TSSARYVKTLASINNAMREKQNSNRYELTQLTALINKNELQGDALEYAKNRIEELTLSIK
ELQIEIQDGDYDILINIKTQSDEKIGIMESAINQAEAIRKMFDEGSADYVKYTKVILAEY
EKMAKQHLATRDALVAELQQRDVKAERIKEINKLMAEEHLAYVNATLSIKEYTKQVEEAN
KSQLESVADKAINAYKEYIQERRDEHIKTLDDEIKHENEKHEQIMKNLNDEMDLFRKNVE
DKLRLIDRQEAQRSYDMEISDLEKERNNVQSQFDELALDNSHEGKAKRKKLKEQLDEIDK
QIEEKRHSREVELRKESLNDALEAKEEEVNEKIELQDKEHENVINKINREKEYWEKHYKD
LLNDERKFAEMREAILSGHFEKIDAEFQEYVQKMINTMPLLEDSLDGTMVAVGTSIRQNV
IDNLNEALKLIDEFNDSQKASDNGSFNFNPYDGNQVQTSNGNLSQGDLQVLLGKFLFDNV
APNTSGSEKDNIRQMAEKLAEQGRKNGSTQFTKDDVNFNDSIKGLTQADMDALYEYFDSS
KGMLGGNYDSFIEQFISSISGNKHESTNDGSLSKADMQVMLGKFIYEKLVPDTSLSANTK
TALKAKADGVAKQGRNGGSKISENVTFDAIKSTYTSGQVNQMKSFFDSNLGMIDNAKTRE
LMQRKIASLDTGGFMNWNGTGIDGKGGKAIIAHPNEIMLNKVDTKGFFDSINVMDKVMSN
LSPFLSKFAPAQKTSPVVSGDTYGDIKINFNIDKMNGDKNDLSRFNKMIDDDLLRRKGVR
K
NT seq
6486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagcattattagatgatttaggttctgcaaaatcaatgtacagagacatgtacgaa
acatctaagaatagttccggaagtgcaatgcgagaaaatgaaatttacatgcgttcactc
gaagcacgaattgcattgacacgagttgaatttgaaaagttagcagtatcaataggagac
gcctttctcacagatggcatggtgacatttcttcaattagcttcaggtggattaggtact
ataactagtcttgtaaatggagttgggttactccctatcgttttaggcactgcaggtatg
gcaacattcgctttatctaataactttagaacattaagcgctaacgttggcagctctatt
atttcattgcttggatttagaggtgctgcaacagctactaccactgcaactaatcttttg
acagcgacatctagaggattagaagtggcatggaaaggtttaggtatagcgtttaaaggg
ttcatatcttctttaggcgtaggattgcctttagttgccattggctttgttattgaaaaa
ctaatgagtaagatgggcgaagctcgtcaaaaagctgaagagttagaatctgctaataaa
gaaatgcttaattcgtatagtcaaaatgctacagatattgatgagttatcaaagaaatat
gaagaactagagaaaaaaatggcattatctaatgtcgactctaaaactattaatgaatat
cgggatatccaaaatgaaattggcacaaagctcccttctttggttactggtgaagattcc
tacggtaataaattaataggtacaagtgacgcacttaaagttaagattgacttactcaaa
caacaattagagatagataaacaaatagctgatgctgaagcaaataagaagagaaatgaa
gatatcgatacttataattcagatatgaactcagctaaagacaaaatgcaaggacgttta
caggtattagcaaattatgatgataactctttaaagtgggctaaaaaactcgatgtacca
aaagacgttgtaattagacttgttaatgatgaaggcgaaccattatataaaactgctgac
gaagttgctaaaaaattagatgaagttaaaactaagcacctcgaagctaaaaattcaggc
aacgatggtttagtagagtactacagtaaattattattcatgctagaagagacatataaa
gctgtattaccacatgaacttgagatgaataagtcaactgctaacctaaaaacgcaatat
atagcatcattaaatgccatgattagtacaaattcatcattgcaagactctacaaaagaa
atggctcaagttttctcatcacaactactttcaatgtctgattctagtaacattaatgat
ctaaaaaatggtttagaaacactattctcctataacggtaatgacgagttatctagtaaa
gcaaatgagataactgctaatatttctaaatcattcagtgatatggctaatgctacagaa
gaagattttggaaaaacatcaacaaatgttaaagctatgttggatggtcttccaaagctt
ttaaaagatgttattaaagacgaagaagacagaaaagctgtaatggatttgcttaacaag
