Lactobacillus amylovorus 30SC: LAC30SC_02600
Help
Entry
LAC30SC_02600 CDS
T01436
Name
(GenBank) PrtP precursor
KO
K01361
lactocepin [EC:
3.4.21.96
]
Organism
lai
Lactobacillus amylovorus 30SC
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lai00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
lai01002
]
LAC30SC_02600
09182 Protein families: genetic information processing
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
lai03110
]
LAC30SC_02600
Enzymes [BR:
lai01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.21 Serine endopeptidases
3.4.21.96 lactocepin
LAC30SC_02600
Peptidases and inhibitors [BR:
lai01002
]
Serine peptidases
Family S8: subtilisin family
LAC30SC_02600
Chaperones and folding catalysts [BR:
lai03110
]
Intramolecular chaperones
Subtilisin family
LAC30SC_02600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
SlpA
fn3_5
AIF-MLS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ06696
UniProt:
F0TJ39
LinkDB
All DBs
Position
532474..537471
Genome browser
AA seq
1665 aa
AA seq
DB search
MSNYSWPKGHNKYYYVFKTREDLNKIETQRRARGVLNMRKKWVATAIIALASGSTVLLSQ
ANSAQAATENPTVSNVKVSVVENENDSQNSNNTNQETNQEDTQAENADQNKVQAQNEQSA
VQSQKNQDTAQSQDQQTQVVQDNKQSVPEPANQADHVKGNVQSAWNQGYRGQNTVVAVID
SGADPSHKDFQTMPSDPKLKKDDVQKKIDQQGYGKYVNEKFPYVYNYADRDNDYITSDDT
NPNDSPHGQHVSGIIAADGHPDGNNQYVVGVAPEAQLMQLRVFGQFSDEKTDDVARAIYD
ATNLGADVIQMSLGQGVADQQLTNIEQKAVQYAIDHGVFVSISASNNGNSASVDNPSNIT
VRGYNSGSEAGNYEPLNSGTVANPGASKNALTVAAETSDTGADSDMAYFSSWGPLSDFSL
KPDLAAPGYQVVSTVNNNQYQTMSGTSMAGPFAAGSAALVIQRLKKTNPELKGAQLVAAT
KALLMNSAKIQTQKGYTTPVSPRRQGAGQIDVGAATANPVYVTTPDGTSSLSLRQVGEKT
ALTLTFHNLTDEAQTYTFDDLGGGYTEKRDEDTGVFYDVQLAGAHVNGQNSFTLAPKEVK
DFQYTLDLQGLTKNQPVEGWLHFTNDKDKSTVVVPYLAYYGDLTSENVFDQNANEDKPDV
QGNRLVNENNYPLGVADQESLKQLVNIDGNYDWQEVAKLYESGKVAFSPNNDHQSDLIKP
YAYLKQNVKDLKVEILDAKGNVVRVVSDIQGVDKSYDENGVTKDASLSVSMRDNPDAFEW
DGKVYDTKTGQMVTAPDGKYTYRFVATLWNEGPNQKQTADFPVEVDTQAPNLNVKYDAAS
HTLSGNYEDAGAGFTNYSYATVKVNDKVFGYKLNDGESGFDNNIKTKGHFNFVLSPDTLA
ALSGSLNKVSVALSDVANNTTVQTVDVAGVKDKPAVSVWNATDGLEFDKNSADYNKENNT
YTLYGSANKDFYLNGKLVQVHDGKYEVPVKADDTELVFSSDQAGKNVLKSFTPFTPQAFF
NWQNVDGFDGNFGVSIYSVETNDPKDAVVQAAVPKGNNVKAYAQDYFTGELYEGKVENGV
ATFHVHTSINKGKDGIFRRALLTGWTEVSGPAYNDKQVTSKDGVASSNHLGVYYTTDKVD
RKLYTNRDDLGVDVKDEAADVSAFSPTAYPGHALSDLTTRTDPNPAIHFDYLNDNNTTRF
GQNAVTMGYYDPATKKFTVTGHVDSDVKSLTVLADSSDENAPQNQVKLDKDGKFSFTFTA
ENVGQRPVAYIYTDENGQKVRGTLNIILDTVVPTLNVDQVNGNELHVKTNNPVFKLAGVV
NDNLDGYRLYVNGDNIYREFLNSGYNKLAGLNTDNEDVNPYGPHNFEESFNLNDDNNQPT
THVFTVYVVDQVGNKVEKKITVDYDPNYVAEVPKSDQDNNQTTVPGVVPNNNQSVVSVSD
TTSTVLDKNGEKKNDLSDAVLTTKSFPLLHNAYLYDENGEVVLTSNPNKKSSLKKGQTIS
ALQNGHVYVIKGVKFYQVGKNQYVKVANTVLQAGKRLQLKHNAFVYDAEGNVVKKHGKKV
