KEGG   Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_0915
Entry
Lacal_0915        CDS       T01533                                 
Name
(GenBank) Fibronectin type III domain protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
lan  Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
Pathway
lan02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lan00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    Lacal_0915
SSDB
Motif
Pfam: fn3 CHU_C Reelin_subrepeat-B GBD_T9SS_assoc Pur_ac_phosph_N Por_Secre_tail Ig_7
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEH00763
UniProt: F6GFJ9
LinkDB
Position
1062501..1068179
AA seq 1892 aa
MKKTTLLLVLLLISLSISAQTYLSENFDTNIPATWTVDDAGAATGDSWISGQVGGVNNLD
GTNAAFVDSDANGNGTLLIETLTSPTFDTTGATAIFLDFDQYYRNIGADTAVVEVWDGTA
WVPVLTQTTTAGAFSNPDQQHIDLTAYSNNAMQIRFVYDDADSWAWYWLVDNVIVYNATC
PNPDSFTFLSATSTTADISWTAGGTETAWEVAIQTPGTGMPTGSGTATTSNNPYVATGLT
PATNYEAYVRADCGGDFSIWVGPINFATECTTFVAPYTEGFENGGDIPLCWTMDGGEDWQ
FDNDPGFNHIGDNGTITGTTATNDYFAWVDSSGDDGPTTLTTPLVDVSTLATPALSFYEL
SDNEDNDNSQLDVEVWDGAAWNLMATYNTNTNGWEEKTINLSTLTITGDVQARFIFSETS
TGFYDDIAIDDVTFDELPSCVNPGNLAVDSATDTTATLSWMVNGTETAWEVAVQAPGTGI
PTGAGMAATTNPYTATGLTAATTYEYYVRANCGTEFSDWIGPLVFDTECAVFIAPYTEGF
ENGGIIPLCWTMDGGEDWEFANDPGFDHIGNNGVITGTTATNDYFAWVDSSGTDAPATLT
TPLIDVSGLAVPALSFYELSDNEGNDNSQLDVEVWDGAAWNLMATYNTNTNGWEEKTINL
STLTITGNVQARFIFSEVITPGDFYDDIAIDDVTFDELPSCVNPANLGVDSTTDTTATLS
WMVNGTETAWEVVVQSPGTGMPTGAGDPAATNPYTATGLTAITDYEYFVRADCGNGDFSD
WVGPFTFTTECSTFAAPYTEGFENGGTIPDCWTMNGGGIWEFANDPGFDHIGNNGTITGN
TATNDYFAWVDSSGDNGPTSLFSPLIDTTPLAEPALSFYLLSDNEGNANSQLDVEVWDGA
AWNPVGTYNTNTGGWEYIIINISTLNITGPVQVQFIFSEVIDPSDFYDDIAIDDVTIDEL
PPCLFPNTITTSNTTETSVDISWIPGASETAWEYVVQPVGTGTPTTNGTPATNTTVTETM
LSPGTAYEIYVRSDCNSTGDGFSDWTGPVIFYTLPENDDCEGAINFLANADGNCTNFTSG
SLSGATQSPQANPCSGTPNDDVWFSFTAVSTDHAISLSNIVGSTTFLSHGLYEGPDCNNL
TNLTCSTADNSTANGLTIGNTYYIRVFSNGSTPATTTFDLCVFSIPPPITTDITQYTVPE
LVEDILVNSPCSTISNVTSSTGTNFGSDNGIGYFEANGSGFPFESGIIMTTGNAVNAPGP
ETGTLSDGGGAGWPGDPDLEAEIMEGPTNNASIIEFDFVPFIEDMSFEFIFAAEEYGTFQ
CGFSDAFAFLLTDTVTGVTTNIAVIPGTTTPVSVFTIRDMAFNGSCPSSNAALFDAYYGP
GGQPALTNPTNFIGRTVPLTASSTVVPNRTYHIKLVIADDGDTAYDSAVFLKAGSFEIGE
VDLGEDILLSSGNANCEGDEVILDIGVPVGDNATITWYTINDNIQEAILDENGAPESGTT
LAVTETNNYIVEIVLNANASCFVIDDILVEFFPNPVLPDNLPDILGCDVDNTNQAIFDLT
ENENLITGTQTGLIITYYLTEQDAIDQTNAITNTTTYSSTPTTIYYNAADGTTSCDAVGS
FNIALAPKPQLAQADNILGCDDDEDGISNYDLTSNETVIANGNTGLTFSYHNNLADAEAS
TNAIAVPTDYDGGTQTIYVRAESNDGCFETATFDLDFGISPSISFDTDVLYEVCPNATSP
ISVTAIGDNFVESDVTITWYNEGVLVPGQTSLTINNVLTSGTYTIEVMFNQSGCTSSESI
FVDELETCVIPQGISPDGDGLNDNFDLSSFDVQSLQIFNRNGRMVYEKTNYKDEWHGQSL
DGDELPVGTYYYVMNYQGNKTKAAWVYINRAN
NT seq 5679 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaagactactttattattggttttacttctaataagtttatccataagtgcacaa
acttatttgagtgaaaatttcgacacaaacatacctgcaacatggacagttgatgatgca
ggagcagctactggagattcatggatttctggacaagttggaggtgttaacaatcttgat