acatatgaaaatgcagttgtacagcatgagaaaatagcgaaagctgcaaaagaaagtgga
ataagttttgaacaagctgcagctaacgcagttgagttcggtgaaggcgcagaacaatca
ggtaacgcagtatcagaactagcctcaaaaatgagcgaattcaaagatgtaactgaacaa
atggcaggagtatctcaatcaggagttgatgcattaaacgacttaatatggcagtacgac
acactatccaatcaattagcaggctatacagaacaacaacttcaagatatctatgttaaa
gaaaatttaactgcagaagaacgctcagttaaaaaagtcttagatgatcgtgtagctata
atgaaggaactgtcagggatataccctgatttacttggtaaagatggtaaagctattgcc
ctatcggatgcgaaacgtaaagctattgaacaagaaactaaagctaatgaggttcttctt
aaagcaaataagctttctcgcgacggtaaactgagtgcagaccaagacgcaatgttatct
agtactagaaaaactatgcgtgtaatagaagatataaaaaaagaaatcgcagccttaaat
gttttacaaaaagctttacaggatacgtacaataaagctatggaaagcatgaaaggtgga
gacccaaacagttatacttacggtatgaaggctgctcgagcaggtacattacttggtcaa
gctcaatttaaaacaagtaattatacatctgaattagatgctctgcaaaattcattaaat
actaacatcggtaaaattgatagtttctctactgccattgaaaactcttctaagtctact
agcagtaatactaaagctacaaaagagaacaatgctgaaaaagaaaaatccatttggatt
actgataagtataagcaaaaattagaagaacttaatttagcaattgaaaagcagcaaaag
ttacaatctaagtatcccgaatggtctaaagaatataagaaatcactagaatctcaaatt
aagcttgagaaggaaaagctagcattacaacaaaagcaagctaaagctatacaatctcaa
attgcttcaggtaagattcagcaaactggtagcgtttcaagtccatctacttcgaacggt
aagattaatggatatagtggtaaaattacttctggttatggagaacgttcagataatcat
cgtggcgtagatattgctatgcctaaaggtactcgtgtagatgctcctgcgtctggtaca
gtcatcaaagcaggttcagcaacatcagaaacaaatggcaagaagatggactggacttac
ggcaacttagtagttattgaagataaaaatggaattagacatttactagcacacttagat
agcactctagtaaaagttggcgatcaagtagaagcaggaactcaaatcggtaagtctggt
agctctggtcattctacaggaccccacttacactacgaacaaaataattctaaaggtcaa
acaattaatcctactgctactttaaattctattcgttctggtaatggtacggtaacctcc
tctgcttctagtcaacaagctgtagtttggaattatttcaaaaataaaggtttaaatgat
aaagctatcgcaggacttatgggtaatattcaacaggaatcaggctttaattcaagtgct
gtcaataagtcttcaggagcgtcaggtattttccaatggctaggtgggcgtaaaacagga
ctacaagattacgctaaatcagtaggtaaatcttggactgatatgcaagttcaattggac
tatgcttggaaagagttgcaatctactgagaaaaagtctttagcatctttacaaagaaat
gatttatcatcttcccaacatgcatctgaatttgagagattatttgaacgttctggtggt
tctgctgttggtaaacgtcaagactatgctaaccaatattataatcaatttgcaggcact
aatggcggtgcaggaattggtattgatacttctcagcaggctattgaccaagctaaatca
gatttactgtcactacagggagacgctctcaatactcaatctatcattgataatttgaat
gaagaattagttaaatctaatctcgcatattacgatcatcttattgatggcgtagaccgt
tctattcagatgtctaatattctcgcatctcaacaatcggagcattcaaaggcgtatcgg
gatgagttagaaaaagaaactaagcatctaaagtataagcaaactttactgcataacgaa
gctaactttattcgtaatcaacttaaacgtaaagatttgtcccctgctttaaaaggtgaa
ttgactactcaactaagtgaattatcattggcttggtgggatgttgctgaaagcataaaa
gatgtaaatgagaagattcaaaatagtaaagttgaatcatacatcgcaaagtatgatgag
