Lingula anatina: 106157605
Help
Entry
106157605 CDS
T04921
Name
(RefSeq) protein transport protein Sec24C isoform X1
KO
K14007
protein transport protein SEC24
Organism
lak
Lingula anatina
Pathway
lak04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lak00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
106157605
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
lak04131
]
106157605
Membrane trafficking [BR:
lak04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Forward pathways
Coat protein complex II (COP-II)
106157605
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sec23_trunk
Sec23_helical
Sec23_BS
zf-Sec23_Sec24
Gelsolin
DUF6331
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106157605
NCBI-ProteinID:
XP_013388768
UniProt:
A0A1S3HRV5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1186 aa
AA seq
DB search
MNPQFMDPGQGGYGQGPPHGYGGPPQQGYGMPPQGGPSMGQRPPGPPGQGMYNGNVSQHG
PSGHLGPPASKAGMPPQPGYGSPGPVQNGPGLGPQGDQFSQRASPMHRPPGPSQFQAGPP
GQHGTGQRGPPPSGVINQLPNQMASMNIGGGPPRGGMQPPGMQQPLGSPGQRPPMQGAQQ
HQMGPPPPTSMGMGAPPTSMGMGAPPSSMGMGAPPTSMGMGAPPTSMGMGAPPTSMGMGA
PPTSMGMGAPPTSMGMGAPPTSMGMGAPPTSMGMGAPPTSMGHPPPMGMGAPPSSMGNQP
GMGAPPTSYGMPPSSMQNQMPPPPGHNAMGGGMSGGPPMGMSGPPPRGMPSGQGPPMGQY
GQQGAMGQSGYAGAPVPHPGMHQQPGYPGQHPGMNMGMSQPQQPRRLDPDQMPSPIQVIT
DDQKANSGVFQTAQRGTVPPLVTTEFVTQDQGNANPRFIRSVMYNIPCTNDMIKQCHIPI
ALTISPFARLQPGELPPPLVDLGEMGPVRCKRCKAYMCPYMQYIEGGRRFQCVFCGAATD
VPPEYFAHLDHTGRRVDCYDRPELCLGSYEMVATKEYCKNGVFPKPPAYIFMLDVSYNSV
KSGLVELLCSRLKNDILVNLPKETGAAESEIRVGFVTYDKVLHFYNVKGALAQPQMLVVS
DVNDVFLPLLDGFLVKLSESEAVIDTLLAQIPQLFADTRETEICLGPVIQAGLDALKAAD
CAGKLFVFHTSLPIAEAPGKLRNRDDRKLLGTDKEKTILAPHDNFYTKLGVDCVSAGCGV
DLFLFPNSYIDVASIGEVCRLTGGQVYMYKYFQCEDPKLGDLDGERFMSDLKNNINRPVG
FDAIMRVRTSTGIRPVDFWGNFYMSNTTDVELATVDTDKAISVEIKHDDKLNEEEGAYVQ
VALLYTSINGQRRLRIHNLSMNCCTQLADVFRSCELDTLISVLSKKAVKDALSVPPAEVR
EKLINSCAQILACYRKNCASPSSAGQLILPECMKLLPCYANCLIKSDAVQAGGDVSTDDR
SYMMHLVSSMPVSASHVFFYPRLMPLHDLDVDSTSMPPLVRCSAERLKDTGVYILENGLS
MFMWIGMNANPDWIHKVFGVQSAAQVDIDKGQLLELDNPMSIRVRGIIAKINQERHRNMK
LTVVRQRDKLEPWFMHYMVEDKGSNGTSSYVDFLCHIHKEIRNLLS
NT seq
3561 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacccccagtttatggatccaggccaaggaggttatggccaagggcctccacatgga
tatggaggccccccacaacaaggatatggtatgccaccccaggggggtccaagtatggga
cagagacccccaggtcccccagggcaagggatgtataatggaaatgtctcacaacatggt
ccatcaggccatttaggtcctcctgcaagcaaagctgggatgcccccacaaccagggtat
ggtagcccaggtccagtacaaaatggacctggtttaggaccccagggggatcagttctct
cagagagcttctccaatgcatcgtccacctggtcctagtcagtttcaagctggtccacct
ggtcagcatggaactggacaaaggggaccaccgccctctggtgtaataaatcagctcccg
aatcaaatggcatcaatgaatataggaggtggaccacctaggggaggcatgcaaccacct
ggcatgcagcaaccattaggctcacctgggcaaagacccccaatgcagggagctcaacag
caccagatggggcccccaccacctacatccatgggcatgggggcaccacccacatccatg
ggcatgggtgcaccaccttcatccatgggaatgggtgcaccacctacatccatgggcatg
ggagcaccacctacatccatgggtatgggagcaccccccacatccatgggcatgggggca
ccccccacttcaatgggcatgggtgcaccacccacttcaatgggcatgggtgcaccaccc