ggcactaatgctgcttttgtagatagtgatgctaacggaaatggaacattacttattgaa
acccttacctctcctacttttgatactaccggagcaaccgcaatatttcttgattttgat
caatactatagaaatattggagcagacacagccgttgttgaagtttgggatggtactgca
tgggttcctgttttaactcaaacaacaacagcaggagcatttagtaatccagatcaacaa
catatagatcttacagcatattctaataatgcaatgcaaattcgctttgtttacgacgat
gcagattcttgggcttggtattggttagtagataatgttattgtttacaatgcaacttgt
ccaaatccagatagtttcacttttttaagtgcaacatcaacaacagcagatatttcatgg
acagccggaggaactgaaacagcttgggaggttgcaatacaaactcctggaactggaatg
ccaacaggttctggtacagcaactacttctaataatccttatgttgcaacaggattaaca
cctgcaactaattatgaagcttatgttcgtgcagattgtggtggtgattttagtatttgg
gttggaccaataaattttgctacagagtgcacaacgtttgtagcgccatatacagaaggt
tttgaaaatggtggagatattccattatgttggacaatggatggtggtgaagattggcag
tttgataatgaccctggttttaatcacattggagacaatggtacaattactggaacaaca
gcaactaacgattactttgcatgggtagactcttcaggagatgatgggccaacaacttta
accacgccattagttgacgtatctacattagcaacaccagctttatctttttatgaatta
agtgataacgaagataatgacaactctcaattagatgttgaggtttgggatggtgctgca
tggaatttaatggctacttataacaccaatacaaatggttgggaagaaaaaacaataaac
ttaagtacactaacaataactggagacgttcaagcacgatttattttctctgaaacatca
acaggattctatgatgatatcgcaatagacgatgttacttttgatgagttaccatcatgt
gtaaacccaggaaatttagctgttgatagtgcaacagatactacagctactttatcttgg
atggtaaatggaacagaaacagcatgggaagttgcagtacaggcaccaggaacaggaatt
cctactggagcaggaatggctgcaacaactaatccatacacagcaacaggtttaactgct
gctacaacttatgaatattatgtaagagcaaattgtggtacagaatttagtgattggatt
ggtcccttagtattcgatacagaatgtgccgtatttatcgctccttatactgaaggattt
gaaaacggaggaattataccattatgctggacgatggatggtggagaagattgggaattt
gctaatgatcctggatttgatcacattggaaacaatggtgtaattacaggcacaactgct
actaatgattattttgcctgggtagactcttctggaactgatgctccagcaacattaaca
acgcctcttatagacgtatctggtttagccgtacctgcattatcattttatgaattaagt
gataatgaaggaaatgacaactcacaattagatgtagaagtttgggatggtgctgcttgg
aatttaatggcaacttacaatacaaacactaatggttgggaagaaaaaacaataaactta
agtacacttacaattacaggaaatgtacaagcgagatttattttttcagaagtaattaca
ccaggagacttttatgatgatatcgcaatagacgatgtgactttcgatgaattaccaagt
tgtgtaaacccagctaatttaggtgttgacagtacaacagacactactgctactttatct
tggatggtaaatggaacagaaacagcgtgggaagttgttgttcaatctccaggaacagga
atgcctactggagctggagatcctgcagcaactaatccatacacagcaacaggtttaaca
gctattacagactatgaatattttgtaagagcagactgtgggaatggtgattttagtgat
tgggttggaccatttacttttacaacagaatgttcaacatttgcagctccttacacagaa
ggctttgaaaatggcggaacaataccagattgttggaccatgaatggtggtggaatttgg
gaatttgctaatgaccctggattcgaccatattggtaacaatggtactataacaggaaac
actgctacaaacgattattttgcttgggtagattcttcaggagacaatggacctacatca
ttattttctcccttaatagatacaactcctttagcagagccagcactatcattctactta
ttaagtgataatgaaggaaatgcaaattctcagttagacgttgaagtttgggatggtgcg
gcatggaatccagttggaacatataatacaaatactggcggatgggaatatattattatt
aatataagtacattaaatataactggacctgtacaagttcaatttatattctctgaagtt
attgacccaagtgatttctatgacgatattgcaattgatgatgttactatagatgagtta
cctccttgtttattccctaacacaattacaacatcgaataccacagaaacttctgtagac