ttacgtcaaatacaagataagactattagctatgaaaaagctaaacttgaagaattggat
acttcttccgctagatatgtgaaaactcttgcaagtataaacaatgcgatgagagaaaaa
caaaactctaatcgctacgaattaactcaattaactgctctaataaacaaaaatgagttg
caaggtgacgctttagagtatgctaaaaaccgtatagaagaattgacactaagtattaaa
gaattacagattgaaattcaagatggagattatgatattttaattaatattaaaactcaa
tctgatgaaaaaattggcataatggaatctgcaattaatcaagctgaagcaattcgtaaa
atgtttgatgaaggctctgctgattacgtcaaatatacgaaagttattcttgcagaatat
gaaaaaatggctaaacagcatttagcaactagagacgctttagttgcagaattacagcag
cgtgatgttaaggctgaacgtattaaggaaattaacaagctaatggcagaggaacatcta
gcttatgtaaatgctaccctatccatcaaagagtatacaaaacaagttgaggaagctaat
aaatcgcaacttgaaagtgttgcagataaagctatcaatgcatataaagaatacattcaa
gagcgtagagatgagcatataaagactcttgatgatgaaattaagcatgaaaatgaaaag
cacgagcaaatcatgaaaaatcttaatgatgaaatggatttgtttagaaagaacgttgaa
gataagctaagacttattgatcgtcaagaagctcaacgaagttatgacatggaaatttca
gacttagaaaaagagcgtaataatgttcaaagccaatttgacgaattagctttagataat
tcacatgaaggtaaagctaaacgtaaaaagttaaaagaacaattagatgaaattgacaag
caaattgaagaaaaacgtcatagtcgtgaagtcgaattacgtaaagaatctttaaacgat
gccttagaagctaaagaagaagaagtaaatgaaaaaattgaacttcaagataaagagcac
gaaaatgtaatcaataagattaatcgtgaaaaagaatattgggagaagcattacaaagat
ttacttaatgatgaacgaaaatttgccgaaatgagagaggcaattctttctggtcatttt
gagaaaattgatgctgaatttcaagaatatgttcaaaaaatgattaatactatgccactt
ttagaagattctctagacggtactatggtagctgtcggaacttctattagacaaaatgta
attgataatttaaacgaagcacttaaattaattgatgaatttaatgatagtcaaaaagca
tctgataatggttcattcaacttcaatccttatgacggtaatcaagttcaaacatctaat
ggcaatctatctcagggtgatttacaagtattattaggtaaattcttatttgacaacgtt
gctcctaacacatctggcagtgaaaaagataatattcgtcaaatggcagaaaaattggct
gagcaaggtcgaaaaaatggcagcactcaattcactaaagatgacgttaattttaatgat
tccattaaaggtcttactcaagccgatatggacgctttatatgaatactttgatagtagt
aaaggaatgttaggcggtaattatgatagttttattgagcagtttataagtagtatttct
ggcaataaacatgaatctacgaatgatggaagtttatctaaagcagatatgcaagttatg
ctaggtaaatttatttatgaaaaattagtacctgatacatcgttgagcgctaatactaaa
acagcattaaaagcaaaagctgacggcgttgccaaacaaggtcgaaacggtggttcaaag
atttcagaaaatgtgacattcgatgctataaagagtacatacacttctggacaagtcaat
caaatgaagtcattctttgactccaatttaggtatgattgataatgctaaaactagagag
ctaatgcaaagaaagatagcttcgcttgatactggtggatttatgaattggaatggaaca
ggtatcgatggtaaaggtggtaaagccatcatagctcatccaaatgaaattatgttgaat
aaagttgataccaaaggattctttgattcaattaatgtaatggataaggtcatgagcaac
ctatcccctttcctatcaaaattcgcacctgcacaaaaaacatctcctgttgttagtgga
gatacatatggtgacatcaaaataaacttcaatattgataaaatgaatggtgacaaaaat
gacttaagtcgattcaataaaatgattgacgatgatttattacgtagaaaaggagtgaga
aagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
