Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_0245
Help
Entry
Lacal_0245 CDS
T01533
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
HATPase_c
PAS_9
PAS
HATPase_c_2
GRAM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH00098
UniProt:
F6GIQ0
LinkDB
All DBs
Position
278921..280420
Genome browser
AA seq
499 aa
AA seq
DB search
MPKNAQKNIISNEFQDEQFIDKIQHSLAVGSWEVNLKTNTLKWSEVTKKIHEVDSDYIPT
LDTGINFYKEGKHREHITTLFNNAVENCEGFDDEFIIITVNGNEKWVRSIGYPILEDNKC
VLVRGVFQDITEKTQKNIEITYKENLFRSFFEYSLTGLAIVGLKGQWLKVNKSTSNILGY
TEAEFLETNFMSITHEEDKHIGFKEVKLMVNNELDNFQADKRYIHKDGSTVHCQISVSIV
RDDNNKPLHFITNINNISKSKKAKAEIKNLLAISSKQNERLLNFAHIVSHNLRSHAGNLD
MLIGLKKEDYPESTNNEYFPHIEKAVKNLNETISNLNEVAIQNIIEIENLKSINLLQFTT
NAISNIKALRIANNANIEVFIDEKTSVKAIPAYLDSILINLLTNAIKYKSPDRDPEIELT
VKQIDTYMVLEIADNGMGIDLDRHGKKLFGMYNVFHKNKDAKGIGLFISKNQIESIGGKI
EVESTVGQGTKFKLFFKYE
NT seq
1500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcccaaaaacgcacaaaaaaatataatttctaatgaatttcaagacgaacaattcata
gataaaatacaacattcacttgcagttggttcttgggaagttaacctaaaaactaatact
ttaaaatggagtgaggtaaccaaaaaaattcatgaagttgatagcgattatatacctact
ctagataccggaatcaatttttataaagaaggtaaacatagagaacatattactacactt
tttaacaacgctgttgaaaattgtgaaggatttgatgatgaatttataattataactgta
aatggaaatgaaaaatgggtaagatctattggttaccctatattagaagataacaaatgc
gtgttggttagaggcgtttttcaagatataaccgaaaaaacccagaaaaatatagagatt
acgtataaagagaatttatttagatccttctttgaatattctcttactggattagccatt
gtaggtttaaaaggccaatggctaaaagtaaataaaagcacatctaatatattaggttat
acagaagctgaatttttagaaactaattttatgtctataactcatgaagaggataaacat
attggttttaaagaggtaaaacttatggtaaataatgagcttgacaattttcaagcagat
aaaagatatatccataaagacggtagcacagtacattgccaaatttcggtatctatcgta
agggacgacaataataaacctttacattttattaccaacatcaacaatatatctaaatct
aaaaaagctaaagcagaaataaaaaacttactagcaatctcttcaaaacaaaatgagcgc
ttattaaattttgcacatatcgtgtcgcataatttaagatctcatgctggtaatttagat
atgcttataggtttaaaaaaagaagattatccagaaagcactaataatgaatactttcct
catatagaaaaagctgtaaaaaatttaaatgaaacgatatcaaacttgaatgaggttgca
attcaaaatataattgaaatagagaatttaaagtctataaatttattgcagtttactaca
aacgcaattagtaatataaaagcattacgtatcgccaataatgctaacattgaagttttt
attgacgaaaaaacatctgtaaaagctatacctgcttatttagatagtattttaattaac
ttactaactaatgccattaagtacaaaagcccagatagagatccagagatagaattaact
gtaaaacaaattgacacctatatggttttagaaattgcagataatggtatgggaatagat
ttagatagacatggtaaaaaactatttggcatgtataacgtttttcataaaaacaaagat
gcaaaaggcataggattatttatctcaaaaaatcaaattgaatctattggcggtaaaatt
gaagtagaaagtacagttggacaaggcacaaaatttaaactcttttttaaatatgaatag
DBGET
integrated database retrieval system