atttcatggataccaggagcatctgaaacagcttgggaatatgttgtacagccagtagga
actggaacaccaacaacaaacggaacaccagcaacaaatacaactgttacagaaacaatg
ttatctcctggaacagcatacgaaatatatgtaaggtctgattgtaactctacaggagac
gggtttagtgattggacaggacctgtaatattttacacattaccagaaaatgatgactgc
gaaggcgctataaacttccttgctaatgcagatggtaactgtactaattttactagcgga
tctctttctggtgcaacacaatcaccacaagcaaacccttgtagtggaactcctaacgat
gatgtttggttttcatttactgctgtatctacagatcacgccataagccttagtaatatt
gtaggatctacaacatttttatctcatggattatatgaaggtccagattgcaacaactta
acaaatttaacttgtagtactgcagataatagtacagcaaatggtcttaccataggtaac
acctattatattagagtattttcaaatggctcaacaccagcaaccactacctttgattta
tgtgtgttttctattcctccaccaattactacagatataacacaatacactgttccagaa
ttagtcgaagacattttagtaaactcaccatgttctactatatctaatgttacatcatca
acaggaacaaattttggatctgataatggaattggatattttgaagctaatggttcagga
tttccttttgaaagtggaataataatgacaacaggaaacgctgtaaatgcaccaggacct
gaaaccggaactttaagtgatggtggtggagctggatggcctggagatcctgatttagaa
gcggaaataatggaaggcccaacaaacaatgcttcaattattgaatttgactttgtccct
tttatagaagacatgtcttttgagttcatttttgctgctgaagaatatggaactttccaa
tgtggattctcagatgcttttgctttccttcttacagataccgttacaggtgtaactact
aatattgctgttattcctggaacaacaactccagtatctgtatttactattagggatatg
gcatttaatggtagttgcccttcttcaaatgcagcattatttgatgcatactatggtcca
ggtggtcaacctgcattaacaaacccaacaaactttattggtagaactgtacctttaaca
gcatcatcaacagtagttccaaatagaacataccatattaaattagttattgccgatgat
ggagatacagcttatgattctgccgtattcttaaaagctggtagttttgagattggtgaa
gtagatttaggtgaagacattttactttcaagcggaaatgcaaactgtgaaggagatgaa
gttatattagatattggtgttcctgtaggagataatgctactattacatggtatactatt
aatgataacattcaagaagcaattcttgatgaaaatggagcaccagaaagcggcactact
ttagctgttacagaaacaaataattacatagtagaaattgtacttaacgctaacgcttct
tgttttgttatagatgatattttagtagagtttttccctaatccggttttaccagataat
ttacctgatattctgggttgtgatgtagataatactaatcaagctatttttgatttaaca
gaaaatgaaaaccttattacaggtacacaaactggtttaataattacttattatttaact
gaacaagacgctatagaccaaacaaatgctataactaatacaacaacatatagttctaca
ccaacaactatttattataatgctgcagatggaacaacaagttgtgatgctgtaggttct
tttaatatagctctagctccaaaaccacaattagctcaagcagataatatattaggttgt
gatgatgacgaagacggtatttcaaattatgatttaacatcaaacgaaactgttattgca
aatggaaacactggacttacatttagctaccataataatttagcagatgctgaagcgagt
acaaacgcaatagcagtgccaacagattacgatggaggtacacaaacaatttatgtaaga
gcagaaagtaacgatggttgttttgaaacagctacatttgatttagactttggtatttca
ccaagtataagtttcgatacagatgtattatatgaagtatgtccaaatgctacatcccca
atttcggtaacagcaataggagataattttgttgagagtgatgtaacaatcacttggtat
aacgaaggcgtattagtaccaggtcaaacaagtttaactattaataatgtattaacatca
ggtacttacacgatagaggttatgtttaaccaaagtggttgtacatctagcgaaagtata
tttgtagatgagttagaaacttgtgttataccacaaggaatctcaccagatggcgatggt
ttaaatgataattttgatttaagcagtttcgatgttcaaagtttacaaatatttaataga
aatggtcgtatggtttacgagaagacaaactataaagatgaatggcacggtcaatcttta
gatggcgatgagctaccagtaggaacctattattacgtaatgaactaccaaggcaataaa
acaaaagccgcatgggtatatattaatagagcaaactaa

DBGET integrated database retrieval system