Leptotrichia alba: AB8B28_04045
Help
Entry
AB8B28_04045 CDS
T10903
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
lala Leptotrichia alba
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
VipD-like_C
BigA_beta
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDU63034
UniProt:
A0AB39V5D8
LinkDB
All DBs
Position
800005..803202
Genome browser
AA seq
1065 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3198 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system