VLNKNKWISALNNADKFTVKGVQYYKLGDNQFVKVANTVVQPAKKLKLTRNAFVYDQNGK
RVKNAKLLKKGTNILALNNAEKFRFNNKTYYQIGKNQYVKVANTL
NT seq
4998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaattatagctggccaaaaggtcacaacaagtactattatgttttcaagacaagg
gaggacttaaataagattgaaacacaaagacgcgctagaggtgtcttgaacatgcgaaag
aaatgggtggctacagctattattgctttagcatctggatcgacagttttattaagtcaa
gcaaattctgctcaggctgcaactgagaatccaacagtatcaaatgttaaagtctctgtg
gttgaaaatgaaaatgactcacagaattctaataatactaatcaagagactaaccaagaa
gatactcaagctgagaacgctgatcaaaataaggttcaagctcaaaatgagcaaagtgca
gtacagtcgcaaaaaaatcaagatactgctcagtctcaggatcaacaaactcaggttgta
caagacaataagcaatcagtacctgaaccagctaatcaagctgatcacgtgaagggaaat
gtgcaatcggcgtggaatcagggttatagaggtcaaaatacagtagtagctgtaattgat
tctggtgcagatcctagtcataaagattttcaaacgatgccatctgatcccaaactaaaa
aaggacgatgtgcaaaagaagattgatcagcaaggttacggaaaatatgtgaatgagaaa
tttccatatgtttataattatgctgatagagataatgattacattacctctgatgataca
aatccaaatgatagtcctcacggtcaacacgtatcaggaattattgcagcagatgggcat
cctgatggaaataaccagtatgtagtcggggttgctccagaagctcaattaatgcaattg
agagttttcggtcaattttctgacgaaaaaactgacgatgttgcaagagcaatttatgat
gctactaatttaggcgcggatgtcattcagatgtctttaggtcaaggagtggctgaccaa
caattgactaacattgaacaaaaggcggttcaatatgctatagatcacggagtttttgtt
tcaatttctgcatccaacaacggtaactcagcttcggttgataacccaagtaatattact
gtgagaggttataattcaggctctgaagctggaaactatgagccacttaattctggtact
gtcgccaatcctggggcctcgaagaatgctttaactgtggcagctgaaacttcagacact
ggtgcagatagcgatatggcttacttctcatcatggggacctctgtcagattttagttta
aagccagatttagccgcaccaggttatcaggttgtttcaactgtgaataataatcagtat
caaacgatgagcggtacctcaatggctggaccttttgctgccggaagtgcagccttggta
attcagcgtttgaagaaaaccaatcctgaattaaaaggtgcccaacttgtagctgccact
aaggctttattgatgaacagtgcaaagattcaaactcaaaaaggctatactacaccagtt
tctccaagaagacagggagcaggacaaattgatgttggtgccgctactgctaatccggtt
tatgtaacaacaccagatggcaccagttctttatctctacgtcaagttggtgaaaaaaca
gctttaactcttactttccataatttaactgatgaagcacaaacgtacacttttgatgat
ttaggtggaggttataccgaaaagcgtgacgaagatactggagtcttttatgatgttcaa
ctggctggtgctcatgtaaatggccaaaatagttttactttagctccaaaagaagttaaa
gattttcaatatactttggatttacaaggtttaactaagaatcagccagtagaaggttgg
cttcactttactaatgacaaagataaatcgacagtggttgtaccatatttagcttactat
ggtgatctaactagtgaaaatgtctttgatcaaaatgctaatgaagacaagccggatgtt
caaggtaatcgtttagttaatgaaaataattacccacttggcgtagctgatcaggaatcc
ttgaagcagttagtaaatatcgatggtaattatgattggcaagaagttgctaaattgtat
gaaagtggtaaggtagctttttcaccgaataatgatcaccaaagtgatctcatcaagcca
tatgcttacttgaagcaaaatgtaaaagatctcaaggttgagattttagatgcaaaaggt
aatgtagttcgtgtggtatctgacattcaaggtgttgataagtcctatgatgaaaatggt
gtaactaaagatgccagtctttcagtttcaatgcgtgataatcctgatgcttttgaatgg
gacggaaaggtttatgatactaagactggtcaaatggtaacagctcctgatggaaagtat
acttaccgttttgtagccactttatggaatgaaggtccaaatcaaaagcaaactgcggac