acttcaatgggcatgggtgcaccacccacttcaatgggcatgggagcacctccaacatca
atgggacatccaccacctatgggcatgggagcaccacccagctcaatgggcaatcaacca
ggcatgggagcaccacctacttcttatggcatgcctccctcatctatgcaaaaccaaatg
cccccaccaccaggacataatgctatgggtgggggtatgtcgggtggccctcctatggga
atgtctgggcctccacccaggggaatgccctctggacagggtccacccatgggccagtat
ggtcagcagggtgctatgggtcagtccggatatgctggcgctccagttcctcatccaggc
atgcaccagcagcctgggtaccccgggcagcaccctggcatgaacatgggcatgtcacag
ccacagcagccacgcagactagatccagaccagatgcctagtccaattcaggtgatcaca
gatgatcagaaggctaacagtggggtattccagacagcacagaggggaacagtgccaccc
ctggtcacaacagaatttgtaacacaggatcaaggcaatgccaatccacgttttatacgt
tcagtaatgtacaatatcccttgcacaaatgacatgataaagcagtgccatatacctatt
gccttaacaataagtccttttgcaagacttcagccaggggagctgccccctcctcttgtg
gatcttggtgagatgggtcctgtcaggtgtaagagatgtaaagcatatatgtgcccctac
atgcagtatatcgagggtggcaggagattccagtgcgtcttctgtggagctgcaactgat
gtgccacctgagtattttgctcatctagaccacacaggcaggagagtagactgctatgac
agaccagagctctgcttaggttcttatgaaatggttgccaccaaggagtattgcaagaat
ggagttttcccaaaaccacctgcctatatcttcatgctagatgtctcctacaacagtgtt
aaaagtggtctggtggagctcctctgttctagactgaaaaatgacattttagtcaactta
ccgaaagaaactggtgctgctgaatctgaaattagagtaggttttgtaacctatgacaaa
gttcttcacttttataatgtcaagggtgctctggctcagccccagatgctggtggtgtca
gatgtgaatgatgtgttcctacccctccttgatggcttcctagtcaaattatctgagtct
gaagctgtcattgacaccctccttgcccagatccctcagctgtttgctgacaccagagag
acagagatttgtcttggccctgtgatacaggctggtctggatgccctgaaggctgccgac
tgtgctgggaaactgtttgtctttcacacttcattgccaatagctgaggcccctggcaag
ctcaggaacagagatgacagaaaacttctgggcactgataaagaaaagactatcttagct
ccccacgacaatttctacaccaagttaggggtagactgtgtatcagctggctgtggggtg
gatctcttccttttccctaactcgtacatcgatgtagcgtcaataggagaagtatgccgt
ctaacaggaggccaggtgtacatgtataaatatttccagtgtgaggatccaaaactaggt
gaccttgatggtgagcgttttatgtccgacctcaagaacaatataaatcgtcctgtgggc
tttgatgccatcatgagagtaagaacaagtacaggtataaggcctgtagatttctggggc
aatttctacatgtcaaataccactgatgtggaactggccacagtagacactgataaggca
atcagtgtggagattaaacatgatgataaactcaatgaggaagaaggggcttatgttcaa
gtggctctgctgtacaccagcatcaatggccagaggcggctaaggatacacaatttgtct
atgaattgctgcacacagttggctgatgtcttcaggagctgtgagctggacacacttatc
agtgtgctgtccaaaaaagccgtcaaggatgccctgagtgtccccccagcagaggtcagg
gagaagttgatcaattcctgtgcacagatattggcctgttatcgtaagaactgtgccagc
ccctcctcagcagggcagctgatccttccagagtgcatgaaactcttgccttgttacgca
aactgtctaatcaaaagcgatgctgttcaggctggtggtgatgtgtccacagatgaccgc
agctacatgatgcacctggtcagttccatgccagtgtctgcctcacatgttttcttctat
cccagactcatgcctctgcatgaccttgatgtagattccaccagtatgccgcctttggtc
aggtgttccgcagagagactcaaggatactggagtgtacatactagagaatgggctgtct
atgtttatgtggattggtatgaatgctaacccagactggattcacaaggtgtttggggtg
cagtctgcagcccaagttgacatagataagggacagcttttggaacttgacaacccaatg
tccatcagggtccgtggtattattgccaaaattaaccaagagaggcataggaatatgaaa
ttaaccgttgttcgtcagagagacaagttagagccatggtttatgcactatatggtggaa
gacaagggatccaatggcacctcgtcttatgtagactttttatgtcacattcacaaagaa
attaggaacttgttgagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
