Companilactobacillus alimentarius: LA20249_07830
Help
Entry
LA20249_07830 CDS
T05458
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03483
mannitol operon transcriptional activator
Organism
lali
Companilactobacillus alimentarius
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lali00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
lali03000
]
LA20249_07830
Transcription factors [BR:
lali03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
LA20249_07830
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
HTH_11
Mga
PTS_IIB
HTH_DeoR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUI72092
UniProt:
A0A2K9HQW2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1638303..1640420)
Genome browser
AA seq
705 aa
AA seq
DB search
MTKRFTQNETKLLKILINANSYQNINSLAEKMGFSKRSIYTFFRSISNKCLNLKIVPPRN
VYHQGYFLIDESKIKIQEILGDKRINKIGKLTSTKRRTIDLLLLFLNDQVTTKKIIRLED
VSKNTILSDLNILRNELKEHAIYLESNQKGHQLVGRELNIRDFCRSKFEQNSKLLEIFWR
QIQPSKIFSELLNLKSILHDWVKKIELDLEITYTDNMRLFFENYYSFVLYRMMNNKLLLS
KEFISDKSEIEDMKNNVEFKLIRTFIIQFGRNLADDTDECLYLESLLLEGQRGTQSILSR
GKVKNRIFNITGKIIKNFKNISGTIFKDETQLEHDLYGHLLATYYRVKYHHQYTDGDDQI
KNEYPDIYTYTRISIYPFEKLNGEKLHENEISLIAIYFGAQIIKENGTKKSALIVCSSGI
GTSRFLMAQLNNIFPSLKLIGPISENEYNSITKIKPDIVISTITLKKRNRDVITVNSILN
ESEINRLRKELAIHNIIFSKQSNNQLKSLLDVIADNAEINNISQLIIGLKEILTFDIDPK
PKIERGYQPMLSELIDLSRIQFSDTANFSWEEAIKRAAAPLLINGDISDSYIDAMIGSVN
KNGPYINIGSQVALAHARPEMGVKNLSMAVLKLNRPIDLVDSNHKIRLIFVLAAVDSTSH
LKALSELANILGDRKKLKQLLDSKNKNEFLNVILRSEENETSSSM
NT seq
2118 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgaaacgttttacacaaaatgaaacgaaactcctaaaaatattgataaatgccaat
agttatcaaaatattaattctttagctgagaagatgggattctctaaaagatctatttat
acattttttagaagtataagtaataaatgcctgaatttaaagatagttccaccaaggaat
gtttatcaccaaggatattttttaattgatgaaagtaagataaaaatacaagaaatactt
ggtgataaaagaataaataaaatcggaaaattaacgtcaaccaaaagaaggacaatagat
ttattattgttatttttgaatgatcaagtaacaacaaagaaaataattaggttggaagat
gttagtaaaaacacaattttatccgatttaaatattttaagaaatgaattgaaagaacat
gcaatttatctggaatctaatcaaaaaggtcatcaattggtgggtagagagctaaatata
agagatttttgtaggtctaaatttgaacaaaattcaaaattattagaaattttttggaga
caaatacagccgtcaaaaatattttcagaactccttaacttgaaatctatattgcatgat
tgggtaaagaaaatagaattggatttagaaattacttatacagataatatgagattattt
tttgaaaattattattcttttgttctttatagaatgatgaataataaattacttttatct
aaggaatttataagcgataaatctgaaatagaagatatgaagaataatgtggagtttaag
cttattcgtacctttataattcaatttggtcgaaatttagctgacgatactgacgaatgt
ttgtatcttgaaagtttattattggagggtcaaaggggtacgcaaagtattctttccaga
gggaaagtcaaaaatagaatttttaatattactggaaaaatcatcaaaaatttcaaaaat
atttctgggacgatttttaaagatgaaactcaactagagcatgatctgtatggacattta
ttggctacttattatcgggttaaatatcatcatcaatatactgatggagatgatcaaata
aagaatgaatatccagatatttacacttataccagaatttcaatttatccttttgaaaaa
ttgaatggtgaaaaattgcatgagaatgagatatctctaatagcaatatattttggagct
caaataattaaagaaaacggaactaagaagagtgctttaattgtttgttcaagtgggatt
ggaacatcgagattcttaatggcacaacttaataatatctttccaagtttaaaattgatt
ggtccaatttctgaaaatgaatataattctataacaaaaataaaacccgatattgtcatt
tcaactattactttgaagaaacgtaatcgtgatgttattacggtaaattcaatattaaat
gaatcagaaattaataggttaagaaaagaacttgctatacacaacattattttttcaaag
caatctaataatcaattaaagtcattactagatgtgatagctgataatgcagaaataaat
aatattagtcaattaattattggattaaaggaaatccttacatttgatattgatccaaaa
ccaaaaattgaaagggggtatcagccaatgttaagtgaacttatagatttgagcaggatt
caattttctgatacagcaaatttttcatgggaagaagcaattaaaagggcagctgctcca
ttattaattaatggtgatatatccgatagctatatagatgcgatgattggcagtgttaat
aagaatggtccttatataaatatagggagtcaggtggccttagctcatgctcgtcctgag
atgggtgttaagaatttaagtatggcagttttgaaattaaatagaccaattgatttagtg
gattcaaatcataagattcgattaatttttgttttagctgctgttgattcaacctcacat
ttaaaggctttgtcggagctagccaatattttaggagatagaaagaaattaaaacagtta
ttagattccaagaataaaaatgaatttttaaatgtaattttaaggagtgaagaaaatgaa
actagcagcagtatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