tttccagttgaagttgatactcaagctcctaacttaaatgttaaatatgatgcagcatct
catactttatcaggcaattatgaagatgcaggtgctggatttacaaattattcatatgca
acagttaaggtaaatgataaggtctttggctataagttaaatgatggtgagtctggtttt
gacaataatataaaaactaagggacactttaattttgtcctaagtccagataccttagct
gcattgagcggaagtttgaataaagtatctgttgcattgagcgatgttgcaaacaatact
actgttcaaactgttgatgtagcaggagttaaagataaaccagcagtttctgtttggaat
gcaactgatggtttagaatttgataaaaattcagccgattataataaggaaaataatacc
tatactttgtatggctcagctaataaagacttttacttaaatggtaaattagttcaggtt
catgatggaaaatatgaagtacctgttaaagcagacgatacggaattagtattttcaagt
gatcaagctggtaaaaatgttttgaaatcatttactccattcactccacaagcattcttc
aattggcaaaatgttgatggctttgatggtaactttggtgtaagtatctactcagttgaa
actaatgatccaaaagatgcagttgtccaagcagctgtaccaaagggcaacaatgttaaa
gcttatgctcaagattactttactggtgaattatatgaagggaaagtagaaaatggtgta
gctactttccatgttcatacttcaatcaataaaggaaaagatggtatctttaggcgtgcg
cttttaactggttggactgaagttagcggtccagcttataatgataaacaagttaccagt
aaggatggtgtagctagttcaaatcacttaggtgtttactacaccaccgataaagttgac
agaaagctttacactaatcgtgatgatttaggggtagatgtaaaagatgaagcagctgat
gttagtgcatttagcccaactgcatatccaggacatgctttatctgatttaactacgcgc
actgatcctaacccagcaatccattttgattatttaaacgataacaatactactcgtttt
ggtcaaaacgcagtaactatgggttactacgatcctgcaactaagaagtttacggttacc
ggtcacgttgattctgatgtcaaatcattgactgtattagctgatagttcagatgaaaat
gccccacaaaatcaagttaaactagataaagatggtaaattcagctttacctttaccgca
gaaaatgtcggtcaacgtccagttgcatatatctacactgatgaaaacggacaaaaggtt
cgcggtactttaaatatcattttagatactgtggtaccaactttaaatgttgatcaagtt
aatggaaatgaacttcatgttaagaccaataaccctgtctttaaacttgcaggggttgtc
aacgataatttggatggttacagactctatgtaaatggagataatatctatcgtgaattc
ttaaattcaggctacaataaattggccggcttgaatactgataatgaagatgtaaatcca
tatggaccacataattttgaagaaagtttcaatttaaatgatgataataatcaaccaaca
actcatgtatttactgtttacgtggttgatcaagtaggtaataaggttgaaaagaagatt
actgttgattatgatccaaattatgtggcagaagttccaaaatccgatcaagataataac
caaactacagtacctggagtagttccaaacaataatcaatctgtagtttcagtttcagat
actacttcaactgttttagataaaaatggagaaaagaagaatgatttaagcgatgctgtc
ttaactacaaaatcattcccacttcttcacaatgcttacttatatgatgaaaacggtgaa
gttgttttaaccagcaacccaaacaagaagtcaagtttgaagaaaggacaaacaattagc
gcccttcaaaatggtcatgtttatgtcatcaaaggcgtaaaattctatcaagttggtaag
aatcaatatgtaaaagttgccaatactgttttacaagccggtaagagattgcaattgaaa
cataatgcttttgtttatgatgctgagggtaatgtggttaagaaacatggcaagaaagtt
gttctaaataagaacaagtggatctccgctttaaataatgctgataaatttacggttaaa
ggagtccaatactataaacttggtgataatcaatttgtaaaggttgctaatactgttgtt
caaccagctaaaaagcttaagttgacacgtaatgcttttgtctatgatcaaaatggaaaa
cgtgtgaaaaatgctaaacttttaaagaagggaacaaatatcttagctttaaataatgct
gaaaagtttagatttaataataagacttattatcaaattggtaagaaccaatatgtaaaa
gtggctaacacactataa
DBGET
integrated database retrieval system
